Massadata kansanterveyden edistämisessä

Kohteesta Opasnet Suomi
Versio hetkellä 29. toukokuuta 2015 kello 13.42 – tehnyt Jouni (keskustelu | muokkaukset) (→‎Muita väliotsikoita)
Loikkaa: valikkoon, hakuun

Massadata kansanterveyden edistämisessä on katsausartikkeli Big Datasta. Se on kirjoitettu Duodecim-lehden teemanumeroon.

Kirjoitusohjeita (ks. myös N:\YMAL\Publications\In_progress\Tuomisto_Duodecim):

  • Valistuneelle kohdeyleisölle, joka ei kuitenkaan ole alan asiantuntija.
  • DL 15.5.2015 Eija Rautiaiselle ((at)duodecim.fi)
  • Teemanumeron katsauksen pituus saa olla enintään 1 800 sanaa + kuvat + taulukot.
  • Artikkelissa tulee olla otsikkosivu, jossa on tekijöiden nimet, oppiarvot ja virka-asemat sekä laitosten nimet. Yhteyskirjoittajan osalta mainitaan lisäksi postiosoite.
  • Katsausten väliotsikoinnissa käytetään kaksiportaista asteikkoa (väliotsikko ja rivinalkuinen kursivoitu alaotsikko).
  • Kuvat tulisi lähettää erillistiedostoina, mielellään giff- tai jpg -muodossa.
  • Katsausartikkelin tehtävä on kertoa lukijalle käsiteltävästä aiheesta moniulotteisesti, asiantuntevasti ja tasapainoisesti. Oppikirjamaisuutta tulee välttää ja katsauksen onkin oltava kriittinen ja tutkimushavaintoja kypsästi tulkitseva. Pelkkä tutkimusten referointi ei riitä, vaan kirjoittajan on jäsennettävä tutkimusten tuloksia mahdollisimman laajoihin yhteyksiin. Aiheen tulee kiinnostaa suurinta osaa lehden lukijoita, joten myös kirjoituksen tyylin pitää tukea yleistä ymmärrettävyyttä. Katsauksessa olisi kyettävä – aiheen mukaan – tarjoamaan tietoa ja tukea myös niihin valintoihin, joita käytännön lääkäri joutuu arkityössään tekemään, kuten hoidon porrastukseen.

Tiivistelmä

  • Tiivistelmä artikkelin sisällöstä suomeksi ja englanniksi. Maksimipituus 100 sanaa.

Johdanto

Muita väliotsikoita

Artikkelissa esitetään katsaus joihinkin massadatan keskeisiin ja ajankohtaisiin piirteisiin erityisesti kansanterveyden, lääketieteen ja yhteiskunnallisen päätöksenteon kannalta. Katsauksessa ei siis pyritä tämän laajan aihepiirin kattamiseen vaan kiinnostavien kysymysten esiinnostamiseen.

  • Mitä on big data eli massadata?
  • Haasteita ja mahdollisuuksia kansanterveyden tutkimuksessa.
  • Suomalaisten tietoaineistojen mahdollisuudet.
  • Henkilötietojen suojaamisen haasteet.
  • Omadata eli MyData
Tietolaatikko
Termi Selite
Massadata Englanniksi big data. Suuret data-aineistot, joiden tilastollinen aineisto ei tahdo onnistua tavanomaisin menetelmin.
Omadata Englanniksi MyData. Henkilöä itseään koskeva data, jonka käytöstä hän voi itse päättää. Tällä hetkellä ollaan rakentamassa käytäntöjä, joiden avulla henkilö voi antaa tai evätä tietojensa käyttöluvan haluamilleen tahoille oman operaattorinsa välityksellä riippumatta siitä, missä ja kenen järjestelmissä tieto sijaitsee.
Keinodata Avoin data, joka ulkomuodoltaan ja tilastollisilta ominaisuuksiltaan muistuttaa jotakin arkaluontoista dataa kuten potilasaineistoa ilman, että siitä voisi kuitenkaan päätellä kenenkään todellisen henkilön tietoja. Keinodataa voi käyttää tutkimuskysymysten ja tilastoanalyysien muotoilemiseen ennen kuin analyysi ajetaan vastaavalla todellisella datalla.
Avoin muuttuja Englanniksi open variable tai ovariable. Koneluettavassa muodossa oleva vastaus johonkin täsmälliseen tutkimuskysymykseen. Avoin muuttuja sisältää myös ihmiselle ymmärrettävät ja uskottavat perustelut sille, miten havaintodata ja muu tieteellinen tieto on jalostettu vastaukseksi kysymykseen. Tyypillisesti avoimen muuttujan vastaus on ehdollinen todennäköisyysjakauma.
Datan pitkä häntä (taustadata) Englanniksi long-tail data. Tarkoittaa laajaa joukkoa pieniä aineistoja, jotka kokonsa tai merkityksensä puolesta jäävät myös helposti julkaisematta. Näitä ovat esimerkiksi erilliset tietokannat, nollatulokset ja eläinkoepäiväkirjat. Ferguson nn3838 LUE!

Datan jakamisen parhaat käytännöt Ferguson Box 2. Wang LUE!

Semantic web, ontologia, linked data Wu LUE! (Merelli; tekninen)

Bayes-verkot Yoo LUE!

Gene regulatory networks Bolouri; metodipaperi

Datan jakamisen käytännöt ja kustannukset neuropuolella Poldrak

Datan jakamisen haasteet. Arvostus Poldrak LUE!, Editorial. Sejnowski nn

Terveysdatan kannalta tärkeitä massadatan tietokantoja.

  • World map, KAMPO, JAMU, Tea Pot (Altaf-Ul-Amin et al)

Network analysis Omics data -> Find DEGs -> Calculate partial correlation between DEGs -> Network building -> Network interrogation -> Design new experiments to test hypotheses. (Dong et al)

Lopuksi

  • Loppunousu, jossa ei pelkästään tiivistetä katsauksen viestiä vaan liitetään se laajempiin yhteyksiin tai pohditaan tulevaisuudennäkymiä.

Ydinasiat

  • Katsauksiin tulee laatia 3–5 erillistä virkettä, jotka lyhyesti tiivistävät kirjoituksen keskeisen sanoman. Virkkeet sijoitetaan Ydinasiat-tekstilaatikkoon.

Avainsanat

  • 4-8 kpl

Viitteet

  • Kirjallisuusviitteiden esittämisessä noudatetaan Vancouver-järjestelmää (tekstiin numeroidut viitteet) ja kirjallisuusluettelo laaditaan lehden yleisten kirjoitusohjeiden mukaan, esim. Dagfinrud H, Kvien TK, Hagen KB. Physiotherapy interventions for ankylosing spondylitis. The Cochrane Database of Systematic Rewievs 2013, Issue 4. Art. No.:CD002822. DOI: 10.1002/14651858.CD2822.pub2. Teemanumeron katsausta ei tulisi kuormittaa viitteillä (max. 30).


Tämä sivu on tiedonmuru. Tämä sivu poikkeaa muusta Opasnetin sisällöstä sen suhteen ettei se ole vapaasti muokattavissa. Käyttäessäsi sivun sisältämää tietoa muualla ole hyvä ja viittaa tähän sivuun näin:

Jouni T. Tuomisto, Antti Poikola: Massadata kansanterveyden edistämisessä. Opasnet 2015. Viitattu 07.05.2024. (, Duodecim)




Noudettu kohteesta http://fi.opasnet.org/fi-opwiki/index.php?title=Massadata_kansanterveyden_edistämisessä&oldid=29083