Epidemiologinen malli
Moderaattori:Jouni (katso kaikki)
Sivun edistymistä ei ole arvioitu. Arvostuksen määrää ei ole arvioitu (ks. peer review). |
Lisää dataa
|
Kysymys
Mikä tulee olemaan vakavan pneumokokkitaudin tautitaakka Suomessa eri ikäryhmissä jos annettuja rokoteserotyyppejä vastaava konjugaattorokote valitaan kansalliseen rokotusohjelmaaan?
Rajaus
Rokotuskattavuus, rokotteen teho ja aika rokotusten aloittamisesta ovat riittävät, jotta rokoteserotyyppien kantujuus häviää. Oletetaan, että rokoteserotyyppien kantajuus korvautuu täysin muiden serotyppien kantujuudella.
Vastaus
Ennuste rokotusten jälkeiselle tautitaakalle lasketaan ennen rokotuksia vallinneiden seotyppikohtaisten kantajuusosuuksien ja tautimäärien perusteella.
Perustelut
Pneumokokki eli Streptococcus pneumoniae -bakteeri on maailmanlaajuisesti merkittävä lapsikuolleisuuden aiheuttaja. Siksi toimiva pneumokokkibakteerin rokotusohjelma on kansanterveystyönä kustannustehokkaimpien joukossa. Imeväisten rokottamisessa on käytetty kolmea eri konjugaattirokotetta, jotka sisältävät joko 7, 10 tai 13 pneumokokkiserotyyppiä. Rokotteet ovat sekä vähentäneet pneumokokin aiheuttamien sairauksien haittoja että muuttaneet pneumokokkiserotyppien keskinäisiä kantajuusosuuksia.
Korvautuminen
Serotyyppien korvautumisella tarkoitetaan rokotteen sisältämien serotyyppien korvautumista niillä serotyypeillä, joita rokote ei sisällä. Rokotetussa väestössä korvautuminen on yleensä tapahtunut verrattain nopeasti rokotusohjelman aloittamisen jälkeen. Serotyyppien korvautuvuuden takia rokotteiden teho sairauden haittojen vähentämisessä on ollut odotettua heikompi. Nurhonen ja Auranen ovat rakentaneet mallin [1], joka kuvaa korvautuvuuden mekanismia rokotetussa väestössä. Mallin avulla voidaan laskea arvioita eri serotyyppikombinatioita vastaavien rokotteiden vaikutuksille pneumokokkitautien ilmaantuvuuteen väestössä ja tunnistaa ne serotyypit, joita nykyisiin rokotteisiin olisi hyödyllisintä lisätä invasiivisen pneumokokki-infektion välttämiseksi.
Laskenta
R-program code for the replcement model as in File S1 of Nurhonen M, Auranen K: Optimal serotype compositions for pneumococcal conjugate vaccination under serotype replacement [[2]
Esimerkkejä
- VT: vaccine serotypes, i.e. pneumococcus serotypes that are found in a vaccine.
- NVT: non-vaccine serotypes, i.e. pneumococcus serotypes that are not found in the vaccine.
- Example model run
----#: . Yritin selvittää kuinka alla oleva koodi toimii. Huomasin että vaihtaessa arvoja ajoon, niin vaikuttaisi siltä että ajon tulokset eivät kuitenkaan muutu? --Jaakko (keskustelu) 5. kesäkuuta 2014 kello 14.13 (UTC) (type: truth; paradigms: science: comment) ----#: . Taulukot vastaavat näköjään aina lähtömallia, joka on PCv13, mutta pylväskuviossa muutettu malli on mukana. --Markku N. (keskustelu) 9. kesäkuuta 2014 kello 09.18 (UTC) (type: truth; paradigms: science: comment)
Funktioiden alustus
Data
Pneumokokin esiintyvyys suomalaisessa väestössä. Carrier: (oireettomien) kantajien lukumäärä, Incidence: invasiivisen pneumokokkitaudin ilmaantuvuus 100000 henkilövuotta kohti.
Näytä yksityiskohdat | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Katso myös
Tämä rokotehankintakeskustelu toimitettiin tiedoksi kansalliselle rokotusasiantuntijaryhmälle 8.9.2014.