Ero sivun ”Radonin terveysvaikutukset” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
(→‎Laskenta: ehkä laskee oikein. Pitää varmistaa)
Ei muokkausyhteenvetoa
 
(20 välissä olevaa versiota samalta käyttäjältä ei näytetä)
Rivi 1: Rivi 1:
[[op_en:Health impacts of radon in Finland]]
[[op_en:Health impacts of radon in Finland]]
[[Luokka:Radon]]
[[Luokka:Indikaattori]]
[[Luokka:Ympäristöterveys]]
[[Luokka:Sisältää R-koodia]]
[[Luokka:Sisältää R-koodia]]


{{muuttuja|moderaattori=Jouni}}
{{arviointi|moderaattori=Jouni}}


== Kysymys ==
== Kysymys ==
Rivi 17: Rivi 20:
== Vastaus ==
== Vastaus ==


[[File:Keuhkosyöpä radon ja tupakka Suomessa.png|thumb|400px|Keuhkosyövät Suomessa riippuen erilaisista politiikkatoimista. Mallissa oletetaan vaikutuksen tulevan ilman viivettä.]]
Radonin kokonaistautitaakka näyttäisi olevan 1973 DALY /vuosi (ks. [[Tautitaakka Suomessa]] ja [[SETURI/TEKAISU: Sisäilman radonin tautitapausmäärä ja tautitaakka arviot]]
Radonin kokonaistautitaakka näyttäisi olevan 1973 DALY /vuosi (ks. [[Tautitaakka Suomessa]] ja [[SETURI/TEKAISU: Sisäilman radonin tautitapausmäärä ja tautitaakka arviot]]


Kuinka suuri on radonin ja tupakan yhteisvaikutus?
STUKin mukaan ne asunnot, joissa radonpitoisuus on yli 300 Bq/m3,  johtavat arviolta 65-80 keuhkosyöpätapaukseen vuodessa. Näistä pelkän radonin aiheuttamia on  noin kymmenen tapausta (loput: radon + tupakka).  Tämän verran siis vähenisivät tapaukset , jos kaikki 300 Bq/m3 ylitykset korjattaisiin tasolle 0 Bq/m3.
* Riippumaton: BoD = Tr + Tt - T(r ja t)
 
* Additiivinen: BoD = BG * RRr * RRt
Jos yli 300 Bq/m3 radonpitoisuudet korjataan tasolle 300 Bq/m3, vähenevät keuhkosyöpätapaukset noin 25-40 tapauksella vuodessa (näistä  3- 5 keuhkosyöpää on pelkän radonin aiheuttamaa).
* Multiplikatiivinen: BoD > BG * RRr * RRt
* Yhteisvaikutus: jotain muuta vai mikä tahansa noista?


Jossa
Arvioinnissa on otettu huomioon 300 Bq/m3 ylittävän väestön altistusarvion epätarkkuus 95% luottamusvälillä (10%). Kaikkien radonin (tai radon+tupakka) aiheuttamien keuhkosyöpien määrä, 300 kpl vuodessa, on oletettu tässä arvioinnissa tarkaksi, vaikka vaihteluväli onkin 100 – 600 tapausta. Eli näihin lukuihin täytyy suhtautua lähinnä suuntaa antavina.{{ratkaisulinkki|Keskustelua radontorjunnasta}}
* BoD: burden of disease eli tautitaakka
* T: tapausmäärä (ilmoitettuna DALYina)
* r: radon
* t: tupakka
* BG: taustariski


Ne asunnot, joissa radonpitoisuus on yli 300 Bq/m3, johtavat arviolta 65-80 keuhkosyöpätapaukseen vuodessa. Näistä pelkän radonin aiheuttamia on  noin kymmenen tapausta (loput:  radon + tupakka). Tämän verran siis vähenisivät tapaukset , jos kaikki 300 Bq/m3 ylitykset korjattaisiin tasolle 0 Bq/m3.
Mallinnustulosten mukaan näyttää siltä, että kokonaiskeuhkosyöpään vaikuttaminen on paljon tehokkaampaa vähentämällä tupakointia kuin vähentämällä korkeita radonpitoisuuksia asunnoissa. Kuitenkaan arviointi ei (vielä) sisällä lainkaan kustannustehokkuuslaskelmia. Ne saattavat osoittaa monet radontoimet tehokkaiksi, vaikka niiden kokonaisvaikutus olisikin pieni. Esimerkiksi Isossa-Britanniassa tehty arvio osoitti, että uusien rakennusten radontorjunta on kustannustehokasta vaikka radonpitoisuudet olisivat pienemmät kuin Suomessa. (Gray et al., BMJ 2009)


Jos yli 300 Bq/m3 radonpitoisuudet korjataan tasolle 300 Bq/m3, vähenevät keuhkosyöpätapaukset noin 25-40 tapauksella vuodessa (näistä  3- 5 keuhkosyöpää on pelkän radonin aiheuttamaa).
Tarkempi vastaus löytyy tästä esityksestä: {{#l:Näkökulmia radonhaitan torjuntaan.pptx}}


Arvioinnissa on otettu huomioon 300 Bq/m3 ylittävän väestön altistusarvion epätarkkuus 95% luottamusvälillä (10%). Kaikkien radonin (tai radon+tupakka) aiheuttamien keuhkosyöpien määrä, 300 kpl vuodessa, on oletettu tässä arvioinnissa  tarkaksi, vaikka vaihteluväli onkin 100 – 600 tapausta. Eli näihin lukuihin täytyy suhtautua lähinnä suuntaa antavina.{{ratkaisulinkki|Keskustelua radontorjunnasta}}
==Perustelut==


Toimenpiteitä radonin tautitaakan pienentämiseksi?
Toimenpiteitä radonin tautitaakan pienentämiseksi?
Rivi 60: Rivi 57:
* Kansalaisia ja erityisesti lapsia on suojeltava altisteilta, jonka määrään ei voi itse vaikuttaa.
* Kansalaisia ja erityisesti lapsia on suojeltava altisteilta, jonka määrään ei voi itse vaikuttaa.


{{#l:Näkökulmia radonhaitan torjuntaan.pptx}}
=== Päätösvaihtoehdot===
 
Tähän mennessä vaikutusmallissa tarkastellut päätökset ovat seuraavat:
* Pitoisuus lasketaan 400:aan Bq/m3, jos se ylittyy.
* Pitoisuus lasketaan 200:aan Bq/m3, jos se ylittyy.
* Tupakointi vähenee viisi prosenttia.
 
Kustannuksia ei ole (vielä) tarkasteltu.


==Perustelut==
HUOM! Tässä alla on vasta luonnosteltu päätöksiä toteutettavaksi päätöstaulun avulla. Nykyisessä malliversiossa päätökset  on kuitenkin toteutettu suoraan koodissa.


Vastaus on alustava, ja malli pitäisi tarkistaa ennen kuin vankkoja päätelmiä tehdään. Kehityskohteita:
<t2b name='Päätökset' index='Decision maker,Decision,Option,Variable,Cell,Change' obs='Value' desc='Description' unit='-'>
* Maakuntien ja kuntien yhdistäminen pitäisi tehdä jotenkin älykkäästi skräpätystä datasta eikä tässä koodissa.
Valtio|Radontoimi|BAU|exposurenew|Pollutant:Radon|Multiply|1|Business as usual
* Itä-Uudenmaan kunnat voisi korjata näin: out$Kunta[out$Kunta %in% c("Mäntsälä", "Pornainen", "Porvoo", "etc", "", "", "")] <- "Itä-Uusimaa"
Valtio|Radontoimi|Radontalkoot|exposurenew|Pollutant:Radon|Multiply|0.5|Raju vähennys
* Radonpitoisuudet pitää sämplätä maakunnittain, ei kunnittain kuten nyt. Pienillä ännän arvoilla tulee isoja eroja kuntien välille, mutta se on pelkkää harhaa.
</t2b>
* Epävarmuudet voiti ottaa  myös annosvasteisiin.
* Pitoisuusjakaumat voisi toteuttaa oikeasti jakaumina olettaen esim. lognormaalijakauman epävarmoilla parametreilla joka maakuntaan. Nyt kuvaajiin tulee harhaisia piikkejä. Jos olisi alkuperäisdata, niin voisi tehdä pikku Bayes-mallin.
* Kartan piirtäminen ja muutamat muut jutut voisi tehdä funktioiksi ja pistää jollekin järkevälle sivulle, josta ne inkludeerataan tähän.
* Miksi yksikköriski näyttää tosi isolta, mutta kun summataan yli koko väestön, talo*tupakointikohtaiset luvut näyttävät tosi pieniltä.
* Pitäisi katsoa, onko puuttuvia arvoja, jotka mergatessa slaissaavat dataa pois.
* Satunnaistaminen pitäisi tehdä sellaisissa vaiheissa, että se olisi nopeaa.
* Miten pitäisi käsitellä asuntojen radonpitoisuuksien vaihtelu vs. epävarmuus syöpäriskistä? Meneekö 2DMC liian raskaaksi ja onko siitä vastaavaa hyötyä? Voiko saman toteuttaa 1DMC:na siten, että haluttu epävarmuus käsitellään vaihteluna eri tavalla kuin muut?


===Laskenta===
===Laskenta===
Rivi 80: Rivi 77:
*[http://www.cookbook-r.com/Graphs/Axes_%28ggplot2%29/ Axis formatting] (e.g. log2 format)
*[http://www.cookbook-r.com/Graphs/Axes_%28ggplot2%29/ Axis formatting] (e.g. log2 format)
* vaikutusrr poistettu kokonaan toistaiseksi, koska se ei toimi. Löytyy [http://fi.opasnet.org/fi_wiki/index.php?title=Radonin_terveysvaikutukset&oldid=21810 vanhasta versiosta].
* vaikutusrr poistettu kokonaan toistaiseksi, koska se ei toimi. Löytyy [http://fi.opasnet.org/fi_wiki/index.php?title=Radonin_terveysvaikutukset&oldid=21810 vanhasta versiosta].
* [http://fi.opasnet.org/fi_wiki/index.php?title=Toiminnot:RTools&id=ZwJAb7oPkq9jc74V Tolkullinen versio]
* [http://fi.opasnet.org/fi_wiki/index.php?title=Toiminnot:RTools&id=1HDgsHm1MW86iAYY Perusajo 100 iteraatiolla] (kesti 55 min! Yhdellä iteraatiolla kesti 50 s.)


<rcode graphics=1 embed=0 variables="
<rcode graphics=1 embed=0 variables="
name:N|default:1|
name:N|default:1|
name:erottelu1|description:Minkä tekijän mukaan haluat erotella terveysvasteen (x-akseli)?|type:selection|
options:
'Tupakoija';Tupakoija;
'Talotyyppi';Talotyyppi;
'Sukupuoli';Sukupuoli;
'Maakunta';Maakunta|
default:'Maakunta'|
name:erottelu2|description:Minkä toisen tekijän mukaan haluat erotella terveysvasteen (väri)?|type:selection|
options:
'Altiste';Altiste;
'Tupakoija';Tupakoija;
'Talotyyppi';Talotyyppi;
'Sukupuoli';Sukupuoli;
'Maakunta';Maakunta|
default:'Altiste'|
name:verbose|description:Haluatko nähdä välivaiheet?|type:selection|options:FALSE;En;TRUE;Kyllä|default:FALSE
name:verbose|description:Haluatko nähdä välivaiheet?|type:selection|options:FALSE;En;TRUE;Kyllä|default:FALSE
">
">
N <- 1
erottelu1 <- 'Maakunta'
erottelu2 <- 'Causes'
verbose <- FALSE
library(OpasnetUtils)
library(OpasnetUtils)
library(ggplot2)
library(ggplot2)
rm(radonpit, disincidence, exposure, envir = openv)
################################## YLEISET OSIOT


openv.setN(N)
openv.setN(N)


objects.latest('Op_en6007', code_name = 'answer') # [[OpasnetUtils/Drafts]] fetches fillna function.
objects.latest('Op_en6007', code_name = 'answer') # [[OpasnetUtils/Drafts]] fetches fillna function.
objects.latest('Op_en2261', code_name = 'initiate') # [[op_en:Health impact assessment]] ovariables totcases, AF.
objects.latest('Op_fi2761', code_name = 'alusta') # [[Talotyypit Suomessa]], ovariable asunnot, asuntovaesto.
objects.latest('Op_fi3907', code_name = 'alusta') # [[Suomen kunnat]], ovariable kunnat.
objects.latest('Op_fi2759', code_name = 'alusta') # [[Radon sisäilmassa]], ovariable radonpit, data.frame radon.
objects.latest('Op_fi3912', code_name = 'alusta') # [[Syöpäkuolleisuus Suomessa]], ovariable syopakuolleisuus.
######################## TAPAUSKOHTAISET SÄÄDÖT
####### PÄÄTÖKSET
#DecisionTableParser(opbase.data("Op_fi2760.paatokset"))


###### OSA 1: VÄESTÖ
###### OSA 1: VÄESTÖ


### ASUNTOVÄESTÖ
### ASUNTOVÄESTÖ
objects.latest('Op_fi2761', code_name = 'alusta') # [[Talotyypit Suomessa]], ovariable asunnot, asuntovaesto.


# Yksinkertaista talotyyppiluokittelua ja summaa taloista pois perhekoko.
# Yksinkertaista talotyyppiluokittelua ja summaa taloista pois perhekoko.
Rivi 128: Rivi 124:


asuntovaesto <- oapply(EvalOutput(asuntovaesto), cols = "Asuntokunta", FUN = sum)
asuntovaesto <- oapply(EvalOutput(asuntovaesto), cols = "Asuntokunta", FUN = sum)
### KUNNAT
objects.latest('Op_fi3907', code_name = 'alusta') # [[Suomen kunnat]], ovariable kunnat.


### TUPAKOINTI JA ALUEVASTAAVUUS
### TUPAKOINTI JA ALUEVASTAAVUUS
Rivi 154: Rivi 146:
### VÄESTÖN LASKENTA
### VÄESTÖN LASKENTA


väestö <- Ovariable("väestö",  
population <- Ovariable("population",  
dependencies = data.frame(Name = c("kunnat", "asuntovaesto", "aluevastaavuus", "tupakointi")),
dependencies = data.frame(Name = c("kunnat", "asuntovaesto", "aluevastaavuus", "tupakointi")),
formula = function(...) {
formula = function(...) {
Rivi 164: Rivi 156:
)
)


###### OSA 2: RISKISUHTEET
########## OSA 2: ALTISTUS


### ALTISTUS
bgexposure <- 0 # Radonille voisi olla 5.
 
frexposed <- 1 # Altistuneiden osuus.


# RADON
# RADON


objects.latest('Op_fi2759', code_name = 'alusta') # [[Radon sisäilmassa]], ovariable radonpit, data.frame radon.
radon$Pollutant <- "Radon" # Uusi sarake kuvaamaan sitä, minkä altisteen altistumisesta tai riskistä on kyse ko. rivillä.
 
radon$Altiste <- "Radon" # Uusi sarake kuvaamaan sitä, minkä altisteen altistumisesta tai riskistä on kyse ko. rivillä.




Rivi 178: Rivi 170:


tupakkaaltistus <- Ovariable("tupakkaaltistus",  
tupakkaaltistus <- Ovariable("tupakkaaltistus",  
data = data.frame(Tupakoija = c("Kyllä", "Ei"), Altiste = "Tupakka", Result = c(1, 0))
data = data.frame(Tupakoija = c("Kyllä", "Ei"), Pollutant = "Tupakka", Result = c(1, 0))
)
)


Rivi 185: Rivi 177:
radonpit <- EvalOutput(radonpit, N = N)
radonpit <- EvalOutput(radonpit, N = N)


altistus <- Ovariable("altistus",  
exposure <- Ovariable("exposure",  
dependencies = data.frame(Name = c("tupakkaaltistus", "radonpit")),
dependencies = data.frame(Name = c("tupakkaaltistus", "radonpit")),
formula = function(...) {
formula = function(...) {
Rivi 197: Rivi 189:
}
}
)
)
###### OSA 3: RISKISUHTEET


### SUHTEELLINEN RISKI
### SUHTEELLINEN RISKI
Rivi 204: Rivi 198:
ERF <- Ovariable("ERF", data = data.frame(
ERF <- Ovariable("ERF", data = data.frame(
Primaaripaikka = "Keuhkot, henkitorvi", # ICD.10.koodi == "C33-34"
Primaaripaikka = "Keuhkot, henkitorvi", # ICD.10.koodi == "C33-34"
Altiste = c("Radon", "Tupakka"),  
Pollutant = c("Radon", "Tupakka"),  
Result = c(1.0016, 20)
Result = c(1.0016, 20)
))
))


tausta.altistus <- 0 # Radonille voisi olla 5.
# Laskemalla takaperin STUKin syysuhdetaulukosta saadaan tupakan riskisuhteeksi 7.5. Tässä kuitenkin käytetään isompaa.
# [[Tiedosto:Näkökulmia radonhaitan torjuntaan.pptx]]


### SYÖPÄKUOLLEISUUS
### SYÖPÄKUOLLEISUUS


objects.latest('Op_fi3912', code_name = 'alusta') # [[Syöpäkuolleisuus Suomessa]], ovariable syopakuolleisuus.
disincidence <- syopakuolleisuus
disincidence@name <- "disincidence"
disincidence@data <- disincidence@data[disincidence@data$Primaaripaikka == "Keuhkot, henkitorvi" , ]
# ICD.10.koodi == "C33-34"
 
###################### ACTUAL MODEL
 
AF <- EvalOutput(AF)
 
casescen <- Ovariable("casescen",
dependencies = data.frame(Name = c(
"population",
"totcases",
"AF",
"ERF",
"exposure",
"bgexposure"
)),
formula = function(...) {


syopakuolleisuus@data <- syopakuolleisuus@data[syopakuolleisuus@data$Primaaripaikka == "Keuhkot, henkitorvi" , ]
pop <- unkeep(population, sources = TRUE, prevresults = TRUE)
# ICD.10.koodi == "C33-34"
disbg <- AF * totcases / pop
disbg@output <- disbg@output[!is.nan(result(disbg)) & ! grepl("\\+", disbg@output$Causes) , ]
disbg <- unkeep(disbg, cols = c("Tupakoija", "Causes"))


###### OSA 3: TAUTIKUORMA
RR <- unkeep(exp(log(ERF) * (exposure - bgexposure)), sources = TRUE, prevresults = TRUE)
RR <- oapply(RR, cols = "Pollutant", FUN = prod)
casescen <- disbg * pop * RR


### ARVIO PERUSTUEN POPULATION ATTRIBUTABLE FRACTIONIIN
return(casescen)
# Tässä oletetaan, että riskisuhteiden avulla voidaan suoraan laskea eri teijöiden osuus tautikuormasta.
}
# Luku on yliarvio, koska jokainen altiste lasketaan ikään kuin muita altisteita ei olisi tautia aiheuttamassa.
)
# Etuna on, että jokaiselle altisteelle saadaan arvio erikseen.


#vaestoosuus <- 1
exposurebau <- exposure # Tallennetaan nykyaltistus ennen kuin siihen aletaan tehdä skenaariomuutoksia.


#temp3 <- unkeep(väestö, cols = c("Maakunta", "Sairaanhoitopiiri"), sources = TRUE, prevresults = TRUE)
exposure <- exposure * EvalOutput(Ovariable("Policy", data = data.frame(
#vaestoosuus <- temp3 / sum(result(temp3 * 1))
Radonleikkaus = c("BAU", "Yli 400 leikataan", "Yli 200 leikataan"),  
Result = 1
)))


# Tässä on tarkoituksena jakaa tautiriski keisien lukumäärinä väestössä niin pieniin osiin kuin se on mahdollista ilman altistustietoa.
result(exposure) <- ifelse(
väestö <- unkeep(EvalOutput(väestö), sources = TRUE, prevresults = TRUE) # cols = c("Kunta", "Maakunta"),
exposure@output$Radonleikkaus == "Yli 400 leikataan" &
syopakuolleisuus <- unkeep(EvalOutput(syopakuolleisuus), sources = TRUE, prevresults = TRUE)
exposure@output$Pollutant == "Radon" &
takeout <- setdiff(colnames(väestö@output)[väestö@marginal], colnames(syopakuolleisuus@output)[syopakuolleisuus@marginal]) # Väestön ne indeksit, jotka EIVÄT OLE tautiriskissä.
result(exposure) > 400,
#takeout <- c("Tupakoija", "Talotyyppi")
400,
väestö@output <- dropall(väestö@output)
result(exposure)
väestöb <- oapply(väestö, cols = takeout, FUN = sum) # Summaa väestö niin että vain tautiriskin indeksit jäävät.
)
väestöb@output <- väestöb@output[!is.na(result(väestöb)) , ]
oprint(head(väestöb@output))
keisitb <- syopakuolleisuus * väestöb # Keisien kokonaismäärä tautiriskin määräämissä soluissa.


oprint(head(keisitb@output))
result(exposure) <- ifelse(
ERF <- EvalOutput(ERF)
exposure@output$Radonleikkaus == "Yli 200 leikataan" &
altistus <- EvalOutput(altistus)
exposure@output$Pollutant == "Radon" &
result(exposure) > 200,
200,
result(exposure)
)


RR <- unkeep(exp(log(ERF) * (altistus - tausta.altistus)), prevresults = TRUE, sources = TRUE)  
exposure <- exposure * EvalOutput(Ovariable("Policy2", data = data.frame(
Tupakkarajoitus = c("BAU", "5 % vähenemä tupakoinnissa"),  
Result = 1
)))


oprint(head(RR@output))
result(exposure) <- ifelse(
exposure@output$Tupakkarajoitus == "5 % vähenemä tupakoinnissa" &
exposure@output$Pollutant == "Tupakka",
result(exposure) * 0.95,
result(exposure)
)


# pci sisältää solukohtaiset altistutiedot ja niiden aiheuttaman lisäriskin. Niinpä yleisemmän tason keisimäärät voidaan pilkkoa pienempiin osiin.
ggplot(exposure@output, aes(x = Radonleikkaus, y = Result)) + geom_boxplot() + labs(y = "Radonpitoisuus (Bq/m3)")
# Ensin on poistettava turhat indeksit: Maakunta on turha, koska Kunta on annettu.
# Sen sijaan Sairaanhoitopiiri tarvitaan linkkaamaan tieto keisitb:hen.
pci <- unkeep(väestö * RR, prevresults = TRUE, sources = TRUE) # [[Population attributable fraction]]


# Sitten pilkotaan yli niiden indeksien, jotka vaikuttavat keisien sijoittumiseen alaryhmiin ja joita ei vielä
# huomioida tautiriskissä. Näitä ovat Tupakoija ja Talotyyppi eli näissä keisit eivät jakaudu väestön suhteessa.
pci <- pci / oapply(pci, cols = c(takeout, "Altiste"), FUN = sum) #INDEX = pci@output[c("Tupakoija", "Talotyyppi", "Altiste")], FUN = sum)


keisit <- keisitb * pci # tautiriskin keisit pitää jakaa kaikkiin niihin ryhmiin, joissa tätä tietoa ei vielä ole eli takeoutin määrittämiin ryhmiin.
casescen <- EvalOutput(casescen)


out <- Ovariable("out",  
ggplot(casescen@output, aes(x = Tupakkarajoitus, weight = casescenResult / N, fill = Radonleikkaus)) + geom_bar(position = "dodge") +
dependencies = data.frame(Name = c("ERF", "altistus", "tausta.altistus", "väestö", "keisit")),
labs(y = "Keuhkosyöpäkuolemia (Lung ca deaths) (#/a)") + theme_gray(base_size = 24)
formula = function(...) {


# Aluksi laske RR ja poista turhat (kun ovariablea operoidaan itsensä kanssa, ylimääräiset sarakkeet aiheuttavat harmia)
RR <- unkeep(exp(log(ERF) * (altistus - tausta.altistus)), prevresults = TRUE, sources = TRUE)
PAF <- (RR - 1) / RR


altisteet <- unique(altistus@output$Altiste)
####################### OUTPUT GRAPHS AND TABLES
altisteet <- levels(altisteet)[altisteet]


out <- 1
attrcases <- totcases * AF
for(i in 1:length(altisteet)) {
# Yksittäisen altisteen attributable fraction yhdistetään kaikkien altisteiden yhteis-PAFiin, johon tulee
# 2^n riviä (n = altisteiden lukumäärä). Altiste on joko + tai - riippuen aiheuttiko se havaitun taudin vai ei.
temp <- Ovariable(data = data.frame(
Altiste = altisteet[i],
Temp1 = c(paste(altisteet[i], "-", sep = ""), paste(altisteet[i], "+", sep = "")),
Result = c(-1, 1) # Altisteen syyttömyyttä merkataan tilapäisesti negatiivisella luvulla.
))
temp <- temp * PAF


# Syyttömät eli negatiiviset altisteet saavat loput (1-p) selitysosuudesta p.
oprint(head(attrcases@output))
result(temp) <- ifelse(result(temp) > 0, result(temp), 1 + result(temp))
# Syyllisen osuus 0 merkkautuu ykköseksi. Täytyy korjata.
result(temp) <- ifelse(result(temp) == 1 & grepl("\\+", temp@output$Temp1), 0, result(temp))
# temp <- unkeep(temp, prevresults = TRUE, sources = TRUE)
out <- out * temp
out <- unkeep(out, cols = "Altiste", sources = TRUE, prevresults = TRUE)
if(i == 1) {
colnames(out@output)[colnames(out@output) == "Temp1"] <- "Causes"
} else {
out@output$Causes <- paste(out@output$Causes, out@output$Temp1)
out@output$Temp1 <- NULL
}
}


out <- keisit * out
ggplot(attrcases@output, aes(weight = Result / N, x = Causes, fill = Talotyyppi)) + geom_bar(position = 'stack') + labs(y = "Keuhkosyöpäkuolemia (lung cancer deaths) (#/a)")


return(out)
ggplot(attrcases@output, aes(weight = Result / N, x = Causes, fill = Tupakoija)) +
}
geom_bar(position = 'stack') + labs(y = "Keuhkosyöpäkuolemia (lung cancer deaths) (#/a)")
)


out <- EvalOutput(out)
ggplot(attrcases@output, aes(weight = Result / N, x = Causes, fill = Maakunta)) +
geom_bar(position = 'stack') + labs(y = "Keuhkosyöpäkuolemia (lung cancer deaths) (#/a)")


oprint(head(out@output))
ggplot(attrcases@output, aes(weight = Result / N, x = Tupakoija, fill = Talotyyppi)) + geom_bar(position = "dodge") +
theme_grey(base_size = 24) + labs(title = "Tapauksia vuodessa")


ggplot(out@output, aes(weight = outResult / N, x = Causes, fill = Talotyyppi)) +
ggplot(population@output, aes(x = Talotyyppi, weight = populationResult, fill = Tupakoija)) + geom_bar() +  
geom_bar(position = 'dodge')
theme_grey(base_size = 24) + labs(title = "Väestö")


ggplot(out@output, aes(weight = outResult / N, x = Causes, fill = Tupakoija)) +
ggplot(exposurebau@output[exposure@output$Pollutant == "Radon" , ], aes(x = exposureResult, colour = Talotyyppi)) + geom_density(adjust = 4, size = 1) + labs(title = "Radonpitoisuuden jakauma talotyypeittäin")
geom_bar(position = 'dodge')


ggplot(out@output, aes(weight = outResult / N, x = Causes, fill = Maakunta)) +
ggplot(radonpit@output, aes(x = Maakunta, y = radonpitResult, fill = Talotyyppi)) + geom_boxplot() + coord_flip(ylim = c(0, 1000)) + labs(y = "Radonpitoisuus (Radon concentration) (Bq/m3)")
geom_bar(position = 'stack')


if(verbose) {
if(verbose) {
cat("Väestö\n")
cat("Väestö\n")
print(nrow(väestö@output))
print(nrow(population@output))
oprint(head(väestö@output))
oprint(head(population@output))
cat("Kunnat\n")
cat("Kunnat\n")
print(nrow(kunnat@output))
print(nrow(kunnat@output))
Rivi 337: Rivi 326:


cat("Altistus\n")
cat("Altistus\n")
print(nrow(altistus@output))
print(nrow(exposure@output))
oprint(head(altistus@output))
oprint(head(exposure@output))


cat("ERF\n")
cat("ERF\n")
Rivi 348: Rivi 337:


cat("Syöpäkuolleisuus\n")
cat("Syöpäkuolleisuus\n")
print(nrow(syopakuolleisuus@output))
print(nrow(disincidence@output))
oprint(head(syopakuolleisuus@output), digits = 6)
oprint(head(disincidence@output), digits = 6)


cat("Kokonaisvaikutus PAF-menetelmällä\n")
cat("Kokonaisvaikutus\n")
print(nrow(vaikutuspaf@output))
print(nrow(attrcases@output))
oprint(head(vaikutuspaf@output))
oprint(head(attrcases@output))
 
cat("Syyosuudet\n")
print(nrow(AF@output))
oprint(head(AF@output))
}
}


ograph(RR, x = erottelu1, fill =  erottelu2, title = 'Suhteellinen yksilöriski altistumattomaan verrattuna') + coord_trans(y = 'log2')
## POISTETTIIN KOKO KUNTAKARTTATOIMINNALLISUUS, KOSKA JOTKIN OSAT OVAT VANHENTUNEET. ON HELPOMPI RAKENTAA


ograph(RR, x = "Tupakka", fill = "Altiste") + coord_trans(y = 'log2')


ggplot(vaikutuspaf@output, aes(weight = vaikutuspafResult, x = Tupakka, fill = Talotyyppi)) + geom_bar(position = "dodge") +
theme_grey(base_size = 24) +
labs( # label names
title = "Vaikutus PAF-menetelmällä"
)


#ggplot(vaikutusrr@output, aes(weight = vaikutusrrResult, x = Tupakka, fill = Talotyyppi)) + geom_bar(position = "dodge") +
# Tämän laskennan on tarkoitus palauttaa altistustieto riskimuuttujaan. Mutta mieti parempi toteutus. Entä sisällyttäminen
# theme_grey(base_size = 24) +
# attributable fractioniin (AF)?
# labs( # label names
 
# title = "Vaikutus RR-menetelmällä"
#rad <- exposure * EvalOutput(Ovariable(data = data.frame(Pollutant = "Radon"  , Result = 1)))
# )
#tup <- exposure * EvalOutput(Ovariable(data = data.frame(Pollutant = "Tupakka", Result = 1)))
#
#tup <- unkeep(tup, cols = c("Pollutant", "exposureResult", "radonpitResult"))
#rad <- unkeep(rad, cols = c("Pollutant", "exposureResult", "tupakkaaltistusResult"))
#temp <- totrisk * tup * rad * 0
#temp@output$tupakkaaltistusResult <- as.factor(temp@output$tupakkaaltistusResult)
#ggplot(temp@output, aes(x = radonpitResult, y = totriskResult, colour = tupakkaaltistusResult)) + geom_point() + #scale_x_log10() + scale_y_log10()


ggplot(väestö@output, aes(x = Talotyyppi, weight = väestöResult)) + geom_bar() + labs(title = "Väestö")
#### hirisk on alaryhmä, jolla henkilökohtainen riski on erityisen suuri. Huom1 Tämä EI OLE väestöpainotettu otos,  
# vaan perusyksikkönä on väestöryhmä. Ilmeisesti tämän takia painottuvat pienet alueet, jossa satunnaistaminen
# voi saada aikaan isoja riskejä.


ggplot(altistus@output[altistus@output$Altiste == "Radon" , ], aes(x = altistusResult, fill = Talotyyppi)) + geom_density(alpha = 0.2)
#hirisk <- totrisk
#hirisk@output <- hirisk@output[result(hirisk) > 1E-5 , ]
#nrow(totrisk@output)
#nrow(hirisk@output)
#summary(hirisk@output)


## POISTETTIIN KOKO KUNTAKARTTATOIMINNALLISUUS, KOSKA JOTKIN OSAT OVAT VANHENTUNEET. ON HELPOMPI RAKENTAA ALUSTA UUDESTAAN.
#ggplot(totrisk@output, aes(x = Maakunta, y = totriskResult * 1E6, fill = Tupakoija)) + geom_boxplot(point = 1) +
#labs(title = "Keuhkosyöpäriski maakunnittain", y = "Kuoleman riski (Risk of death) (micromort/a)") + coord_flip(ylim = c(-2, 50))


</rcode>
</rcode>
Rivi 382: Rivi 382:
===Riippuvuudet===
===Riippuvuudet===


* [[Talotyypit Suomessa]]
* [[:op_en:OpasnetUtils/Drafts]] fillna function.
* [[Suomen kunnat]]
* [[:op_en:Health impact assessment]] ovariablet totcases, attrcases.
* [[Radon sisäilmassa]]
* [[Talotyypit Suomessa]], ovariablet asunnot, asuntovaesto.
* [[Suomen kunnat]], ovariable kunnat.
* [[Radon sisäilmassa]], ovariable radonpit, data.frame radon.
* [[Syöpäkuolleisuus Suomessa]], ovariable syopakuolleisuus.
* Päivittäin tupakoivien osuus Suomessa: Tupakoivat [http://www.stat.fi/til/tup/2009/tup_2009_2010-12-22_tie_001.html]
* Päivittäin tupakoivien osuus Suomessa: Tupakoivat [http://www.stat.fi/til/tup/2009/tup_2009_2010-12-22_tie_001.html]
* Tupakan annosvaste: UK: päivittäin tupakoivia 22 % Miehet, 20 % Naiset. Tämä aiheuttaa 88 % ja 84 % keuhkosyövistä vastaavasti. [http://info.cancerresearchuk.org/cancerstats/causes/lifestyle/tobacco/] Tämän perusteella voidaan laskea riskisuhde RR = AF / (EF(RR-1)+1), missä AF on attributable fraction eli altisteen aiheuttama osuus koko tautikuormasta ja EF on altistuneiden osuus koko väestöstä. Tämän perusteella päivittäisen tupakoinnin riskisuhteeksi keuhkosyövälle saadaan 20 - 30. (Laskennassa käytetään 20:tä.)
* Tupakan annosvaste: UK: päivittäin tupakoivia 22 % Miehet, 20 % Naiset. Tämä aiheuttaa 88 % ja 84 % keuhkosyövistä vastaavasti. [http://info.cancerresearchuk.org/cancerstats/causes/lifestyle/tobacco/] Tämän perusteella voidaan laskea riskisuhde RR = AF / (EF(RR-1)+1), missä AF on attributable fraction eli altisteen aiheuttama osuus koko tautikuormasta ja EF on altistuneiden osuus koko väestöstä. Tämän perusteella päivittäisen tupakoinnin riskisuhteeksi keuhkosyövälle saadaan 20 - 30. (Laskennassa käytetään 20:tä.)
* [[Syöpäkuolleisuus Suomessa]]
* [[:en:Attributable risk#Combined_PAR]]
* [[:en:Attributable risk#Combined_PAR]]
* [[:op_en:Population attributable fraction]]
* [[:op_en:Population attributable fraction]]
* [[:op_en:OpasnetUtils/Drafts]]
 
; Sivuja, joissa on mahdollisesti mallissa käytettävää tietoa
* [[:op_en:Burden of disease in Finland]]


==Katso myös==
==Katso myös==


{{Ympäristöterveysindikaattori}}
* Elvira Vaclavik Bräuner • Claus E. Andersen • Helle P. Andersen • Peter Gravesen • Morten Lind • Kaare Ulbak • Ole Hertel • Joachim Schüz • Ole Raaschou-Nielsen. Is there any interaction between domestic radon exposure and air pollution from traffic in relation to childhood leukemia risk? Cancer Causes Control (2010) 21:1961–1964 DOI 10.1007/s10552-010-9608-4
* [http://www.stuk.fi/sateily-ymparistossa/radon/kartat/fi_FI/radon-koko-suomi/ Suomen radonkartta]
* [http://www.cookbook-r.com/Graphs/Axes_%28ggplot2%29/ Scale graph axes]
* [http://books.google.fi/books?id=Z3vjT9ALxHUC Rothman, Greenland, Lash. Modern Epidemiology 2008], s. 295-297
* Alastair Gray, Simon Read, Paul McGale, and Sarah Darby. Lung cancer deaths from indoor radon and the cost effectiveness and potential of policies to reduce them.  BMJ. 2009: : a3110. Published online Jan 6, 2009. doi:  10.1136/bmj.a3110. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2769068/] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19129154 Comment]
* Darby S, Hill D, Auvinen A, Barros-Dios JM, Baysson H, Bochicchio F, Deo H, Falk R, Forastiere F, Hakama M, Heid I, Kreienbrock L, Kreuzer M, Lagarde F, Mäkeläinen I, Muirhead C, Oberaigner W, Pershagen G, Ruano-Ravina A, Ruosteenoja E, Rosario AS, Tirmarche M, Tomásek L, Whitley E, Wichmann HE, Doll R. Radon in homes and risk of lung cancer: collaborative analysis of individual data from 13 European case-control studies. BMJ. 2005 Jan 29;330(7485):223. Epub 2004 Dec 21.[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15613366]
* Darby S, Hill D, Deo H, Auvinen A, Barros-Dios JM, Baysson H, Bochicchio F, Falk R, Farchi S, Figueiras A, Hakama M, Heid I, Hunter N, Kreienbrock L, Kreuzer M, Lagarde F, Mäkeläinen I, Muirhead C, Oberaigner W, Pershagen G, Ruosteenoja E, Rosario AS, Tirmarche M, Tomásek L, Whitley E, Wichmann HE, Doll R. Residential radon and lung cancer--detailed results of a collaborative analysis of individual data on 7148 persons with lung cancer and 14,208 persons without lung cancer from 13 epidemiologic studies in Europe. Scand J Work Environ Health. 2006;32 Suppl 1:1-83.[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16538937]
* Simonato L1, Agudo A, Ahrens W, Benhamou E, Benhamou S, Boffetta P, Brennan P, Darby SC, Forastiere F, Fortes C, Gaborieau V, Gerken M, Gonzales CA, Jöckel KH, Kreuzer M, Merletti F, Nyberg F, Pershagen G, Pohlabeln H, Rösch F, Whitley E, Wichmann HE, Zambon P. Lung cancer and cigarette smoking in Europe: an update of risk estimates and an assessment of inter-country heterogeneity. Int J Cancer. 2001 Mar 15;91(6):876-87.[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11275995]
* [http://www.stuk.fi/julkaisut_maaraykset/kirjasarja/fi_FI/kirjasarja2/_files/12222632510021039/default/kirja2_4.pdf Radon sisäilmassa] (STUK)[http://www.stuk.fi/julkaisut_maaraykset/kirjasarja/fi_FI/kirjasarja2/_files/12222632510021035/default/kirja2_sisluettelo.pdf]
* [https://www.porvoo.fi/easydata/customers/porvoo2/files/muut_liitetiedostot/terveyspalvelut/terveydensuojelu/radontalkoiden_vaikuttavuus_-_raportti_2012.pdf Radontalkoiden vaikuttavuus Itä-Uudellamaalla]
* [http://www.stuk.fi/sateily-ymparistossa/radon/korjaukset/fi_FI/korjaukset/ Radonkorjausmenetelmien tehokkuus]
* [[:op_en:Health effects of radon in Europe]]
* James Milner et al. Home energy efficiency and radon related risk of lung cancer: modelling study. BMJ 2014; 348 doi: http://dx.doi.org/10.1136/bmj.f7493 (Published 10 January 2014). Cite this as: BMJ 2014;348:f7493 [http://www.bmj.com/content/348/bmj.f7493]
* Alistair Woodward. Cutting household ventilation to improve energy efficiency. BMJ 2014; 348 doi: [http://dx.doi.org/10.1136/bmj.f7713] (Published 10 January 2014). Cite this as: BMJ 2014;348:f7713
* [[:op_en:File:Cost effectiveness and health benefits of radon control strategies.pdf]]
* [[:op_en:File:Cost effectiveness and health benefits of radon control strategies.pdf]]
* [[Radonin terveysvaikutukset Euroopassa]]
* [[Radonin terveysvaikutukset Euroopassa]]
Rivi 413: Rivi 433:


<references/>
<references/>
==Aiheeseen liittyviä tiedostoja==
{{mfiles}}

Nykyinen versio 24. lokakuuta 2018 kello 02.21




Kysymys

Mitkä ovat radonin terveysvaikutukset Suomessa? Erityisesti pitäisi tarkastella näitä kysymyksiä:

  • Mikä on radonin kokonaistautitaakka?
  • Kuinka suuri on radonin ja tupakan yhteisvaikutus?
    • Onko kyseessä riippumaton, additiivinen, multiplikatiivinen tai yhteisvaikutus, ja mitä nämä tarkoittavat?
  • Miten radonin tautitaakka jakautuu erilaisissa asunnoissa asuvien kesken (esim. yli tai alle 300 Bq/m3)?
  • Mitä eri toimenpiteitä olisi mahdollista tehdä radonin tautitaakan pienentämiseksi?
    • Mitä muita vaikutuksia näillä toimepiteillä on (kustannukset, kiellot, elämäntapamuutokset, terveyssynergiat?)
  • Mitkä arvoarvostelmat määräävät sitä, mitkä toimepidevaihtoehdoista näyttäytyvät suositeltavina?

Vastaus

Keuhkosyövät Suomessa riippuen erilaisista politiikkatoimista. Mallissa oletetaan vaikutuksen tulevan ilman viivettä.

Radonin kokonaistautitaakka näyttäisi olevan 1973 DALY /vuosi (ks. Tautitaakka Suomessa ja SETURI/TEKAISU: Sisäilman radonin tautitapausmäärä ja tautitaakka arviot

STUKin mukaan ne asunnot, joissa radonpitoisuus on yli 300 Bq/m3, johtavat arviolta 65-80 keuhkosyöpätapaukseen vuodessa. Näistä pelkän radonin aiheuttamia on noin kymmenen tapausta (loput: radon + tupakka). Tämän verran siis vähenisivät tapaukset , jos kaikki 300 Bq/m3 ylitykset korjattaisiin tasolle 0 Bq/m3.

Jos yli 300 Bq/m3 radonpitoisuudet korjataan tasolle 300 Bq/m3, vähenevät keuhkosyöpätapaukset noin 25-40 tapauksella vuodessa (näistä 3- 5 keuhkosyöpää on pelkän radonin aiheuttamaa).

Arvioinnissa on otettu huomioon 300 Bq/m3 ylittävän väestön altistusarvion epätarkkuus 95% luottamusvälillä (10%). Kaikkien radonin (tai radon+tupakka) aiheuttamien keuhkosyöpien määrä, 300 kpl vuodessa, on oletettu tässä arvioinnissa tarkaksi, vaikka vaihteluväli onkin 100 – 600 tapausta. Eli näihin lukuihin täytyy suhtautua lähinnä suuntaa antavina.R↻

Mallinnustulosten mukaan näyttää siltä, että kokonaiskeuhkosyöpään vaikuttaminen on paljon tehokkaampaa vähentämällä tupakointia kuin vähentämällä korkeita radonpitoisuuksia asunnoissa. Kuitenkaan arviointi ei (vielä) sisällä lainkaan kustannustehokkuuslaskelmia. Ne saattavat osoittaa monet radontoimet tehokkaiksi, vaikka niiden kokonaisvaikutus olisikin pieni. Esimerkiksi Isossa-Britanniassa tehty arvio osoitti, että uusien rakennusten radontorjunta on kustannustehokasta vaikka radonpitoisuudet olisivat pienemmät kuin Suomessa. (Gray et al., BMJ 2009)

Tarkempi vastaus löytyy tästä esityksestä: Näkökulmia radonhaitan torjuntaan

Perustelut

Toimenpiteitä radonin tautitaakan pienentämiseksi?

  • Radontuuletus kaikkiin uusiin rakennuksiin.
  • Radontuuletusvalmius kaikkiin uusiin rakennuksiin, tuuletus vain jos mittaus osoittaa korkeita pitoisuuksia.
  • Radontuuletus myös vanhoihin rakennuksiin.
  • Tupakointikielto.
  • Kansalaistiedotus.
  • Radonmittausten kannustaminen tiedolla tai rahallisella tuella.
  • Edellä mainittujen toimien kohdistaminen vain tupakoiviin.
  • Edellä mainittujen toimien kohdistaminen vain radonalueille.

Radontoimepiteiden muita kuin terveysvaikutuksia:

  • Kustannukset.
  • Kiellot ja itsemääräämisoikeus.
  • Elämäntapamuutokset.
  • Vaikutusten kohdistuminen erilaisena kansalaiseen, lähimmäiseen tai yhteiskuntaan.

Arvoarvostelmia:

  • Tautitaakkaa on pienennettävä.
  • Tautitaakkaa on pienennettävä kaikilla toimilla, jotka ovat halvempia kuin 10000 € / DALY (tai jokin muu raja).
  • Kansalaisten itsemääräämisoikeuteen ei saa puuttua.
  • Kansalaisia ja erityisesti lapsia on suojeltava altisteilta, jonka määrään ei voi itse vaikuttaa.

Päätösvaihtoehdot

Tähän mennessä vaikutusmallissa tarkastellut päätökset ovat seuraavat:

  • Pitoisuus lasketaan 400:aan Bq/m3, jos se ylittyy.
  • Pitoisuus lasketaan 200:aan Bq/m3, jos se ylittyy.
  • Tupakointi vähenee viisi prosenttia.

Kustannuksia ei ole (vielä) tarkasteltu.

HUOM! Tässä alla on vasta luonnosteltu päätöksiä toteutettavaksi päätöstaulun avulla. Nykyisessä malliversiossa päätökset on kuitenkin toteutettu suoraan koodissa.

Päätökset(-)
ObsDecision makerDecisionOptionVariableCellChangeValueDescription
1ValtioRadontoimiBAUexposurenewPollutant:RadonMultiply1Business as usual
2ValtioRadontoimiRadontalkootexposurenewPollutant:RadonMultiply0.5Raju vähennys

Laskenta

N:

Haluatko nähdä välivaiheet?:

+ Näytä koodi

Riippuvuudet

Sivuja, joissa on mahdollisesti mallissa käytettävää tietoa

Katso myös

Ympäristöterveysindikaattoreita
Altisteita

pienhiukkaset · radon · uimavesi

Tautitaakka-arvioita

tupakansavu · juomaveden mikrobit · otsoni · radon · formaldehydi · ruoan mikrobit · pienhiukkaset · lyijy · kosteusvauriot · kloorauksen sivutuotteet · metyylielohopea · fluoridi · häkä · bentseeni · dioksiini · ultraviolettisäteily · arseeni ·

Tietolähteitä

Syke · WHO · ECDC · Tilastokeskus · Eurostat ·

Viitteet