Ero sivun ”Pneumokokkirokotteen hankinta kansalliseen rokotusohjelmaan” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
Ei muokkausyhteenvetoa
(THL poistettu)
 
(112 välissä olevaa versiota 9 käyttäjän tekeminä ei näytetä)
Rivi 1: Rivi 1:
{{arviointi|moderaattori=Jouni}}
[[op_en:Tendering_process_for_pneumococcal_conjugate_vaccine]]
[[heande:Pneumokokkirokote]]
[[Pneumokokkirokotekysely|OSALLISTU PNEUMOKOKKIROKOTETTA KOSKEVAAN KYSELYYN TÄSTÄ]]
 
Tämä rokotehankintakeskustelu on toimitettu tiedoksi kansalliselle rokotusasiantuntijaryhmälle 8.9.2014.
 
{{tiivistelmä
|kysymys = Mitä vertailuperusteita pitäisi käyttää kansalliseen rokotusohjelmaan kuuluvan pikkulasten pneumokokkirokotteen hankinnassa? |vastaus = Tämän kysymyksen ratkaisemiseksi Opasnetissä käydään kesän 2014 aikana avoin keskustelu, jonka lopputulos esitellään
kansalliselle rokotussuositusasiantuntijaryhmälle (KRAR) ja sosiaali- ja terveysministeriön (STM) rokotehankintatyöryhmälle. Keskustelua käydään pääasiassa näistä kolmesta aiheesta omilla sivuillaan:
* [[Vertailuperusteet|Mitä tekijöitä pitäisi huomioida pneumokokkirokotteiden vertailussa]]?
* [[Epidemiologinen malli|Miten pitäisi arvioida pneumokokkirokotusohjelman terveysvaikutuksia]]?
* [[Taloudellinen arviointi|Miten pitäisi arvioida pneumokokkirokotusohjelman kustannusvaikuttavuutta]]?
 
Voit osallistua keskusteluun eri tavoilla:
# Kirjoittamalla kommenttisi sivun alalaidassa olevaan kommenttikenttään, jolloin moderaattori nostaa sen osaksi sivun sisältöä.
# Hankkimalla Opasnettiin käyttäjätunnuksen sivun oikeasta yläkulmasta ja osallistumalla itse keskustelusivujen muokkaukseen. Osallistumisessa on noudatettava [[Ohje:Ohje|näitä ohjeita]]. Joistakin asioista käydään jäsennettyä keskustelua [[Keskustelu|näiden ohjeiden]] mukaisesti.
# Vastaamalla [[pneumokokkirokotekysely|kyselyyn]] rokotteiden valintaperusteista. Kysely on rakennettu niin, ettei pneumokokista tarvitse tietää mitään erityistä.
 
Sinun kannattaa ensin tutustua sivustoon, jotta osaat kommentoida oikeaan kohtaan ja näet, onko joku muu jo nostanut esiin saman asian. Asioiden toistaminen on turhaa, koska vain yksi maininta joka asiasta jätetään sivulle. Samoin sivun aiheeseen liittymättömät kommentit poistetaan. Sen sijaan kaikki muu sisältö jätetään näkyviin keskustelun pohjaksi. Huomaa kuitenkin, että muut osallistujat saattavat yrittää todistella sinun näkemyksesi vääräksi; jos se onnistuu, näkemys ei päädy KRARille ja STM:lle annettavaan suositukseen.


== Rajaus ==
Lisätietoja [[Pneumokokki|pneumokokista]].
}}


=== Kysymys===
== Kysymys ==


Miten määrätään kansallisen rokotusohjelman pikkulasten pneumokokkirokotteen hankinnan laatukriteerit?
Mitä vertailuperusteita pitäisi käyttää kansalliseen rokotusohjelmaan kuuluvan pikkulasten pneumokokkirokotteen hankinnassa?


=== Rajaus ===
=== Rajaus ===


* Tarkastellaan pneumokokkikonjugaattirokotteen hankintaa pikkulasten rokotusohjelman osana.
* Tarkastellaan kansallisen rokotusohjelman pikkulasten [http://www.thl.fi/fi_FI/web/rokottajankasikirja-fi/pneumokokkikonjugaattirokotukset pneumokokkikonjugaattirokotuksia].  
* Rajataan ja perustellaan rokotteiden hankintaan vaikuttavat laadulliset kriteerit.
* Rajataan ja määritellään pneumokokkikonjugaattirokotteiden hankintaan vaikuttavat [[Vertailuperusteet|vertailuperusteet]].
* Keskustellaan hankintapäätöksen tueksi tehtävien epidemiologisen ja kustannus-vaikuttavuus -selvitysten perusteista.  
* Tavoitteena on määritellä tarjouskilpailun kokonaistaloudellinen valintaperuste.
* Lähtökohtana on tietämys myyntiluvallisten pneumokokkikonjugaattirokotteiden tehosta ja vaikuttavuudesta.
* Keskustellaan hankintapäätöstä varten tehtävän epidemiologisen ja taloudellisen arvioinnin perusteista.  
* Perustana on nykyinen tietämys pneumokokkikonjugaattirokotteiden tehosta ja vaikuttavuudesta.
* [http://www.finlex.fi/fi/laki/ajantasa/1987/19870395/#L4P20a Lääkelain 20a§]:n mukaan hankinnassa voidaan ottaa huomioon vain rokotteet, joilla on myyntilupa Suomessa.
* Valmisteltava hankinta on [http://www.finlex.fi/fi/laki/ajantasa/2007/20070348 julkisista hankinnoista annetun lain] mukainen.
* Tällä sivustolla käytävä keskustelu ei sido hankinnan valmistelua ja päätöstä.


=== Osallistujat ===
=== Osallistujat ===
* Avoimen päätöksentekokäytännön taitajat:
 
** Jouni Tuomisto (ohjaaja)
* Tämä on avoin arviointi. '''Kuka tahansa saa osallistua.''' Työtä ovat jäsentämässä myös:
** Teemu Rintala (mallintaja)
* Avoimen päätöksentekokäytännön taitajat, ohjaajana Jouni Tuomisto {{ratkaisulinkki|Työaikasuunnitelmat}}
** Pauli Orden (moderaattori)
* Rokoteasiantuntijat (Terveyden ja hyvinvoinnin laitos):
** Timo Koski (moderaattori)
** Matleena Tuomisto (moderaattori)
** Tuukka Hämynen (moderaattori)
** Julia Rintala (osa-aikainen moderaattori)
** Jaakko Örmälä (moderaattori)
** Vilma Sandström (osa-aikainen moderaattori)
* Rokoteasiantuntijat:
** Hanna Nohynek (vastaava tutkija)
** Hanna Nohynek (vastaava tutkija)
** Heini Salo  
** Heini Salo
** Terhi Kilpi
** Terhi Kilpi
** Pertti Sormunen
** Pertti Sormunen
** Kari Auranen
** Kari Auranen
** Tuija Leino
** Tuija Leino
** Simopekka Vänskä
** Markku Nurhonen
** Markku Nurhonen


=== Oletettu käyttö ja käyttäjät ===
=== Oletettu käyttö ja käyttäjät ===


Tämän työn tulosten odotetaan kehittävän jäsentynyttä, perusteltua ja kriittistä rokotekeskustelua Suomessa. Lisäksi se voi jatkossa auttaa rokotehankintoihin liittyviä päätösprosesseja. Tärkeimmät käyttäjät ovat:
Tämä sivusto edistää avointa, jäsentynyttä ja perusteltua rokotekeskustelua Suomessa. Lisäksi se auttaa kehittämään rokotehankintojen päätöksentekoa. Tärkeimmät käyttäjät ovat:
* THL
* [http://www.stm.fi/vireilla/tyoryhmat/rokotehankintatyoryhma Sosiaali- ja terveysministeriön rokotehankintatyöryhmä]
* Sosiaali- ja terveysministeriö
* [//www.thl.fi/fi_FI/web/rokottajankasikirja-fi/kansallinen-rokotusasiantuntijaryhma Kansallinen rokotusasiantuntijaryhmä]
* Lääke- ja rokoteteollisuusteollisuus
* Rokottamisesta vastaavat lääkärit ja hoitajat
* Lääke- ja rokoteteollisuus
* Kansainväliset rokotetutkijat
* Kansainväliset rokotetutkijat
* Kansalaiset
* Asiasta kiinnostuneet kansalaiset


== Vastaus ==


== Vastaus ==
Lähtökohtana oli seuraava ehdotus:
* Valintaperusteina ovat hinta ja hyöty (arvioitu vakavien pneumokokkitautien vähenemä koko väestössä).
* Turvallisuus ei ole perusteena, koska EU:n alueella tällä hetkellä myynnissä olevien pneumokokkikonjugaattirokotevalmisteiden välillä ei ole osoitettu turvallisuuseroa.


Työssä on ainakin seuraavat osat
Arvioinnin perusteena käytettiin epidemiologisen mallin pohjalta laadittuja laskelmia rokotteen käyttöönoton johdosta saavutetuista laatupainotetuista lisäelinvuosista ja säästetyistä hoitokustannuksista. Jos serotyyppiä 3 ei oteta huomioon täyden vaikuttavuuden omaavana rokoteserotyyppinä 13-valenttisessa rokotteessa, on ero 10- ja 13-valenttisen rokotteen välillä näissä laskelmissa vähäinen. Ottaen huomioon tämän eron suuruusluokka suhteessa käytettyyn malliin liittyvien epävarmuustekijöiden aiheuttamaan vaihteluun mallin tuottamissa ennusteissa, voidaan 10- ja 13-valenttisen rokotteen arvioida olevan vaikutuksiltaan samanarvoiset. Tällöin hinnan tulee olla määräävä valintakriteeri.
* Keskustelutilan luominen eli osakysymysten päättäminen ja sivujen luonti niille.  
* Keskustelutilan jatkuva seuraaminen ja häiriköinnin siivoaminen.
* [[Kommentointityökalu]]n seuraaminen ja kommenttien nosto varsinaiseen tekstiin. Tämä työkalu on niille jotka eivät halua kirjautua.
* [[Tägikone]] on työkalu tekstin jäsentämiseen ja asiasanoittamiseen. Se on koekäytössä.
* Varsinaisen keskustelun tueksi tuotettava taustamateriaali: wikistetään erilaisia rokotteeseen liittyviä yleisiä ja spesifisiä raportteja ja yhteenvetoja sen hyödyistä, haitoista ja tehosta. Tätä materiaalia voisi alkaa listata ja työstää jo nopeasti.
* Kustannus-hyötymallin toteutus R:llä JAGSilla.  
* Mallin parametritietojen kerääminen ja syöttäminen malliin.
* Päätösvaihtoehtojen kuvaaminen (suoraviivainen)
* Eri vaikutusten kuvaaminen ovariableina osana kausaalimallia. (Nämä lienevät pääosin tiedossa yleistasolla)
* Lopputuloksia koskevien arvojen kuvaaminen. Tämä on iso työ ja vaatii myös teoriapohdintaa siitä, käytetäänkö esim MCDAta tai kahdesta paremman valitsemista. Molemmat olisi kiinnostavin. Muitakin vaihtoehtoja voi harkita.
* Osallistujien kouluttaminen keskeisiin menetelmiin tarpeen mukaan. Näitä ovat [[Keskustelu]] ja [[:op_en:Modelling in Opasnet|Opasnet-mallinnus]].
* Päivitettyjen ohjeiden kirjoittaminen näistä menetelmistä. Menetelmien edelleen kehittäminen tämän hankkeen oppien perusteella.
 
=== Kustannukset ===
 
* Jouni Tuomisto: ohjaus ja avoimen päätöksentekokäytännön koordinointi: 3 htkk virkatyönä
* Opasnet-moderaattorit: 4.5 hlö * 3 kk * 150 h/kk * 12 e/h * 1.35 sivukulut = 32805 e (oletetaan maksimityöllisyys kaikille, vaikka moderaattorit tuskin työskentelevät täyspäiväisesti)
* R-mallinnus Opasnettiin: 1 hlö * 3 kk * 150 h/kk * 17 e/h * 1.35 sivukulut = 10328 e
* Rokoteasiantuntijatyö: 3 hlö * 1.5 kk virkatyönä
 
 
Vertailun vuoksi: LVMn [[Liikenne ja viestintä digitaalisessa Suomessa 2020]] on houkutellut viikossa toistakymmentä uutta käyttäjää ja n. 50000 merkkiä uutta tekstiä jäsennettäväksi.


== Perustelut ==
== Perustelut ==


=== Riippuvuudet ===
Tässä taulukossa on lueteltu arvioinnin olennaiset osat ja päätöksenteon taustat.
 
* Päätökset:
**
* Muuttujat:
** rokotuskattavuus
** rokotteen teho eri kantoihin
** rokotteen haittavaikutukset
** rokotteen hinta
** pneumokokin terveyshaitat: invasiivinen pneumokokki-infektio, välikorvantulehdus, aivokalvontulehdus
** rokotteen epäsuorat vaikutukset muiden kantojen ja bakteerien yleisyyteen
** rokotteen epäsuorat vaikutukset antibioottien tarpeeseen ja hoitokustannuksiin
** laumaimmuniteetti
* Arvot
** kustannustehokkuus
** sairauksien laatupainokertoimet ([[:op_en:Disability weights]])
** sairauksien, rokotteiden ja hoitojen nettikustannukset
** rokotehaittojen kohdistuminen (ei saisi tulla haittaa niille jotka eivät rokotteesta hyödy)
 
=== Korvautuminen ===
 
Pneumokokki eli ''Streptococcus pneumoniae'' -bakteeri on maailmanlaajuisesti merkittävä lapsikuolleisuuden aiheuttaja. Siksi toimiva pneumokokkibakteerin rokotusohjelma on kansanterveystyönä kustannustehokkaimpien joukossa. Imeväisten rokottamisessa on käytetty kolmea eri konjugaattirokotetta, jotka sisältävät joko 7, 10 tai 13 pneumokokkiserotyyppiä. Rokotteet ovat sekä vähentäneet pneumokokin aiheuttamien sairauksien haittoja että muuttaneet pneumokokkiserotyppien keskinäisiä kantajuusosuuksia.
 
Serotyyppien korvautumisella tarkoitetaan rokotteen sisältämien serotyyppien korvautumista niillä serotyypeillä, joita rokote ei sisällä. Rokotetussa väestössä korvautuminen on yleensä tapahtunut verrattain nopeasti rokotusohjelman aloittamisen jälkeen. Serotyyppien korvautuvuuden takia rokotteiden teho sairauden haittojen vähentämisessä on ollut odotettua heikompi. Nurhonen ja Auranen ovat rakentaneet mallin [http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1003477], joka kuvaa korvautuvuuden mekanismia rokotetussa väestössä. Mallin avulla voidaan laskea arvioita eri serotyyppikombinatioita vastaavien rokotteiden vaikutuksille pneumokokkitautien ilmaantuvuuteen väestössä ja tunnistaa ne serotyypit, joita nykyisiin rokotteisiin olisi hyödyllisintä lisätä invasiivisen pneumokokki-infektion välttämiseksi.
 
[[File:Korvautuvuuskuvaaja.png|thumb|center|600px|alt= kuvaaja rokotteen vaikutuksista|Pneumakokkien kantajuus (x-akselilla) ja sairastumistapaukset kantajuusepisodia kohden (y-akselilla) rokotteen serotyypeille (VT) ja serotyypeille joihin rokote ei vaikuta (NVT) ennen rokotusohjelmaa (kuvaaja A) ja sen jälkeen (kuva A). Sairastumistapaukset (DNVT ja DVT) ovat saatu kertomalla akseleiden arvot ja vastaavat kuvaajassa suorakulmion muotoisia alueita. Rokoteserotyyppien kantajuus on jaettu kolmeen osioon vastaamaan rokotteen vaikutuksia populaation kantajuuteen: (i) Rokotteen hävittämään kantajuuteen joka korvautuu uudella kantajuudella (VT*pq); (ii) rokotteen hävittämää kantajuuteen joka ei korvaudu uudella kantajuudella (VT*(1-p)q); (iii) ja kantajuuteen joka ei häviä rokotteen vaikutuksesta (VT*(1-q)). Tässä kaaviossa q kuvaa rokotteen hävittämää kantajuutta ja p kuvaa rokotteen hävittämää kantajuutta joka korvautuu uudella kantajuudella joka ei sisälly rokotteen serotyyppeihin. Tautitapausten määrä laskee hävinneen ja korvaavan kantajuuden sairastuttavuuden eroavuuden vuoksi. Tautihäviämä on (kuva B) merkitty sinisellä suorakulmiolla.]]


=== Wikistettävää aineistoa ===
{{pneumokokkirokote}}


* Tartuntataudit Suomessa 2012 [http://urn.fi/URN:ISBN:978-952-245-890-2] luku Invasiivinen pneumokokkitauti, ss. 30-32.
Rokotteiden vertailu perustuu hintaan ja hyötyyn (ks. [[Vertailuperusteet|vertailuperusteet]]). Epidemiologinen hyöty tarkoittaa arvioitua vakavien pneumokokkitapausten vähenemää, jos rokote otettaisiin kansalliseen rokotusohjelmaan. Arvio tehdään [[Epidemiologinen_malli|epidemiologisen mallin]] avulla. Rokotusohjelman vaikuttavuus määritellään epidemiologisen mallin antaman arvion perusteella terveyteen liittyvänä elämänlaadun muutoksena. Kustannusvaikuttavin rokotevalmiste valitaan [[Taloudellinen_arviointi|taloudellisen arvioinnin]] menetelmin.
{{comment|# |Tämä sama mutta vuoden 2013 materiaali (melkein sanasta samaan sama hieman eri arvoilla) on jo sivulla [[Pneumokokki#Pneumokokkitautien esiintyvyys]]. Tuossa oli tosin pari taulukkoa ja yksi graafi, jotka lisäsin samaan kohtaan. En tiedä, ovatko oikeassa paikassa, mutta siitä ne on helppo siirtää muualle, kun ovat wikimuodossa.|--[[Käyttäjä:Heta|Heta]] ([[Keskustelu käyttäjästä:Heta|keskustelu]]) 5. kesäkuuta 2014 kello 12.38 (UTC)}}
 
* Pneumokokki-konjugaattirokotteen vaikuttavuuden seuranta osana kansallista rokotusohjelmaa - Prosessikuvausasiakirja [http://urn.fi/URN:ISBN:978-952-245-653-3] Kokonaan
{{comment|# |Tein tämän sivulle [[Pneumokokkikonjugaattirokotteen vaikuttavuuden seuranta]]|--[[Käyttäjä:Heta|Heta]] ([[Keskustelu käyttäjästä:Heta|keskustelu]]) 5. kesäkuuta 2014 kello 13.33 (UTC)}}


=== Käytettäviä menetelmiä ===
=== Käytettäviä menetelmiä ===
 
{{arviointi|moderaattori=Jouni}}
* [[Avoin päätöksentekokäytäntö]], katso myös julkaisu Tuomisto, Pohjola, Pohjola: Avoin päätöksentekokäytäntö voisi parantaa tiedon hyödyntämistä. Yhteiskuntapolitiikka 79 (2014) 1: 66-75. [http://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2014031821621]
* [[Avoin päätöksentekokäytäntö]], katso myös julkaisu Tuomisto, Pohjola, Pohjola: Avoin päätöksentekokäytäntö voisi parantaa tiedon hyödyntämistä. Yhteiskuntapolitiikka 79 (2014) 1: 66-75. [http://urn.fi/URN:NBN:fi-fe2014031821621]
* [[Avoin arviointi]]
* [[Avoin arviointi]]
* [[Jaettu ymmärrys]]
* [[Jaettu ymmärrys]]
* [[Keskustelu]]
* [[:op_en:Portal:Modelling with Opasnet]]
* [[:op_en:Portal:Modelling with Opasnet]]
* [[Biopolttoainearvioinnit]] (esimerkki Opasnetistä)


=== Muuta aineistoa ===
== Katso myös ==
* [http://www.thl.fi/fi/-/avoin-keskustelu-pneumokokkirokotteen-hankintaperusteista-alkaa Avoin keskustelu pneumokokkirokotteen hankintaperusteista alkaa] THL:n verkkotiedote
*THL:n sivut:
**[http://www.thl.fi/fi_FI/web/rokottajankasikirja-fi/pneumokokkirokotukset Pneumokokkirokotukset]
**[http://www.thl.fi/fi/tutkimus-ja-asiantuntijatyo/hankkeet-ja-ohjelmat/pneumokokkikonjugaattirokotteen-vaikuttavuuden-arviointi/vakavan-pneumokokkitaudin-ipd-ilmaantuvuus-suomessa-serotyyppi-ja-ikaryhmittain Vakavan pneumokokkitaudin (IPD) ilmaantuvuus Suomessa]
**[http://www.thl.fi/fi/tutkimus-ja-asiantuntijatyo/hankkeet-ja-ohjelmat/pneumokokkikonjugaattirokotteen-vaikuttavuuden-arviointi Pneumokokkikonjugaattirokotteen vaikuttavuuden arviointi]
**[http://www.thl.fi/fi/web/infektiotaudit/taudit-ja-mikrobit/bakteeritaudit/pneumokokki Mikä on pneumokokki-infektio?]
**[http://www.thl.fi/fi/aiheet/tietopaketit/rokotetutkimus/tauti-ja-rokotekohtainen-tutkimus/pneumokokkirokotetutkimus Pneumokokkirokotetutkimus THL:ssä]
**[http://www.thl.fi/fi_FI/web/fi/tutkimus/hankkeet/finip FinIP-tutkimukset]


* [http://terho.thl.fi/wiki01/display/rohy/Other+disease+endpoints+than+IPD]
* [http://www.laakeinfo.fi/ Lääkeinfo.fi] ([http://www.laakeinfo.fi/Medicine.aspx?m=22290 Synflorix], [http://www.laakeinfo.fi/Medicine.aspx?m=23349 Prevenar 13])
* [http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1003477 Nurhonen, Auranen]: Optimal Serotype Compositions for Pneumococcal Conjugate Vaccination under Serotype Replacement
* [http://rokotetutkimus.fi/rokotteet/tutkittavat_rokotteet/Pneumokokkirokote.html Pneumokokkirokote Rokotetutkimuskeskuksen (TaY) sivuilla]
* [https://www3.thl.fi/wiki03/x/CAGqAQ Epidemiological modelling]
* Duodecim 2013: Lasten pneumokokkirokotukset – menestystarina alkanut myös Suomessa [https://www.julkari.fi/handle/10024/114507]
*Lotta Siiran väitöskirja (Clonality of Streptococcus pneumoniae in relation to antimicrobial resistance in Finland)  [http://www.julkari.fi/handle/10024/114673]


{{comment|# |Näistä vain keskimmäiseen pääsee thl:n ulkopuolelta käsiksi. Saisko nuo kaksi muuta ladattua tänne tai Heandeen?|--[[Käyttäjä:Teemu R|Teemu R]] ([[Keskustelu käyttäjästä:Teemu R|keskustelu]]) 4. kesäkuuta 2014 kello 10.48 (UTC)}}
* Kokousabstraktit ja -esitykset PCV-ohjelmasta: [http://terho.thl.fi/wiki01/display/pcv/Kokousabstraktit+ja+-esitykset+PCV-ohjelmasta] (suojattu sivu)
 
* [http://terho.thl.fi/wiki01/x/06tpB Avoin päätöksenteko rokotehankinnassa] (suojattu sivu)
* [http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0072088] keskustelusivulla mainittu toinen artikkeli. Relevantti?
* [https://www3.thl.fi/wiki03/x/CAGqAQ Epidemiological modelling] (suojattu sivu)
 
== Viitteet ==
=== Laskenta ===
* [http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1003477 Nurhonen M, Auranen K](2014) Optimal Serotype Compositions for Pneumococcal Conjugate Vaccination under Serotype Replacement. PLoS Computational Biology 10(2)
 
<references/>
R-program code for the replcement model as in  File S1 of
Nurhonen M, Auranen K: Optimal serotype compositions for pneumococcal conjugate vaccination under serotype replacement [[http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1003477]


== Aiheeseen liittyviä tiedostoja ==


==== Esimerkkejä ====
* {{#l:PCV_KVAraportti 2008_080414.pdf}} Kustannusvaikuttavuusarportti pneumokokkirokotteesta.


* VT: vaccine serotypes, i.e. pneumococcus serotypes that are found in a vaccine.
== Kommentoi ==
* NVT: non-vaccine serotypes, i.e. pneumococcus serotypes that are not found in the vaccine.
* [http://fi.opasnet.org/fi_wiki/index.php?title=Toiminnot:RTools&id=P6CXptUReneZ8YNh Example model run]


{{comment|# |Yritin selvittää kuinka alla oleva koodi toimii. Huomasin että vaihtaessa arvoja ajoon, niin vaikuttaisi siltä että  ajon tulokset eivät kuitenkaan muutu?  |--[[Käyttäjä:Jaakko|Jaakko]] ([[Keskustelu käyttäjästä:Jaakko|keskustelu]]) 5. kesäkuuta 2014 kello 14.13 (UTC)}}
Voit kommentoida näiden sivujen sisältöä. Tällä pääsivulla on kuitenkin vain lueteltu olennaiset asiat ja linkit, ja keskustelu käydään kutakin asiaa tarkemmin käsittelevällä sivulla. Seuraa siis linkkejä, lue ja osallistu.
{{comment|# |Taulukot vastaavat näköjään aina lähtömallia, joka on PCv13, mutta pylväskuviossa muutettu malli on mukana.| --[[Käyttäjä:Mnud|Markku N.]] ([[Keskustelu käyttäjästä:Mnud|keskustelu]]) 9. kesäkuuta 2014 kello 09.18 (UTC)}}
 
<rcode embed=1 graphics=1 variables="
name:q_user|description:Proportion of VT carriage removed by vaccination|default:1|
name:p_user|description:Proportion of VT carriage removed by vaccination that is replaced by NVT|default:1|
name:adultcarriers|description:The true amount of more than 5-year-old carriers is n times larger than estimated. What is n?|default:1|
name:servac_user|description:Serotypes in a vaccine to look at|type:checkbox|options:
'19F';19F;'23F';23F;'6B';6B;'14';14;'9V';9V;'4';4;'18C';18C;'1';1;'7';7;
'6A';6A;'19A';19A;'3';3;'8';8;'9N';9N;'10';10;'11';11;'12';12;'15';15;
'16';16;'20';20;'22';22;'23A';23;'33';33;'35';35;'38';38;'6C';6C;'Oth';Other|
default:'19F';'23F';'6B';'14';'9V';'4';'18C';'1';'7';'6A';'19A';'3'
">
library(OpasnetUtils)
library(ggplot2)
 
objects.latest("Op_fi4305", code_name = "alusta") # [[Pneumokokkirokote]]
objects.latest("Op_en6007", code_name = "answer") # [[OpasnetUtils/Drafts]]
 
openv.setN(100)
 
## Read the annual IPD and carriage incidence data.
## The 0 entries in IPD and carriage data are replaced by small values.
serotypes<-c(
"19F", "23F", "6B", "14", "9V", "4", "18C", "1", "7",
"6A", "19A", "3", "8", "9N", "10", "11", "12", "15",
"16", "20", "22", "23A", "33", "35", "38", "6C", "Oth")
car_under5<-c(
156030, 156030, 126990, 41200, 22290, 12830, 10130, 10, 14180,
54940, 24320, 12160, 1350, 20940, 4050, 72270, 10, 33100,
3380, 1350, 12160, 3380, 680, 30400, 4050, 27470, 24320 )
car_over5<-c(
168100, 314800, 256700, 209800, 114100, 62500, 200700, 100, 100,
158800, 54900, 30800, 8800, 8800, 20800, 97700, 100, 100,
191900, 25200, 72500, 22000, 100, 71300, 100, 79400, 330100 )
ipd_under5<-c(
7.78, 7.88, 24.39, 20.76, 2.91, 2.91, 6.64, 0.31, 3.02,
3.94, 9.88, 1.25, 0.10, 0.83, 0.41, 0.42, 0.21, 1.98,
0.21, 0.01, 0.93, 0.10, 0.42, 0.31, 0.42, 0.01, 0.73 )
ipd_over5<-c(
28.51, 53.72, 29.53, 99.43, 43.07, 76.99, 24.39, 6.58, 46.88,
17.42, 20.54, 55.04, 11.21, 25.20, 6.28, 12.76, 13.89, 9.18,
4.73, 3.29, 29.03, 4.40, 5.64, 12.41, 1.43, 5.50, 11.20 )
 
## Combine the data into 2 matrices of dimension 27*2:
IPD<-cbind(ipd_under5, ipd_over5)
Car<-cbind(car_under5, car_over5)
 
## Row numbers corresponding to the 3 different PCV formulations
## in matrices IPD and Car. Note: there is no serotype 5 in our data.
pcv7rows<-seq(7); pcv10rows<-seq(9); pcv13rows<-seq(12)
 
 
## Example S1.2A: Calculate the predicted incidence of IPD for the non-vaccine
## types(NVTs) under PCV13. The predictions are calculated separately for the
## two age classes. These are the values reported on the bottom panel in
## Figure 2 (there given as per 100K incidences).
postvacc <-Vaccination(IPD,Car,VT_rows=pcv13rows,p=1,q=1)
 
cat("Incidence of invasive pneumococcal disease after vaccination program (p=1, q=1).\n")
oprint(cbind(serotypes,postvacc[[1]]))
cat("Number of carriers after vaccination program.\n")
oprint(cbind(serotypes,postvacc[[2]]))
 
## Example S1.2B: Decrease in IPD incidence after adding a single new serotype
## to PCV13 separately for the two age categories.
next_under5<-NextVT(IPD[,1],Car[,1], VT_rows=pcv13rows,p=1)
next_over5 <-NextVT(IPD[,2],Car[,2], VT_rows=pcv13rows,p=1)
cat("Next serotype to add to a vaccine (p=1).\n")
oprint(rbind(serotypes, next_under5, next_over5))
# Nämä taulukot kannattaisi transposata niin näyttäisivät siistimmiltä.
 
## Example S1.3A: The optimal sequence for under 5 year olds when replacement is 100%.
## The output shows the decreases in IPD incidence for each step,
## corresponding to Figure 5(C). The last serotype (row 27, the category "Other")
## is excluded from any vaccine composition but is taken into account as a
## replacing serotype at each stage.
opt<-OptimalSequence(IPD[,1],Car[,1],VT_rows=0,Excluded_rows=27,p=1.0,HowmanyAdded=20)
 
cat("Optimal sequence of serotypes to add to a vaccine (p=1, HowmanyAdded=20).\n")
oprint(rbind(serotypes[opt[1,]],opt[2,]))
 
## Example S1.3B: The optimal sequence for the whole population when
## replacement is 50% and the current composition includes the PCV7 serotypes.
opt<-OptimalSequence(IPD,Car, VT_rows=pcv7rows,Excluded_rows=length(serotypes),
p=0.5,HowmanyAdded=17)
 
cat("Optimal sequence of serotypes to add to a vaccine (p=0.5, HownamyAdded=17).\n")
oprint(rbind(serotypes[opt[1,]],opt[2,]))
 
###################################
 
## Read the annual IPD and carriage incidence data.
## The 0 entries in IPD and carriage data are replaced by small values.
 
IPD <- Ovariable("IPD", ddata = "Op_fi4305.pneumokokki_vaestossa")
IPD@data <- IPD@data[IPD@data$Observation == "Incidence" , colnames(IPD@data) != "Observation"]
 
Car <- Ovariable("Car", ddata = "Op_fi4305.pneumokokki_vaestossa")
Car@data <- Car@data[Car@data$Observation == "Carrier" , colnames(Car@data) != "Observation"]
 
servac <- Ovariable("servac", data = data.frame(
Vaccine = rep(c("Current", "New"), each = length(serotypes)),
Serotype = serotypes,
Result = as.numeric(c(
serotypes %in% c("19F", "23F", "6B", "14", "9V", "4", "18C", "1", "7","6A", "19A", "3"),
serotypes %in% servac_user
))
))
 
p <- Ovariable("p", data = data.frame(Result = p_user))
q <- EvalOutput(Ovariable("q", data = data.frame(Result = q_user)))
# EvalOutput must be used because q is mentioned twice in the code and there will otherwise be a merge mismatch.
 
# The true number of adult carriers may actually be larger than estimated. This adjusts for that.
Car <- Car * Ovariable("adjust", data = data.frame(Age = c("Under 5", "Over 5"), Result = c(1, adultcarriers)))
 
VacCar <- EvalOutput(VacCar)
VacIPD <- EvalOutput(VacIPD)
 
cat("Number of carriers\n")
oprint(summary(VacCar))
cat("Incidence of invasive pneumococcal disease.\n")
oprint(summary(VacIPD))
 
if("Iter" %in% colnames(VacCar@output)) N <- max(VacCar@output$Iter) else N <- 1
 
ggplot(VacCar@output, aes(x = Serotype, weight = result(VacCar) / N, fill = Vaccine)) + geom_bar(position = "dodge") + theme_gray(base_size = 24) +
labs(title = "Carriers", y = "Number of carriers in Finland")
 
ggplot(VacIPD@output, aes(x = Serotype, weight = result(VacIPD) / N, fill = Vaccine)) + geom_bar(position = "dodge") + theme_gray(base_size = 24) +
labs(title = "Incidence of invasive pneumococcal disease", y = "Number of cases / 100000 py")
 
ggplot(VacIPD@output, aes(x = Vaccine, weight = result(VacIPD) / N, fill = Age)) + geom_bar(position = "stack") + theme_gray(base_size = 24) +
labs(title = "Incidence of invasive pneumococcal disease", y = "Number of cases / 100000 py")
 
</rcode>
 
=== Funktioiden alustus ===
 
<rcode name="alusta" label="Alusta funktiot" embed=1>
 
library(OpasnetUtils)
 
#S1.4. The R-functions
###############################################################################
##
## R code for the core methods introduced in
## Markku Nurhonen and Kari Auranen:
## "Optimal serotype compositions for pneumococcal conjugate
## vaccination under serotype replacement",
## PLoS Computational Biology, 2014.
##
###############################################################################
## List of arguments common to most functions:
##
## IPD = matrix of IPD incidences by age class (columns) and serotype (rows)
## Car = corresponding matrix of carriage incidences
## VT_rows = vector of the row numbers in matrices IPD and Car
## corresponding to vaccine types (VT_rows=0 for no vaccination)
## p = proportion of lost VT carriage which is replaced by NVT carriage
## q = proportion of VT carriage lost either due to elimination or replacement
##
## This code includes 4 functions:
## Vaccination, NextVT, OptimalSequence and OptimalVacc.
##
 
Vaccination<-function(IPD,Car,VT_rows,p,q) {
##
## Result:
## A list of 2 matrices: IPD and carriage incidences
## after vaccination (corresponding to matrices IPD and Car).
## [Markku Nurhonen 2013]
##
if (VT_rows[1]>0) {
IPD<-as.matrix(IPD); Car<-as.matrix(Car)
# Post vaccination carriage incidences
Car_Total<-t(matrix(apply(Car,2,sum),dim(Car)[2],dim(Car)[1]))
Car2<-Car; Car2[VT_rows,]<-0
Car_NVT<-t(matrix(apply(Car2,2,sum),dim(Car2)[2],dim(Car2)[1]))
Car_VT<-Car_Total-Car_NVT
CarNew<-q*(1+p*Car_VT/Car_NVT)*Car2+(1-q)*Car
# Post vaccination IPD incidences
NVT_rows<-seq(dim(IPD)[1])[-1*VT_rows]
# CCR=Case-to-carrier ratios
CCR<-IPD/Car ; IPDNew<-0*IPD
# Apply the equation appearing above
# equation (1) in text for each serotype.
# First term applies to NVTs.
IPDNew[VT_rows,]<-(1-q)*IPD[VT_rows,]
# Second term applies to NVTs.
IPDNew[NVT_rows,]<-((Car_NVT+p*q*Car_VT)*(Car/Car_NVT)*CCR)[NVT_rows,]
}
else {
IPDNew<-IPD; CarNew<-Car
}
list(IPDNew,CarNew)
}
 
NextVT<-function(IPD,Car,VT_rows,p) {
##
## Result:
## A vector of decreases in IPD due to adding a serotype
## to the vaccine. If VT_rows=0, initially no vaccination.
## For row indexes incuded in VT_rows, the result is 0.
## [Markku Nurhonen 2013]
##
IPD<-as.matrix(IPD); Car<-as.matrix(Car)
## VaccMat = IPD and Car matrices after vaccination
VaccMat<-Vaccination(IPD,Car,VT_rows,p,1)
IPD<-VaccMat[[1]]; Car<-VaccMat[[2]]
## Total_IPD,Total_Car = Matrices corresponding to
## overall IPD and carriage in each age class.
Total_IPD<-t(matrix(apply(IPD,2,sum),dim(IPD)[2],dim(IPD)[1]))
Total_Car<-t(matrix(apply(Car,2,sum),dim(Car)[2],dim(Car)[1]))
## Effect = decrease in IPD when one serotype is added to the vaccine.
## See equation (3) in text.
Effect<-(Total_IPD-IPD)*((IPD/(Total_IPD-IPD))-(p*Car/(Total_Car-Car)))
## Special case when only one NVT remains.
IPD_nonzero<-which(apply(IPD,1,sum)!=0)
if (length(IPD_nonzero)==1) {Effect[IPD_nonzero,]<-IPD[IPD_nonzero,]}
 
## Result is obtained after summation over age classes.
apply(Effect,1,sum)
}
 
OptimalSequence<-function(IPD,Car,VT_rows,Excluded_rows,p,HowmanyAdded) {
##
## Starting from VTs indicated by the vector VT_rows
## (VT_rows=0, for no vaccination) sequentially add new VTs
## to the vaccine composition s.t. at each step the optimal
## serotype (corresponding to largest decrease in IPD) is added.
##
## Excluded_rows = Vector of indexes of the rows in matrices
## IPD and Car corresponding to serotypes that are not to
## be included in a vaccine composition, e.g. a row
## corresponding to a group of serotypes labelled "Other".
## Enter Excluded_rows=0 for no excluded serotypes.
## HowmanyAdded = number of VTs to be added.
##
## Result:
## Matrix of dimension 2*HowmanyAdded with 1st row indicating
## the row numbers of added serotypes in the order they appear
## in the sequence. The 2nd row lists the decreases in IPD
## due to addition of each type. [Markku Nurhonen 2013]
##
IPD<-as.matrix(IPD); Car<-as.matrix(Car)
## First check the maximum possible number of added VTs.
VT_howmany<-length(VT_rows)
if (VT_rows[1]==0) {VT_howmany<-0}
Excluded_howmany<-length(Excluded_rows)
if (Excluded_rows[1]==0) {Excluded_howmany<-0}
HowmanyAdded<-min(HowmanyAdded,dim(IPD)[1]-(VT_howmany+Excluded_howmany))
BestVTs<-BestEffects<-rep(0,HowmanyAdded)
## Sequential procedure: at each step find the best additional VT.
for (i in 1:HowmanyAdded) {
## Effects = Decrease in IPD after addition of each serotype
Effects<-NextVT(IPD,Car,VT_rows,p)
## Set Effects for VTs and excluded types equal to small values
## so that none of these will be selected as the next VT.
minvalue<- -2*max(abs(Effects))
if (Excluded_howmany>0) {Effects[Excluded_rows]<-minvalue}
if (VT_rows[1]>0) {Effects[VT_rows]<-minvalue}
## BestVTs[i] = Index of serotype with maximum decrease in IPD.
BestVTs[i]<-order(-1*Effects)[1]
## BestEffects[i] = Decrese in IPD due to addition of BestVTs[i]
## to the vaccine.
BestEffects[i]<-Effects[BestVTs[i]]
VT_rows<-c(VT_rows,BestVTs[i])
if (VT_rows[1]==0) {VT_rows<-VT_rows[-1]}
VaccMat<-Vaccination(IPD,Car,VT_rows,p,1)
IPD<-VaccMat[[1]]; Car<-VaccMat[[2]]
}
t(matrix(c(BestVTs,BestEffects),HowmanyAdded,2))
}
 
OptimalVacc<-function(IPD,Car,VT_rows,p,q,HowmanyAdded) {
##
## Result:
## A list of 3 elements: (1) Row numbers of serotypes in the optimal
## vaccine composition (2)-(3) IPD and carriage incidences
## by serotype and age class corresponding to the optimal
## vaccine formed using the sequential procedure in the
## function OptimalSequence. [Markku Nurhonen 2013]
##
Additional_VTs<-OptimalSequence(IPD,Car,VT_rows,p,HowmanyAdded)[1,]
All_VTs<-c(VT_rows,Additional_VTs)
if (All_VTs[1]==0) All_VTs<-All_VTs[-1]
VaccMat<-Vaccination(IPD,Car,All_VTs,p,q)
list(All_VTs,VaccMat[[1]],VaccMat[[2]])
}
 
VacCar <- Ovariable("VacCar",
dependencies = data.frame(Name = c(
"IPD", # incidence of pneumococcus disease
"Car", # number of carriers of pneumococcus
"servac", # ovariable of serotypes in vaccine (1 for serotypes in a vaccine, otherwise result is 0)
"p", # proportion of eliminated VT carriage that is replaced by NVT carriage
"q" # proportion of of VT carriage eliminated by vaccine
)),
formula = function(...) {
## Result:
## An ovariable of carriage incidences
## after vaccination (corresponding to Car).
## [Markku Nurhonen 2013, Jouni Tuomisto 2014]
# Post vaccination carriage incidences
# Sum over serotypes and drop extra columns
Car_Total<- unkeep(oapply(Car, cols = "Serotype", FUN = sum) * 1, prevresults = TRUE)
# Car2 is a temporary ovariable with NVT carriers only
Car2 <- unkeep(Car * (1 - servac), prevresults = TRUE) # Take only NVT carriers
Car_NVT <- oapply(Car2, cols = "Serotype", FUN = sum) # Carriers of serotypes not in vaccine (NVT)
Car_VT <- Car_Total - Car_NVT # Carriers of vaccine serotypes
 
CarNew <- q * (1 + p * Car_VT / Car_NVT) * Car2 + (1 - q) * Car
 
return(CarNew)
}
)
VacIPD <- Ovariable("VacIPD",
dependencies = data.frame(Name = c(
"IPD", # incidence of pneumococcus disease
"Car", # number of carriers of pneumococcus
"servac", # ovariable of serotypes in vaccine (1 for serotypes in a vaccine, otherwise result is 0)
"p", # proportion of eliminated VT carriage that is replaced by NVT carriage
"q" # proportion of of VT carriage eliminated by vaccine
)),
formula = function(...) {
## Result:
## An ovariable of IPD incidence
## after vaccination (corresponding to ovariable IPD).
## [Markku Nurhonen 2013, Jouni Tuomisto 2014]
# Post vaccination carriage incidences (same code as in VacCar)
Car_Total <- unkeep(oapply(Car, cols = "Serotype", FUN = sum) * 1, prevresults = TRUE) # Sums over serotypes
Car2 <- unkeep(Car * (1 - servac), prevresults = TRUE)
Car_NVT <- oapply(Car2, cols = "Serotype", FUN = sum) # Carriers of serotypes not in vaccine (NVT)
Car_VT <- Car_Total - Car_NVT # Carriers of vaccine serotypes
CarNew <- q * (1 + p * Car_VT / Car_NVT) * Car2 + (1 - q) * Car
# Post vaccination IPD incidences
# CCR=Case-to-carrier ratios
CCR <- IPD / Car
 
# Apply the equation appearing above
# equation (1) in text for each serotype.
# First term applies to VTs.
IPDNewVT <- (1 - q) * IPD * servac
 
# Second term applies to NVTs.
IPDNewNVT <- (Car_NVT + p * q * Car_VT) * (Car / Car_NVT) * CCR * (1 - servac)
 
IPDNew <- IPDNewVT + IPDNewNVT
 
return(IPDNew)
}
)
 
objects.store(Vaccination, NextVT, OptimalSequence, OptimalVacc, VacCar, VacIPD)
 
cat("Funktiot Vaccination, NextVT, OptimalSequence, OptimalVacc sekä ovariablet VacCar, VacIPD tallennettu. \n")
 
</rcode>
 
=== Data ===
 
Pneumokokin esiintyvyys suomalaisessa väestössä. Carrier: (oireettomien) kantajien lukumäärä, Incidence: invasiivisen pneumokokkitaudin ilmaantuvuus 100000 henkilövuotta kohti.
 
<t2b name='Pneumokokki väestössä' index='Serotype,Age,Observation' locations='Carrier,Incidence' unit='#, #/100000py'>
19F|Under 5|156030|7.78
23F|Under 5|156030|7.88
6B|Under 5|126990|24.39
14|Under 5|41200|20.76
9V|Under 5|22290|2.91
4|Under 5|12830|2.91
18C|Under 5|10130|6.64
1|Under 5|10|0.31
7|Under 5|14180|3.02
6A|Under 5|54940|3.94
19A|Under 5|24320|9.88
3|Under 5|12160|1.25
8|Under 5|1350|0.1
9N|Under 5|20940|0.83
10|Under 5|4050|0.41
11|Under 5|72270|0.42
12|Under 5|10|0.21
15|Under 5|33100|1.98
16|Under 5|3380|0.21
20|Under 5|1350|0.01
22|Under 5|12160|0.93
23A|Under 5|3380|0.1
33|Under 5|680|0.42
35|Under 5|30400|0.31
38|Under 5|4050|0.42
6C|Under 5|27470|0.01
Oth|Under 5|24320|0.73
19F|Over 5|168100|28.51
23F|Over 5|314800|53.72
6B|Over 5|256700|29.53
14|Over 5|209800|99.43
9V|Over 5|114100|43.07
4|Over 5|62500|76.99
18C|Over 5|200700|24.39
1|Over 5|100|6.58
7|Over 5|100|46.88
6A|Over 5|158800|17.42
19A|Over 5|54900|20.54
3|Over 5|30800|55.04
8|Over 5|8800|11.21
9N|Over 5|8800|25.2
10|Over 5|20800|6.28
11|Over 5|97700|12.76
12|Over 5|100|13.89
15|Over 5|100|9.18
16|Over 5|191900|4.73
20|Over 5|25200|3.29
22|Over 5|72500|29.03
23A|Over 5|22000|4.4
33|Over 5|100|5.64
35|Over 5|71300|12.41
38|Over 5|100|1.43
6C|Over 5|79400|5.5
Oth|Over 5|330100|11.2
</t2b>
 
== Katso myös ==
 
* [[Biopolttoainearvioinnit]]
* [http://terho.thl.fi/wiki01/x/06tpB Avoin päätöksenteko rokotehankinnassa] (suojattu sivu)
* Duodecim 2013: Lasten pneumokokkirokotukset – menestystarina alkanut myös Suomessa [https://www.julkari.fi/handle/10024/114507]
* [http://www.thl.fi/fi_FI/web/rokottajankasikirja-fi/pneumokokkirokotukset THL:n sivu pneumokokkirokotteesta]
* [http://terho.thl.fi/wiki01/x/Dg2GAg Pneumokokkiohjelman vaikuttavuusarviointi] (suojattu sivu)
* [http://www.thl.fi/fi_FI/web/fi/tutkimus/hankkeet/pnc-vaikuttavuus/vakavan_pneumokokkitaudin_ilmaantuvuus Vakavan pneumokokkitaudin ilmaantuvuus Suomessa]
* [http://www.thl.fi/fi_FI/web/fi/tutkimus/hankkeet/finip FinIP-tutkimukset]
 
== Viitteet ==
 
<references/>

Nykyinen versio 11. joulukuuta 2019 kello 16.54

OSALLISTU PNEUMOKOKKIROKOTETTA KOSKEVAAN KYSELYYN TÄSTÄ

Tämä rokotehankintakeskustelu on toimitettu tiedoksi kansalliselle rokotusasiantuntijaryhmälle 8.9.2014.

Pääviesti
Kysymys:

Mitä vertailuperusteita pitäisi käyttää kansalliseen rokotusohjelmaan kuuluvan pikkulasten pneumokokkirokotteen hankinnassa?

Vastaus:

Tämän kysymyksen ratkaisemiseksi Opasnetissä käydään kesän 2014 aikana avoin keskustelu, jonka lopputulos esitellään kansalliselle rokotussuositusasiantuntijaryhmälle (KRAR) ja sosiaali- ja terveysministeriön (STM) rokotehankintatyöryhmälle. Keskustelua käydään pääasiassa näistä kolmesta aiheesta omilla sivuillaan:

Voit osallistua keskusteluun eri tavoilla:

  1. Kirjoittamalla kommenttisi sivun alalaidassa olevaan kommenttikenttään, jolloin moderaattori nostaa sen osaksi sivun sisältöä.
  2. Hankkimalla Opasnettiin käyttäjätunnuksen sivun oikeasta yläkulmasta ja osallistumalla itse keskustelusivujen muokkaukseen. Osallistumisessa on noudatettava näitä ohjeita. Joistakin asioista käydään jäsennettyä keskustelua näiden ohjeiden mukaisesti.
  3. Vastaamalla kyselyyn rokotteiden valintaperusteista. Kysely on rakennettu niin, ettei pneumokokista tarvitse tietää mitään erityistä.

Sinun kannattaa ensin tutustua sivustoon, jotta osaat kommentoida oikeaan kohtaan ja näet, onko joku muu jo nostanut esiin saman asian. Asioiden toistaminen on turhaa, koska vain yksi maininta joka asiasta jätetään sivulle. Samoin sivun aiheeseen liittymättömät kommentit poistetaan. Sen sijaan kaikki muu sisältö jätetään näkyviin keskustelun pohjaksi. Huomaa kuitenkin, että muut osallistujat saattavat yrittää todistella sinun näkemyksesi vääräksi; jos se onnistuu, näkemys ei päädy KRARille ja STM:lle annettavaan suositukseen.

Lisätietoja pneumokokista.


Kysymys

Mitä vertailuperusteita pitäisi käyttää kansalliseen rokotusohjelmaan kuuluvan pikkulasten pneumokokkirokotteen hankinnassa?

Rajaus

  • Tarkastellaan kansallisen rokotusohjelman pikkulasten pneumokokkikonjugaattirokotuksia.
  • Rajataan ja määritellään pneumokokkikonjugaattirokotteiden hankintaan vaikuttavat vertailuperusteet.
  • Tavoitteena on määritellä tarjouskilpailun kokonaistaloudellinen valintaperuste.
  • Keskustellaan hankintapäätöstä varten tehtävän epidemiologisen ja taloudellisen arvioinnin perusteista.
  • Perustana on nykyinen tietämys pneumokokkikonjugaattirokotteiden tehosta ja vaikuttavuudesta.
  • Lääkelain 20a§:n mukaan hankinnassa voidaan ottaa huomioon vain rokotteet, joilla on myyntilupa Suomessa.
  • Valmisteltava hankinta on julkisista hankinnoista annetun lain mukainen.
  • Tällä sivustolla käytävä keskustelu ei sido hankinnan valmistelua ja päätöstä.

Osallistujat

  • Tämä on avoin arviointi. Kuka tahansa saa osallistua. Työtä ovat jäsentämässä myös:
  • Avoimen päätöksentekokäytännön taitajat, ohjaajana Jouni Tuomisto R↻
  • Rokoteasiantuntijat (Terveyden ja hyvinvoinnin laitos):
    • Hanna Nohynek (vastaava tutkija)
    • Heini Salo
    • Terhi Kilpi
    • Pertti Sormunen
    • Kari Auranen
    • Tuija Leino
    • Markku Nurhonen

Oletettu käyttö ja käyttäjät

Tämä sivusto edistää avointa, jäsentynyttä ja perusteltua rokotekeskustelua Suomessa. Lisäksi se auttaa kehittämään rokotehankintojen päätöksentekoa. Tärkeimmät käyttäjät ovat:

Vastaus

Lähtökohtana oli seuraava ehdotus:

  • Valintaperusteina ovat hinta ja hyöty (arvioitu vakavien pneumokokkitautien vähenemä koko väestössä).
  • Turvallisuus ei ole perusteena, koska EU:n alueella tällä hetkellä myynnissä olevien pneumokokkikonjugaattirokotevalmisteiden välillä ei ole osoitettu turvallisuuseroa.

Arvioinnin perusteena käytettiin epidemiologisen mallin pohjalta laadittuja laskelmia rokotteen käyttöönoton johdosta saavutetuista laatupainotetuista lisäelinvuosista ja säästetyistä hoitokustannuksista. Jos serotyyppiä 3 ei oteta huomioon täyden vaikuttavuuden omaavana rokoteserotyyppinä 13-valenttisessa rokotteessa, on ero 10- ja 13-valenttisen rokotteen välillä näissä laskelmissa vähäinen. Ottaen huomioon tämän eron suuruusluokka suhteessa käytettyyn malliin liittyvien epävarmuustekijöiden aiheuttamaan vaihteluun mallin tuottamissa ennusteissa, voidaan 10- ja 13-valenttisen rokotteen arvioida olevan vaikutuksiltaan samanarvoiset. Tällöin hinnan tulee olla määräävä valintakriteeri.

Perustelut

Tässä taulukossa on lueteltu arvioinnin olennaiset osat ja päätöksenteon taustat. Tämä rokotehankintakeskustelu toimitettiin tiedoksi kansalliselle rokotusasiantuntijaryhmälle 8.9.2014.

Pneumokokkirokotteen hankinta kansalliseen rokotusohjelmaan
Arvioinnin osat

ROKOTEKYSELY - VASTAA TÄSTÄ · Rokotteen vertailuperusteet · Epidemiologinen malli · Taloudellinen arviointi

Englanninkieliset sivut

Tendering process for pneumococcal conjugate vaccine · Comparison criteria for vaccine · Epidemiological modelling · Economic assessment

Taustatietoa

Pneumokokki · Työjärjestys · Pneumokokkirokotevalmisteet · Kansallinen rokotusohjelma · Pneumokokkikonjugaattirokotteen vaikuttavuuden seuranta · Korvautuminen · Viitteet · Herkkyysanalyysi(Tal.arv.) · Rokotesanasto · Pneumokokkirokotteen turvallisuus

Tulosta: Koko materiaali · Pneumokokkirokotekysely


Rokotteiden vertailu perustuu hintaan ja hyötyyn (ks. vertailuperusteet). Epidemiologinen hyöty tarkoittaa arvioitua vakavien pneumokokkitapausten vähenemää, jos rokote otettaisiin kansalliseen rokotusohjelmaan. Arvio tehdään epidemiologisen mallin avulla. Rokotusohjelman vaikuttavuus määritellään epidemiologisen mallin antaman arvion perusteella terveyteen liittyvänä elämänlaadun muutoksena. Kustannusvaikuttavin rokotevalmiste valitaan taloudellisen arvioinnin menetelmin.

Käytettäviä menetelmiä


Katso myös

Viitteet

  • Nurhonen M, Auranen K(2014) Optimal Serotype Compositions for Pneumococcal Conjugate Vaccination under Serotype Replacement. PLoS Computational Biology 10(2)


Aiheeseen liittyviä tiedostoja

Kommentoi

Voit kommentoida näiden sivujen sisältöä. Tällä pääsivulla on kuitenkin vain lueteltu olennaiset asiat ja linkit, ja keskustelu käydään kutakin asiaa tarkemmin käsittelevällä sivulla. Seuraa siis linkkejä, lue ja osallistu.

Noudettu kohteesta ”https://fi.opasnet.org/index.php?title=Pneumokokkirokotteen_hankinta_kansalliseen_rokotusohjelmaan&oldid=36228”