Ero sivun ”TCDD-koe S217 ym.” versioiden välillä
(Data uploaded using Opasnet Base Import) |
(removed Original file url) |
||
(11 välissä olevaa versiota 2 käyttäjän tekeminä ei näytetä) | |||
Rivi 3: | Rivi 3: | ||
== Kokeet == | == Kokeet == | ||
<t2b index="Kuvaus" unit=" | <t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217"> | ||
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | ||
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | ||
Sarja numero|S217 | Sarja numero|S217 | ||
Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste | Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste | ||
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | ||
Koesuunnitelman päiväys| | Koesuunnitelman päiväys|19.8.1997 | ||
Koe-eläinluvan numero| | Koe-eläinluvan numero| | ||
Aine|TCDD (µg/kg) | Aine|TCDD (µg/kg) | ||
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | ||
Altistuspäivä(pvä0)| | Altistuspäivä(pvä0)|26.8.1997 | ||
Annos|0 | Annos|0 | ||
Annos|0 | Annos|0.03 | ||
Annos|0 | Annos|0.1 | ||
Annos|0 | Annos|0.3 | ||
Annos|1 | Annos|1 | ||
Annos|3 | Annos|3 | ||
Rivi 64: | Rivi 64: | ||
Säilytys|Formaliini | Säilytys|Formaliini | ||
Määritys|Histologia | Määritys|Histologia | ||
</t2b> | </t2b> | ||
<t2b index="Kuvaus" unit=" | <t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217b"> | ||
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | ||
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | ||
Rivi 77: | Rivi 76: | ||
Aine|TCDD (µg/kg) | Aine|TCDD (µg/kg) | ||
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | ||
Altistuspäivä(pvä0)|WW ryhmät 1-5 18.5. | Altistuspäivä(pvä0)|WW ryhmät 1-5 18.5.1998, WW ryhmät 6-9 19.5.1998, LE 2.6.1998 | ||
Annos|0 | Annos|0 | ||
Annos|0 | Annos|0.03 | ||
Annos|0 | Annos|0.1 | ||
Annos|0 | Annos|0.3 | ||
Annos|1 | Annos|1 | ||
Annos|3 | Annos|3 | ||
Rivi 120: | Rivi 119: | ||
Näytekuvaus|Mitä | Näytekuvaus|Mitä | ||
Näyte| | Näyte| | ||
</t2b> | </t2b> | ||
<t2b index="Kuvaus" unit=" | <t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S226"> | ||
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | ||
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | ||
Rivi 129: | Rivi 127: | ||
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta | Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta | ||
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | ||
Koesuunnitelman päiväys| | Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997 | ||
Koe-eläinluvan numero| - | Koe-eläinluvan numero| - | ||
Aine|PeCDD (µg/kg) | Aine|PeCDD (µg/kg) | ||
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | ||
Altistuspäivä(pvä0)|4.11.1997(WW:t), 25.11.1997(LE:t) | Altistuspäivä(pvä0)|4.11.1997 (WW:t), 25.11.1997 (LE:t) | ||
Annos|0 | Annos|0 | ||
Annos|0 | Annos|0.01 | ||
Annos|0 | Annos|0.3 | ||
Annos|1 | Annos|1 | ||
Annos|3 | Annos|3 | ||
Rivi 159: | Rivi 157: | ||
Ryhmät ja lkm| - | Ryhmät ja lkm| - | ||
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki | Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki | ||
Eläimiä per häkki|n.5 | Eläimiä per häkki|n. 5 | ||
Totutusaika (vko)| | |||
Altistuspäivän ikä| | |||
Altistajan nimi| | |||
Lopetus TCDDn annosta (pvä)| | |||
Annosteluaika (klo)| | |||
Eläinhuone| | |||
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00 | |||
Rehu|R36-jauherehu | |||
Vesi|Vapaasti hanavesi | |||
Lämpötila|21 ± 1 °C | |||
Kosteus|50 ± 10 % | |||
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta. | |||
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8 | |||
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| - | |||
Näytekuvaus|Mitä | |||
Näyte1|Maksa | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|EROD+loppumassa | |||
Näyte2|Thymus | |||
Säilytys| | |||
Määritys|Paino | |||
Näyte3|Alaleuka | |||
Säilytys|Formaliini | |||
Määritys|Histologia | |||
Näyte4|Seerumi x2 | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|bil. vara | |||
</t2b> | |||
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S227"> | |||
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | |||
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | |||
Sarja numero|S227 | |||
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:heksa | |||
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | |||
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997 | |||
Koe-eläinluvan numero| | |||
Aine|HxCDD (µg/kg) | |||
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | |||
Altistuspäivä(pvä0)|9.12.1997 (LE:t), 31.12.1997 (WW:t) | |||
Annos|0 | |||
Annos|0.3 | |||
Annos|1 | |||
Annos|3 | |||
Annos|10 | |||
Annos|30 | |||
Annos|100 | |||
Annos|300 | |||
Annos|1000 | |||
Koe alkaa|35768 | |||
Koe päättyy|35803 | |||
Laji|Rotta | |||
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio)) | |||
Sukupuoli|Naaras | |||
Lukumäärä|46 | |||
Ikä kokeen alussa (vko)|16(23kpl), 15(13kpl), 13(10kpl) | |||
Luovutusnumero|9735, 9736, 9738 | |||
Ryhmät ja lkm| - | |||
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B)) | |||
Sukupuoli|Naaras | |||
Lukumäärä|48 | |||
Ikä kokeen alussa (vko)|15(29kpl), 14(19kpl) | |||
Luovutusnumero|9735, 9736 | |||
Ryhmät ja lkm| - | |||
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki | |||
Eläimiä per häkki|n. 5 | |||
Totutusaika (vko)| | Totutusaika (vko)| | ||
Altistuspäivän ikä| | Altistuspäivän ikä| | ||
Rivi 175: | Rivi 239: | ||
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| - | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| - | ||
Näytekuvaus|Mitä | Näytekuvaus|Mitä | ||
Näyte1|Maksa | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|EROD+loppumassa | |||
Näyte2|Thymus | |||
Säilytys| | |||
Määritys|Paino | |||
Näyte3|Alaleuka | |||
Säilytys|Formaliini | |||
Määritys|Histologia | |||
Näyte4|Seerumi x2 | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|bil. vara | |||
</t2b> | |||
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S228"> | |||
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1 | |||
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) | |||
Sarja numero|S228 | |||
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:hepta | |||
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela | |||
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997 | |||
Koe-eläinluvan numero| - | |||
Aine|HpCDD (µg/kg) | |||
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) | |||
Altistuspäivä(pvä0)|30.12.1997 (LE:t), 11.2.1998 (WW:t) | |||
Annos|0 | |||
Annos|0.01 | |||
Annos|0.3 | |||
Annos|1 | |||
Annos|3 | |||
Annos|10 | |||
Annos|30 | |||
Annos|100 | |||
Annos|300 | |||
Annos|1000 | |||
Annos|3000 | |||
Koe alkaa|35782 | |||
Koe päättyy|35846 | |||
Laji|Rotta | |||
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio)) | |||
Sukupuoli|Naaras | |||
Lukumäärä|60 | |||
Ikä kokeen alussa (vko)|16(30kpl), 15(10kpl), 15(20kpl)(täydennyskoe) | |||
Luovutusnumero|9744, 9745, 9750(täydennyskoe) | |||
Ryhmät ja lkm| - | |||
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B)) | |||
Sukupuoli|Naaras | |||
Lukumäärä|57 | |||
Ikä kokeen alussa (vko)|18(6kpl), 16(29kpl), 17(22kpl) | |||
Luovutusnumero|9735, 9737, 9743 | |||
Ryhmät ja lkm| - | |||
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki | |||
Eläimiä per häkki|n. 5 | |||
Totutusaika (vko)| | |||
Altistuspäivän ikä| | |||
Altistajan nimi| | |||
Lopetus TCDDn annosta (pvä)| | |||
Annosteluaika (klo)| | |||
Eläinhuone| | |||
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00 | |||
Rehu|R36-jauherehu | |||
Vesi|Vapaasti hanavesi | |||
Lämpötila|21 ± 1 °C | |||
Kosteus|50 ± 10 % | |||
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta. | |||
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8 | |||
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| - | |||
Näytekuvaus|Mitä | |||
Näyte1|Maksa | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|EROD+loppumassa | |||
Näyte2|Thymus | |||
Säilytys| | |||
Määritys|Paino | |||
Näyte3|Alaleuka | |||
Säilytys|Formaliini | |||
Määritys|Histologia | |||
Näyte4|Seerumi x2 | |||
Säilytys|-80 | |||
Määritys|bil. vara | |||
</t2b> | </t2b> | ||
== Muuttujat == | == Muuttujat == | ||
<t2b index="Järjestys, Tunniste, Kuvaus, Huomautuksia, Esimerkkiarvoja" unit="-" obs="Puuttuvat" name="Muuttujat"> | |||
1|Tunniste|Kokeen tunnistekoodi||S217, S217b, S226, S227 tai S228|ei puuttuvia | |||
2|Nro|Rotan koenumero||1, 2, 3, ...|ei puuttuvia | |||
3|Kanta|Rotan kanta||LE tai WW|ei puuttuvia | |||
4|SP|Rotan sukupuoli|uros tai naaras, vain naaraita|U tai N|ei puuttuvia | |||
5|Aine|Rotalle annettu aine||TCDD, PeCDD, HxCDD tai HpCDD|ei puuttuvia | |||
6|Annos|Annetun aineen määrä|µg/kg, 13 eri annoskokoa: 0 - 3000|0.3|ei puuttuvia | |||
7|Ryhmä|Ruokintaryhmä||1, 2, …, 9|390 kpl, vain tunnisteelle S217b | |||
8|Paino-3|Paino pvä-3|g||132 kpl, kaikki S217 + loput S217b | |||
9|Paino0|Paino pvä0|g||ei puuttuvia | |||
10|Paino3|Paino pvä3|g||51 kpl, tunnisteelta S217b | |||
11|Paino6|Paino pvä6|g||51 kpl, tunnisteelta S217b | |||
12|Paino8|Paino pvä8|g||ei puuttuvia | |||
13|PainoThy|Thymuksen(kateenkorvan) paino|g||ei puuttuvia | |||
14|LivEROD|Liver EROD activity - Maksan EROD aktiivisuus|pmol/mg*min||12 kpl | |||
15|S-T4|Serum T4 Concentration - Seerumin T4(tyroksiini) pitoisuus|nmol/l||179 kpl, tunnisteelta S217 ja S226 | |||
16|TootErup|Tooth Eruption - Hampaan puhkeaminen||0, 0.5 tai 1|81 kpl, tunnisteelta S217 | |||
17|S-FFA|Serum FFA Concentration - Hampaan FFA pitoisuus|mmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217 | |||
18|S-bil|Serum Tot. Bilirubin Concentration - Seerumin bilirubiinin kokonaispitoisuus|µmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217 | |||
19|S-ASAT|Serum ASAT Activity - Seerumin ASAT aktiivisuus|U/l||81 kpl, tunnisteelta S217 | |||
20|MSOITD|Mean severity of incisor tooth defects||0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3 tai T|87 kpl = 6 + kaikki tunnisteelta S217 | |||
</t2b> | |||
Muuttujien välisiä yhteyksiä ja muita huomioita: | |||
*Kokeissa S217 ja S217b annettu aine on TCDD, kokeessa S226 PeCDD, kokeessa S227 HxCDD ja kokeessa S228 HpCDD. | |||
*Aineella HpCDD erilaisia annoskokoja on 11, muilla 9 kpl. | |||
== Data == | |||
{{tuloslinkki}} | |||
Taulukosta ilmenee kokeiden tulokset (ruumiinpaino eri aikoina sekä kateenkorvan paino, maksan EROD-arvo, S-T4, S-FFA, S-bil, S-ASAT ja MSOITD kokeen lopussa). | |||
Voit halutessasi ladata kaiken datan itsellesi käyttäen ilmaista R-ohjelmointikieltä. Asenna tietokoneellesi R-ohjelmisto ja OpasnetUtils-paketti [https://cran.r-project.org/ CRAN:ista], käynnistä R ja aja seuraava koodi: | |||
library(OpasnetUtils) | |||
dat <- opbase.data("Op_fi5507", subset = "data") # Page [[TCDD-koe S217 ym.]] | |||
<!-- __OBI_TS:1467017328 --> | |||
== Katso myös == | |||
{{TCDD-kokeet}} |
Nykyinen versio 22. elokuuta 2016 kello 11.14
Tämä sivu on tutkimus.
Sivutunniste: Op_fi5507 |
---|
Moderaattori:Pauli (katso kaikki)
Sivun edistymistä ei ole arvioitu. Arvostuksen määrää ei ole arvioitu (ks. peer review). |
Lisää dataa
|
Kokeet
Obs | Kuvaus | Tulos |
---|---|---|
1 | Kirjaimisto | ASCII ISO-8859-1 |
2 | Tiedostomuoto | TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) |
3 | Sarja numero | S217 |
4 | Kuvaileva nimi | EROD-annosvaste |
5 | Vastuuhenkilö | Matti Viluksela |
6 | Koesuunnitelman päiväys | 19.8.1997 |
7 | Koe-eläinluvan numero | |
8 | Aine | TCDD (µg/kg) |
9 | Antotapa | maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) |
10 | Altistuspäivä(pvä0) | 26.8.1997 |
11 | Annos | 0 |
12 | Annos | 0.03 |
13 | Annos | 0.1 |
14 | Annos | 0.3 |
15 | Annos | 1 |
16 | Annos | 3 |
17 | Annos | 10 |
18 | Annos | 30 |
19 | Annos | 100 |
20 | Koe alkaa | 35662 |
21 | Koe päättyy | 35676 |
22 | Laji | Rotta |
23 | Kanta1 | HW (Han/Wistar (Kuopio)) |
24 | Sukupuoli | Naaras |
25 | Lukumäärä | 41 |
26 | Ikä kokeen alussa (vko) | 14(37kpl), 13(4kpl |
27 | Luovutusnumero | 9721, 9722 |
28 | Ryhmät ja lkm | 0(4kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(4kpl), 100(4kpl) |
29 | Kanta2 | LE (Long-Evans (Turku A/B)) |
30 | Sukupuoli | Naaras |
31 | Lukumäärä | 40 |
32 | Ikä kokeen alussa (vko) | 15(22kpl), 14(12kpl), 13(6kpl) |
33 | Luovutusnumero | 9720, 9721, 9722 |
34 | Ryhmät ja lkm | 0(5kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(5kpl), 100(0kpl) |
35 | Häkkityyppi | Ryhmä-RST-häkki |
36 | Eläimiä per häkki | 5 |
37 | Totutusaika (vko) | |
38 | Altistuspäivän ikä | |
39 | Altistajan nimi | |
40 | Lopetus TCDDn annosta (pvä) | |
41 | Annosteluaika (klo) | |
42 | Eläinhuone | |
43 | Valorytmi | Valot päällä 7.00 - 19.00 |
44 | Rehu | R36-jauherehu |
45 | Vesi | Vapaasti hanavesi |
46 | Lämpötila | 21 ± 1 °C |
47 | Kosteus | 50 ± 10 % |
48 | Kokeen idea lyhyesti | Rotat RST-ryhmähäkeissä. 8pv altistuksesta lopetus tutkitaan EROD-induktiota pienillä annoksilla |
49 | Toimenpiteet kokeen aikana | Lopetuksessa katsotaan hammasviirut ja thymuksen paino. Näytteeksi maksa ja alaleuka |
50 | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät | - |
51 | Näytekuvaus | Mitä |
52 | Näyte1 | Maksa |
53 | Säilytys | -80 |
54 | Määritys | EROD |
55 | Näyte2 | Thymus |
56 | Säilytys | - |
57 | Määritys | Paino |
58 | Näyte3 | Alaleuka |
59 | Säilytys | Formaliini |
60 | Määritys | Histologia |
Obs | Kuvaus | Tulos |
---|---|---|
1 | Kirjaimisto | ASCII ISO-8859-1 |
2 | Tiedostomuoto | TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) |
3 | Sarja numero | S217b |
4 | Kuvaileva nimi | EROD-annosvaste (täydennyskoe) |
5 | Vastuuhenkilö | Matti Viluksela |
6 | Koesuunnitelman päiväys | - (tästä kokeesta ei erillistä koesuunnitelmaa) |
7 | Koe-eläinluvan numero | - |
8 | Aine | TCDD (µg/kg) |
9 | Antotapa | maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) |
10 | Altistuspäivä(pvä0) | WW ryhmät 1-5 18.5.1998, WW ryhmät 6-9 19.5.1998, LE 2.6.1998 |
11 | Annos | 0 |
12 | Annos | 0.03 |
13 | Annos | 0.1 |
14 | Annos | 0.3 |
15 | Annos | 1 |
16 | Annos | 3 |
17 | Annos | 10 |
18 | Annos | 30 |
19 | Annos | 100 |
20 | Koe alkaa | 35930 |
21 | Koe päättyy | 35956 |
22 | Laji | Rotta |
23 | Kanta | HW (Han/Wistar (Kuopio)) |
24 | Sukupuoli | Naaras |
25 | Lukumäärä | 51 |
26 | Ikä kokeen alussa (vko) | 14(22kpl), 13(29kpl) |
27 | Luovutusnumero | 9807, 9808 |
28 | Ryhmät ja lkm | 5eläintä/annosteluryhmä |
29 | Kanta | LE (Long-Evans (Turku A/B)) |
30 | Sukupuoli | Naaras |
31 | Lukumäärä | 41 |
32 | Ikä kokeen alussa (vko) | 14(27kpl), 13(14kpl) |
33 | Luovutusnumero | 9809, 9810 |
34 | Ryhmät ja lkm | 4-5eläintä/annosteluryhmä |
35 | Häkkityyppi | Ryhmä-RST-häkki |
36 | Eläimiä per häkki | 5 |
37 | Totutusaika (vko) | |
38 | Altistuspäivän ikä | |
39 | Altistajan nimi | |
40 | Lopetus TCDDn annosta (pvä) | |
41 | Annosteluaika (klo) | |
42 | Eläinhuone | |
43 | Valorytmi | Valot päällä 7.00 - 19.00 |
44 | Rehu | R36-jauherehu |
45 | Vesi | Vapaasti hanavesi |
46 | Lämpötila | 21 ± 1 °C |
47 | Kosteus | 50 ± 10 % |
48 | Kokeen idea lyhyesti | - |
49 | Toimenpiteet kokeen aikana | - |
50 | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät | - |
51 | Näytekuvaus | Mitä |
52 | Näyte |
Obs | Kuvaus | Tulos |
---|---|---|
1 | Kirjaimisto | ASCII ISO-8859-1 |
2 | Tiedostomuoto | TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) |
3 | Sarja numero | S226 |
4 | Kuvaileva nimi | "EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta |
5 | Vastuuhenkilö | Matti Viluksela |
6 | Koesuunnitelman päiväys | 15.10.1997 |
7 | Koe-eläinluvan numero | - |
8 | Aine | PeCDD (µg/kg) |
9 | Antotapa | maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) |
10 | Altistuspäivä(pvä0) | 4.11.1997 (WW:t), 25.11.1997 (LE:t) |
11 | Annos | 0 |
12 | Annos | 0.01 |
13 | Annos | 0.3 |
14 | Annos | 1 |
15 | Annos | 3 |
16 | Annos | 10 |
17 | Annos | 30 |
18 | Annos | 100 |
19 | Annos | 300 |
20 | Koe alkaa | 35733 |
21 | Koe päättyy | 35767 |
22 | Laji | Rotta |
23 | Kanta | HW (Han/Wistar (Kuopio)) |
24 | Sukupuoli | Naaras |
25 | Lukumäärä | 51 |
26 | Ikä kokeen alussa (vko) | 15(31kpl), 14(10kpl), 15(10kpl)(täydennyskoe) |
27 | Luovutusnumero | 9730, 9731, 9750(täydennyskoe) |
28 | Ryhmät ja lkm | - |
29 | Kanta | LE (Long-Evans (Turku A/B)) |
30 | Sukupuoli | Naaras |
31 | Lukumäärä | 47 |
32 | Ikä kokeen alussa (vko) | 15(11kpl), 14(36kpl) |
33 | Luovutusnumero | 9733, 9734 |
34 | Ryhmät ja lkm | - |
35 | Häkkityyppi | Ryhmä-RST-häkki |
36 | Eläimiä per häkki | n. 5 |
37 | Totutusaika (vko) | |
38 | Altistuspäivän ikä | |
39 | Altistajan nimi | |
40 | Lopetus TCDDn annosta (pvä) | |
41 | Annosteluaika (klo) | |
42 | Eläinhuone | |
43 | Valorytmi | Valot päällä 7.00 - 19.00 |
44 | Rehu | R36-jauherehu |
45 | Vesi | Vapaasti hanavesi |
46 | Lämpötila | 21 ± 1 °C |
47 | Kosteus | 50 ± 10 % |
48 | Kokeen idea lyhyesti | Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta. |
49 | Toimenpiteet kokeen aikana | Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8 |
50 | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät | - |
51 | Näytekuvaus | Mitä |
52 | Näyte1 | Maksa |
53 | Säilytys | -80 |
54 | Määritys | EROD+loppumassa |
55 | Näyte2 | Thymus |
56 | Säilytys | |
57 | Määritys | Paino |
58 | Näyte3 | Alaleuka |
59 | Säilytys | Formaliini |
60 | Määritys | Histologia |
61 | Näyte4 | Seerumi x2 |
62 | Säilytys | -80 |
63 | Määritys | bil. vara |
Obs | Kuvaus | Tulos |
---|---|---|
1 | Kirjaimisto | ASCII ISO-8859-1 |
2 | Tiedostomuoto | TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) |
3 | Sarja numero | S227 |
4 | Kuvaileva nimi | "EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:heksa |
5 | Vastuuhenkilö | Matti Viluksela |
6 | Koesuunnitelman päiväys | 15.10.1997 |
7 | Koe-eläinluvan numero | |
8 | Aine | HxCDD (µg/kg) |
9 | Antotapa | maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) |
10 | Altistuspäivä(pvä0) | 9.12.1997 (LE:t), 31.12.1997 (WW:t) |
11 | Annos | 0 |
12 | Annos | 0.3 |
13 | Annos | 1 |
14 | Annos | 3 |
15 | Annos | 10 |
16 | Annos | 30 |
17 | Annos | 100 |
18 | Annos | 300 |
19 | Annos | 1000 |
20 | Koe alkaa | 35768 |
21 | Koe päättyy | 35803 |
22 | Laji | Rotta |
23 | Kanta1 | HW (Han/Wistar (Kuopio)) |
24 | Sukupuoli | Naaras |
25 | Lukumäärä | 46 |
26 | Ikä kokeen alussa (vko) | 16(23kpl), 15(13kpl), 13(10kpl) |
27 | Luovutusnumero | 9735, 9736, 9738 |
28 | Ryhmät ja lkm | - |
29 | Kanta2 | LE (Long-Evans (Turku A/B)) |
30 | Sukupuoli | Naaras |
31 | Lukumäärä | 48 |
32 | Ikä kokeen alussa (vko) | 15(29kpl), 14(19kpl) |
33 | Luovutusnumero | 9735, 9736 |
34 | Ryhmät ja lkm | - |
35 | Häkkityyppi | Ryhmä-RST-häkki |
36 | Eläimiä per häkki | n. 5 |
37 | Totutusaika (vko) | |
38 | Altistuspäivän ikä | |
39 | Altistajan nimi | |
40 | Lopetus TCDDn annosta (pvä) | |
41 | Annosteluaika (klo) | |
42 | Eläinhuone | |
43 | Valorytmi | Valot päällä 7.00 - 19.00 |
44 | Rehu | R36-jauherehu |
45 | Vesi | Vapaasti hanavesi |
46 | Lämpötila | 21 ± 1 °C |
47 | Kosteus | 50 ± 10 % |
48 | Kokeen idea lyhyesti | Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta. |
49 | Toimenpiteet kokeen aikana | Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8 |
50 | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät | - |
51 | Näytekuvaus | Mitä |
52 | Näyte1 | Maksa |
53 | Säilytys | -80 |
54 | Määritys | EROD+loppumassa |
55 | Näyte2 | Thymus |
56 | Säilytys | |
57 | Määritys | Paino |
58 | Näyte3 | Alaleuka |
59 | Säilytys | Formaliini |
60 | Määritys | Histologia |
61 | Näyte4 | Seerumi x2 |
62 | Säilytys | -80 |
63 | Määritys | bil. vara |
Obs | Kuvaus | Tulos |
---|---|---|
1 | Kirjaimisto | ASCII ISO-8859-1 |
2 | Tiedostomuoto | TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) |
3 | Sarja numero | S228 |
4 | Kuvaileva nimi | "EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:hepta |
5 | Vastuuhenkilö | Matti Viluksela |
6 | Koesuunnitelman päiväys | 15.10.1997 |
7 | Koe-eläinluvan numero | - |
8 | Aine | HpCDD (µg/kg) |
9 | Antotapa | maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.) |
10 | Altistuspäivä(pvä0) | 30.12.1997 (LE:t), 11.2.1998 (WW:t) |
11 | Annos | 0 |
12 | Annos | 0.01 |
13 | Annos | 0.3 |
14 | Annos | 1 |
15 | Annos | 3 |
16 | Annos | 10 |
17 | Annos | 30 |
18 | Annos | 100 |
19 | Annos | 300 |
20 | Annos | 1000 |
21 | Annos | 3000 |
22 | Koe alkaa | 35782 |
23 | Koe päättyy | 35846 |
24 | Laji | Rotta |
25 | Kanta1 | HW (Han/Wistar (Kuopio)) |
26 | Sukupuoli | Naaras |
27 | Lukumäärä | 60 |
28 | Ikä kokeen alussa (vko) | 16(30kpl), 15(10kpl), 15(20kpl)(täydennyskoe) |
29 | Luovutusnumero | 9744, 9745, 9750(täydennyskoe) |
30 | Ryhmät ja lkm | - |
31 | Kanta2 | LE (Long-Evans (Turku A/B)) |
32 | Sukupuoli | Naaras |
33 | Lukumäärä | 57 |
34 | Ikä kokeen alussa (vko) | 18(6kpl), 16(29kpl), 17(22kpl) |
35 | Luovutusnumero | 9735, 9737, 9743 |
36 | Ryhmät ja lkm | - |
37 | Häkkityyppi | Ryhmä-RST-häkki |
38 | Eläimiä per häkki | n. 5 |
39 | Totutusaika (vko) | |
40 | Altistuspäivän ikä | |
41 | Altistajan nimi | |
42 | Lopetus TCDDn annosta (pvä) | |
43 | Annosteluaika (klo) | |
44 | Eläinhuone | |
45 | Valorytmi | Valot päällä 7.00 - 19.00 |
46 | Rehu | R36-jauherehu |
47 | Vesi | Vapaasti hanavesi |
48 | Lämpötila | 21 ± 1 °C |
49 | Kosteus | 50 ± 10 % |
50 | Kokeen idea lyhyesti | Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta. |
51 | Toimenpiteet kokeen aikana | Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8 |
52 | Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät | - |
53 | Näytekuvaus | Mitä |
54 | Näyte1 | Maksa |
55 | Säilytys | -80 |
56 | Määritys | EROD+loppumassa |
57 | Näyte2 | Thymus |
58 | Säilytys | |
59 | Määritys | Paino |
60 | Näyte3 | Alaleuka |
61 | Säilytys | Formaliini |
62 | Määritys | Histologia |
63 | Näyte4 | Seerumi x2 |
64 | Säilytys | -80 |
65 | Määritys | bil. vara |
Muuttujat
Obs | Järjestys | Tunniste | Kuvaus | Huomautuksia | Esimerkkiarvoja | Puuttuvat |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | Tunniste | Kokeen tunnistekoodi | S217, S217b, S226, S227 tai S228 | ei puuttuvia | |
2 | 2 | Nro | Rotan koenumero | 1, 2, 3, ... | ei puuttuvia | |
3 | 3 | Kanta | Rotan kanta | LE tai WW | ei puuttuvia | |
4 | 4 | SP | Rotan sukupuoli | uros tai naaras, vain naaraita | U tai N | ei puuttuvia |
5 | 5 | Aine | Rotalle annettu aine | TCDD, PeCDD, HxCDD tai HpCDD | ei puuttuvia | |
6 | 6 | Annos | Annetun aineen määrä | µg/kg, 13 eri annoskokoa: 0 - 3000 | 0.3 | ei puuttuvia |
7 | 7 | Ryhmä | Ruokintaryhmä | 1, 2, …, 9 | 390 kpl, vain tunnisteelle S217b | |
8 | 8 | Paino-3 | Paino pvä-3 | g | 132 kpl, kaikki S217 + loput S217b | |
9 | 9 | Paino0 | Paino pvä0 | g | ei puuttuvia | |
10 | 10 | Paino3 | Paino pvä3 | g | 51 kpl, tunnisteelta S217b | |
11 | 11 | Paino6 | Paino pvä6 | g | 51 kpl, tunnisteelta S217b | |
12 | 12 | Paino8 | Paino pvä8 | g | ei puuttuvia | |
13 | 13 | PainoThy | Thymuksen(kateenkorvan) paino | g | ei puuttuvia | |
14 | 14 | LivEROD | Liver EROD activity - Maksan EROD aktiivisuus | pmol/mg*min | 12 kpl | |
15 | 15 | S-T4 | Serum T4 Concentration - Seerumin T4(tyroksiini) pitoisuus | nmol/l | 179 kpl, tunnisteelta S217 ja S226 | |
16 | 16 | TootErup | Tooth Eruption - Hampaan puhkeaminen | 0, 0.5 tai 1 | 81 kpl, tunnisteelta S217 | |
17 | 17 | S-FFA | Serum FFA Concentration - Hampaan FFA pitoisuus | mmol/l | 81 kpl, tunnisteelta S217 | |
18 | 18 | S-bil | Serum Tot. Bilirubin Concentration - Seerumin bilirubiinin kokonaispitoisuus | µmol/l | 81 kpl, tunnisteelta S217 | |
19 | 19 | S-ASAT | Serum ASAT Activity - Seerumin ASAT aktiivisuus | U/l | 81 kpl, tunnisteelta S217 | |
20 | 20 | MSOITD | Mean severity of incisor tooth defects | 0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3 tai T | 87 kpl = 6 + kaikki tunnisteelta S217 |
Muuttujien välisiä yhteyksiä ja muita huomioita:
- Kokeissa S217 ja S217b annettu aine on TCDD, kokeessa S226 PeCDD, kokeessa S227 HxCDD ja kokeessa S228 HpCDD.
- Aineella HpCDD erilaisia annoskokoja on 11, muilla 9 kpl.
Data
{{#opasnet_base_link:Op_fi5507}}
Taulukosta ilmenee kokeiden tulokset (ruumiinpaino eri aikoina sekä kateenkorvan paino, maksan EROD-arvo, S-T4, S-FFA, S-bil, S-ASAT ja MSOITD kokeen lopussa).
Voit halutessasi ladata kaiken datan itsellesi käyttäen ilmaista R-ohjelmointikieltä. Asenna tietokoneellesi R-ohjelmisto ja OpasnetUtils-paketti CRAN:ista, käynnistä R ja aja seuraava koodi:
library(OpasnetUtils) dat <- opbase.data("Op_fi5507", subset = "data") # Page TCDD-koe S217 ym.
Katso myös
Hankkeen nimi | Kuvaus | Kokeet |
---|---|---|
Kokeiden luettelo | Luettelo TCDD-projektin tekemistä kokeista (ns. S-sarjat) löytyy englanninkielisestä Opasnetistä. | Kaikki |
Motiliteetti | Vaikuttaako TCDD eläinten motiliteettiin eli liikkumiskäyttäytymiseen? Miten? Asiaa tutkittiin häkin pohjalla olevalla kosketusherkällä levyllä useiden vuorokausien seurannassa. |
S36 · S40 · S117 |
Aivoleesiot ja syöminen | Miten aivojen syömiskeskusten manipulointi vaikuttaa TCDD:n aiheuttamaan syömisen vähenemiseen ja näivetysoireyhtymään? Asiaa tutkittiin tekemällä pieniä vaurioita hypotalamuksen tumakkeisiin. |
S78 · S84 · S106 · S125 · S128 · S141 · S144 · S151 · S174 · S196 · Valjakka et al. |
Tuumoripromootio | Onko TCDD initiaattori vai promoottori syövän aiheuttajana? Asiaa tutkittiin antamalla rotille maksimi-initiaatio syöpää aiheuttavia tekijöitä maksaan ja sitten seurattiin TCDD:n vaikutusta maksasyövän ilmaantumiseen 6 kk:n aikana. | S186 |
Dioksiinien annosvaste | Millaisia annosvasteita dioksiineilla on erilaisille vasteille Han/Wistar- ja Long-Evans-rottakannoilla? Ovatko eri johdokset keskenään samanlaisia toksisuusekvivalentteina mitattuna? Asiaa tutkittiin tekemällä annosvastekokeita useilla eri johdoksilla. |
S62 · S64 · S83 · S87 · S137 · S149 · S192 · S217, S217b, S226, S227, S228 |
Suklaakokeet | Miten erilaiset ruoka-aineet muokkaavat TCDD:n aiheuttamia muutoksia syömiskäyttäytymisessä? Liittyykö TCDD-vaikutus erityisesti johonkin ravintoaineeseen kuten proteiiniin, rasvaan tai hiilihydraatteihin? Asiaa tutkittiin useissa kokeissa, joissa TCDD-altistetuille rotille annettiin syötäväksi muutakin kuin perusrehua. Usein se oli suklaata, koska se kelpasi rotille ja oli helppo mitata tarkasti. |
S113 · S239 · S240 · S243 · S250 · S251 · S252 · S253 · S254 · S261, S262, S264 · S263 · S269 · S270 · S273 · S276 · S278 · S280 |
Letkuruokinta | Estääkö letkuruokinta näivetysoireyhtymää? Näin voisi olla, jos näivetysoireyhtymä on ensisijaisesti syömiskäyttäytymisen muutos ja haitat johtuvat energianpuutteesta. Asiaa tutkittiin antamalla rotille ravintoa mahaletkun kautta korvaamaan vähentynyttä syöntiä. |
S37 · S41 · S49 · S88 · S109 · S118 · S124 · S131 · S188 · S191 |
Altistusreitin vaikutus | Jos TCDD vaikuttaa keskushermostoon ruokahalua säädellen, onko vaikutus voimakkaampi suoraan aivokammioon annettuna? |
S132 |
Leptiini | Miten TCDD vaikuttaa ruokahalun säätelyyn ob-hiirillä tai Zucker-rotilla, jotka ovat geneettisesti lihavia? Ob-hiiriltä puuttuu ruokahalua hillitsevä leptiinihormoni. Miten leptiini muokkaa TCDD-annosvastetta? Entä muuttaako TCDD-altistus leptiinisäätelyä L-E- tai H/W-rotilla? | |
Risteytyskoe | Han/Wistar-rotat kestävät erityisen paljon TCDD:tä johtuen kahdesta mutaatiosta, kun taas Long-Evans rotilla ei ole kumpaakaan ja ne ovat siksi herkkiä. Toinen on AH-reseptorissa ja toinen tuntemattomassa B-geenissä. Nämä muuttuneet alleelit risteytettiin kahteen uuteen A- ja B-rottakantaan. Lisäksi jalostettiin C-kanta, jossa ei ole muuttuneita alleeleja. |
S187 · S201 · S206 · S209 · S212 · S215 · S216 · S223 · S229 · S230 · S236 · S238 · S242 · S248 · S260 · S275 · S284 · S392 · Risteytyskoe 1988 |
Biliverdiini | Tutkimuksen alkusysäyksenä oli havainto, että B-kannan rotilla voi esiintyä vakavaa tumman pigmentin kertymistä maksaan. Tämä osoittautui biliverdiiniksi ja sen johdoksiksi. Miten TCDD vaikuttaa bilirubiini- ja biliverdiinimetaboliaan? Missä metaboliaketjun vaiheessa häiriö ilmenee, ja miten rottien genetiikka vaikuttaa ilmiön syntymiseen? |
S256 · S266 · S271 · S279 · S311 · S324 · S325 · S326 · S349 |
Kestävyys ja sen kehitys | Miten TCDD-kestävyys kehittyy rotanpennuilla? Entä miten se vaikuttaa sukupuolielimistöön? |
S222 · S224 · S241 · S246 · S259 · S267 · S277 · S282 · S289 · S292 |
Insuliini ja glukoosi | TCDD aiheuttaa rotilla lisääntynyttä herkkyyttä insuliinille ja hypoglykemiaa. Lisäksi glukoneogeneesi eli sokerin valmistaminen proteiineista on vähentynyt. Selittääkö tämän näivetysoireyhtymää? Insuliinin ja glukoosin roolia tutkittiin näillä kokeilla. |
S72 · S172 · S178 |
Rasvahapot | TCDD aiheuttaa rotilla näivetysoireyhtymän eli ruumiinpainon säätötaso laskee pysyvästi. Samalla rottien rasvakudos vähenee. Onko tällä ilmiöllä vaikutusta eri rasvahappojen suhteisiin eri elimissä ja onko sillä kokonaisuuden kannalta merkitystä? Näissä kokeissa mitattiin rasvahappopitoisuuksia maksasta, plasmasta ja rasvakudoksesta TCDD-herkillä ja -kestävillä rotilla. |
S158 · S168 |