Ero sivun ”TCDD-koe S217 ym.” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
Ei muokkausyhteenvetoa
(removed Original file url)
 
(14 välissä olevaa versiota 2 käyttäjän tekeminä ei näytetä)
Rivi 1: Rivi 1:
{{tutkimus|moderator=Pauli}}
== Kokeet ==
== Kokeet ==


<t2b index="Kuvaus" unit="#" obs="Tulos" name="Koe S217">
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)  
Sarja numero|S217
Sarja numero|S217
Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste
Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|35661
Koesuunnitelman päiväys|19.8.1997
Koe-eläinluvan numero|
Koe-eläinluvan numero|
Aine|TCDD (µg/kg)
Aine|TCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|35668
Altistuspäivä(pvä0)|26.8.1997
Annos|0
Annos|0
Annos|0,03
Annos|0.03
Annos|0,1
Annos|0.1
Annos|0,3
Annos|0.3
Annos|1
Annos|1
Annos|3
Annos|3
Rivi 24: Rivi 26:
Koe päättyy|35676
Koe päättyy|35676
Laji|Rotta
Laji|Rotta
Kanta|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|41
Lukumäärä|41
Rivi 30: Rivi 32:
Luovutusnumero|9721, 9722
Luovutusnumero|9721, 9722
Ryhmät ja lkm|0(4kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(4kpl), 100(4kpl)
Ryhmät ja lkm|0(4kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(4kpl), 100(4kpl)
Kanta|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|40
Lukumäärä|40
Rivi 53: Rivi 55:
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näytekuvaus|Mitä
Näyte|Maksa
Näyte1|Maksa
Näyte|Thymus
Säilytys|-80
Näyte|Alaleuka
Määritys|EROD
Original file URL|http://ytoswww/yhteiset/YTO/TCDD/s217s226s227_Johdoskoe/Data/JOHDOSdata9.xls
Näyte2|Thymus
Säilytys|-
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
</t2b>
</t2b>


<t2b index="Kuvaus" unit="#" obs="Tulos" name="Koe S217b">
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217b">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Rivi 69: Rivi 76:
Aine|TCDD (µg/kg)
Aine|TCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|WW ryhmät 1-5 18.5.98, WW ryhmät 6-9 19.5.98, LE 2.6.98
Altistuspäivä(pvä0)|WW ryhmät 1-5 18.5.1998, WW ryhmät 6-9 19.5.1998, LE 2.6.1998
Annos|0
Annos|0
Annos|0,03
Annos|0.03
Annos|0,1
Annos|0.1
Annos|0,3
Annos|0.3
Annos|1
Annos|1
Annos|3
Annos|3
Rivi 112: Rivi 119:
Näytekuvaus|Mitä
Näytekuvaus|Mitä
Näyte|
Näyte|
Original file URL|http://ytoswww/yhteiset/YTO/TCDD/s217s226s227_Johdoskoe/Data/JOHDOSdata9.xls
</t2b>
</t2b>


<t2b index="Kuvaus" unit="#" obs="Tulos" name="Koe S226">
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S226">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Rivi 121: Rivi 127:
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|35718
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero| -
Koe-eläinluvan numero| -
Aine|PeCDD (µg/kg)
Aine|PeCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|4.11.1997(WW:t), 25.11.1997(LE:t)
Altistuspäivä(pvä0)|4.11.1997 (WW:t), 25.11.1997 (LE:t)
Annos|0
Annos|0
Annos|0,01
Annos|0.01
Annos|0,3
Annos|0.3
Annos|1
Annos|1
Annos|3
Annos|3
Rivi 151: Rivi 157:
Ryhmät ja lkm| -
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n.5
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini    punn. 0, 3, 6, 8
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte2|Thymus
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>
 
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S227">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S227
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:heksa
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero|
Aine|HxCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|9.12.1997 (LE:t), 31.12.1997 (WW:t)
Annos|0
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Annos|300
Annos|1000
Koe alkaa|35768
Koe päättyy|35803
Laji|Rotta
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|46
Ikä kokeen alussa (vko)|16(23kpl), 15(13kpl), 13(10kpl)
Luovutusnumero|9735, 9736, 9738
Ryhmät ja lkm| -
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|48
Ikä kokeen alussa (vko)|15(29kpl), 14(19kpl)
Luovutusnumero|9735, 9736
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini    punn. 0, 3, 6, 8
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte2|Thymus
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>
 
<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S228">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S228
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:hepta
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero| -
Aine|HpCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|30.12.1997 (LE:t), 11.2.1998 (WW:t)
Annos|0
Annos|0.01
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Annos|300
Annos|1000
Annos|3000
Koe alkaa|35782
Koe päättyy|35846
Laji|Rotta
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|60
Ikä kokeen alussa (vko)|16(30kpl), 15(10kpl), 15(20kpl)(täydennyskoe)
Luovutusnumero|9744, 9745, 9750(täydennyskoe)
Ryhmät ja lkm| -
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|57
Ikä kokeen alussa (vko)|18(6kpl), 16(29kpl), 17(22kpl)
Luovutusnumero|9735, 9737, 9743
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistuspäivän ikä|
Rivi 167: Rivi 307:
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näytekuvaus|Mitä
Näyte|Maksa
Näyte1|Maksa
Näyte|Thymus
Säilytys|-80
Näyte|Alaleuka
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte|Seerumi x2
Näyte2|Thymus
Original file URL|http://ytoswww/yhteiset/YTO/TCDD/s217s226s227_Johdoskoe/Data/JOHDOSdata9.xls
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>
</t2b>


== Muuttujat ==
== Muuttujat ==


<t2b index="Järjestys, Tunniste, Kuvaus, Huomautuksia, Esimerkkiarvoja" unit="-" obs="Puuttuvat" name="Muuttujat">
1|Tunniste|Kokeen tunnistekoodi||S217, S217b, S226, S227 tai S228|ei puuttuvia
2|Nro|Rotan koenumero||1, 2, 3, ...|ei puuttuvia
3|Kanta|Rotan kanta||LE tai WW|ei puuttuvia
4|SP|Rotan sukupuoli|uros tai naaras, vain naaraita|U tai N|ei puuttuvia
5|Aine|Rotalle annettu aine||TCDD, PeCDD, HxCDD tai HpCDD|ei puuttuvia
6|Annos|Annetun aineen määrä|µg/kg, 13 eri annoskokoa: 0 - 3000|0.3|ei puuttuvia
7|Ryhmä|Ruokintaryhmä||1, 2, …, 9|390 kpl, vain tunnisteelle S217b
8|Paino-3|Paino pvä-3|g||132 kpl, kaikki S217 + loput S217b
9|Paino0|Paino pvä0|g||ei puuttuvia
10|Paino3|Paino pvä3|g||51 kpl, tunnisteelta S217b
11|Paino6|Paino pvä6|g||51 kpl, tunnisteelta S217b
12|Paino8|Paino pvä8|g||ei puuttuvia
13|PainoThy|Thymuksen(kateenkorvan) paino|g||ei puuttuvia
14|LivEROD|Liver EROD activity - Maksan EROD aktiivisuus|pmol/mg*min||12 kpl
15|S-T4|Serum T4 Concentration - Seerumin T4(tyroksiini) pitoisuus|nmol/l||179 kpl, tunnisteelta S217 ja S226
16|TootErup|Tooth Eruption - Hampaan puhkeaminen||0, 0.5 tai 1|81 kpl, tunnisteelta S217
17|S-FFA|Serum FFA Concentration - Hampaan FFA pitoisuus|mmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217
18|S-bil|Serum Tot. Bilirubin Concentration - Seerumin bilirubiinin kokonaispitoisuus|µmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217
19|S-ASAT|Serum ASAT Activity - Seerumin ASAT aktiivisuus|U/l||81 kpl, tunnisteelta S217
20|MSOITD|Mean severity of incisor tooth defects||0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3 tai T|87 kpl = 6 + kaikki tunnisteelta S217
</t2b>


Muuttujien välisiä yhteyksiä ja muita huomioita:
*Kokeissa S217 ja S217b annettu aine on TCDD, kokeessa S226 PeCDD, kokeessa S227 HxCDD ja kokeessa S228 HpCDD.
*Aineella HpCDD erilaisia annoskokoja on 11, muilla 9 kpl.


== Data ==
== Data ==
{{tuloslinkki}}
Taulukosta ilmenee kokeiden tulokset (ruumiinpaino eri aikoina sekä kateenkorvan paino, maksan EROD-arvo, S-T4, S-FFA, S-bil, S-ASAT ja MSOITD kokeen lopussa).
Voit halutessasi ladata kaiken datan itsellesi käyttäen ilmaista R-ohjelmointikieltä. Asenna tietokoneellesi R-ohjelmisto ja OpasnetUtils-paketti [https://cran.r-project.org/ CRAN:ista], käynnistä R ja aja seuraava koodi:
library(OpasnetUtils)
dat <- opbase.data("Op_fi5507", subset = "data") # Page [[TCDD-koe S217 ym.]]
<!-- __OBI_TS:1467017328 -->
== Katso myös ==
{{TCDD-kokeet}}

Nykyinen versio 22. elokuuta 2016 kello 11.14




Kokeet

Koe S217(-)
ObsKuvausTulos
1KirjaimistoASCII ISO-8859-1
2TiedostomuotoTXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
3Sarja numeroS217
4Kuvaileva nimiEROD-annosvaste
5VastuuhenkilöMatti Viluksela
6Koesuunnitelman päiväys19.8.1997
7Koe-eläinluvan numero
8AineTCDD (µg/kg)
9Antotapamaissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
10Altistuspäivä(pvä0)26.8.1997
11Annos0
12Annos0.03
13Annos0.1
14Annos0.3
15Annos1
16Annos3
17Annos10
18Annos30
19Annos100
20Koe alkaa35662
21Koe päättyy35676
22LajiRotta
23Kanta1HW (Han/Wistar (Kuopio))
24SukupuoliNaaras
25Lukumäärä41
26Ikä kokeen alussa (vko)14(37kpl), 13(4kpl
27Luovutusnumero9721, 9722
28Ryhmät ja lkm0(4kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(4kpl), 100(4kpl)
29Kanta2LE (Long-Evans (Turku A/B))
30SukupuoliNaaras
31Lukumäärä40
32Ikä kokeen alussa (vko)15(22kpl), 14(12kpl), 13(6kpl)
33Luovutusnumero9720, 9721, 9722
34Ryhmät ja lkm0(5kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(5kpl), 100(0kpl)
35HäkkityyppiRyhmä-RST-häkki
36Eläimiä per häkki5
37Totutusaika (vko)
38Altistuspäivän ikä
39Altistajan nimi
40Lopetus TCDDn annosta (pvä)
41Annosteluaika (klo)
42Eläinhuone
43ValorytmiValot päällä 7.00 - 19.00
44RehuR36-jauherehu
45VesiVapaasti hanavesi
46Lämpötila21 ± 1 °C
47Kosteus50 ± 10 %
48Kokeen idea lyhyestiRotat RST-ryhmähäkeissä. 8pv altistuksesta lopetus tutkitaan EROD-induktiota pienillä annoksilla
49Toimenpiteet kokeen aikanaLopetuksessa katsotaan hammasviirut ja thymuksen paino. Näytteeksi maksa ja alaleuka
50Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät -
51NäytekuvausMitä
52Näyte1Maksa
53Säilytys-80
54MääritysEROD
55Näyte2Thymus
56Säilytys-
57MääritysPaino
58Näyte3Alaleuka
59SäilytysFormaliini
60MääritysHistologia
Koe S217b(-)
ObsKuvausTulos
1KirjaimistoASCII ISO-8859-1
2TiedostomuotoTXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
3Sarja numeroS217b
4Kuvaileva nimiEROD-annosvaste (täydennyskoe)
5VastuuhenkilöMatti Viluksela
6Koesuunnitelman päiväys - (tästä kokeesta ei erillistä koesuunnitelmaa)
7Koe-eläinluvan numero -
8AineTCDD (µg/kg)
9Antotapamaissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
10Altistuspäivä(pvä0)WW ryhmät 1-5 18.5.1998, WW ryhmät 6-9 19.5.1998, LE 2.6.1998
11Annos0
12Annos0.03
13Annos0.1
14Annos0.3
15Annos1
16Annos3
17Annos10
18Annos30
19Annos100
20Koe alkaa35930
21Koe päättyy35956
22LajiRotta
23KantaHW (Han/Wistar (Kuopio))
24SukupuoliNaaras
25Lukumäärä51
26Ikä kokeen alussa (vko)14(22kpl), 13(29kpl)
27Luovutusnumero9807, 9808
28Ryhmät ja lkm5eläintä/annosteluryhmä
29KantaLE (Long-Evans (Turku A/B))
30SukupuoliNaaras
31Lukumäärä41
32Ikä kokeen alussa (vko)14(27kpl), 13(14kpl)
33Luovutusnumero9809, 9810
34Ryhmät ja lkm4-5eläintä/annosteluryhmä
35HäkkityyppiRyhmä-RST-häkki
36Eläimiä per häkki5
37Totutusaika (vko)
38Altistuspäivän ikä
39Altistajan nimi
40Lopetus TCDDn annosta (pvä)
41Annosteluaika (klo)
42Eläinhuone
43ValorytmiValot päällä 7.00 - 19.00
44RehuR36-jauherehu
45VesiVapaasti hanavesi
46Lämpötila21 ± 1 °C
47Kosteus50 ± 10 %
48Kokeen idea lyhyesti -
49Toimenpiteet kokeen aikana -
50Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät -
51NäytekuvausMitä
52Näyte
Koe S226(-)
ObsKuvausTulos
1KirjaimistoASCII ISO-8859-1
2TiedostomuotoTXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
3Sarja numeroS226
4Kuvaileva nimi"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta
5VastuuhenkilöMatti Viluksela
6Koesuunnitelman päiväys15.10.1997
7Koe-eläinluvan numero -
8AinePeCDD (µg/kg)
9Antotapamaissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
10Altistuspäivä(pvä0)4.11.1997 (WW:t), 25.11.1997 (LE:t)
11Annos0
12Annos0.01
13Annos0.3
14Annos1
15Annos3
16Annos10
17Annos30
18Annos100
19Annos300
20Koe alkaa35733
21Koe päättyy35767
22LajiRotta
23KantaHW (Han/Wistar (Kuopio))
24SukupuoliNaaras
25Lukumäärä51
26Ikä kokeen alussa (vko)15(31kpl), 14(10kpl), 15(10kpl)(täydennyskoe)
27Luovutusnumero9730, 9731, 9750(täydennyskoe)
28Ryhmät ja lkm -
29KantaLE (Long-Evans (Turku A/B))
30SukupuoliNaaras
31Lukumäärä47
32Ikä kokeen alussa (vko)15(11kpl), 14(36kpl)
33Luovutusnumero9733, 9734
34Ryhmät ja lkm -
35HäkkityyppiRyhmä-RST-häkki
36Eläimiä per häkkin. 5
37Totutusaika (vko)
38Altistuspäivän ikä
39Altistajan nimi
40Lopetus TCDDn annosta (pvä)
41Annosteluaika (klo)
42Eläinhuone
43ValorytmiValot päällä 7.00 - 19.00
44RehuR36-jauherehu
45VesiVapaasti hanavesi
46Lämpötila21 ± 1 °C
47Kosteus50 ± 10 %
48Kokeen idea lyhyestiRotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
49Toimenpiteet kokeen aikanaKoe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8
50Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät -
51NäytekuvausMitä
52Näyte1Maksa
53Säilytys-80
54MääritysEROD+loppumassa
55Näyte2Thymus
56Säilytys
57MääritysPaino
58Näyte3Alaleuka
59SäilytysFormaliini
60MääritysHistologia
61Näyte4Seerumi x2
62Säilytys-80
63Määritysbil. vara
Koe S227(-)
ObsKuvausTulos
1KirjaimistoASCII ISO-8859-1
2TiedostomuotoTXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
3Sarja numeroS227
4Kuvaileva nimi"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:heksa
5VastuuhenkilöMatti Viluksela
6Koesuunnitelman päiväys15.10.1997
7Koe-eläinluvan numero
8AineHxCDD (µg/kg)
9Antotapamaissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
10Altistuspäivä(pvä0)9.12.1997 (LE:t), 31.12.1997 (WW:t)
11Annos0
12Annos0.3
13Annos1
14Annos3
15Annos10
16Annos30
17Annos100
18Annos300
19Annos1000
20Koe alkaa35768
21Koe päättyy35803
22LajiRotta
23Kanta1HW (Han/Wistar (Kuopio))
24SukupuoliNaaras
25Lukumäärä46
26Ikä kokeen alussa (vko)16(23kpl), 15(13kpl), 13(10kpl)
27Luovutusnumero9735, 9736, 9738
28Ryhmät ja lkm -
29Kanta2LE (Long-Evans (Turku A/B))
30SukupuoliNaaras
31Lukumäärä48
32Ikä kokeen alussa (vko)15(29kpl), 14(19kpl)
33Luovutusnumero9735, 9736
34Ryhmät ja lkm -
35HäkkityyppiRyhmä-RST-häkki
36Eläimiä per häkkin. 5
37Totutusaika (vko)
38Altistuspäivän ikä
39Altistajan nimi
40Lopetus TCDDn annosta (pvä)
41Annosteluaika (klo)
42Eläinhuone
43ValorytmiValot päällä 7.00 - 19.00
44RehuR36-jauherehu
45VesiVapaasti hanavesi
46Lämpötila21 ± 1 °C
47Kosteus50 ± 10 %
48Kokeen idea lyhyestiRotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
49Toimenpiteet kokeen aikanaKoe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8
50Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät -
51NäytekuvausMitä
52Näyte1Maksa
53Säilytys-80
54MääritysEROD+loppumassa
55Näyte2Thymus
56Säilytys
57MääritysPaino
58Näyte3Alaleuka
59SäilytysFormaliini
60MääritysHistologia
61Näyte4Seerumi x2
62Säilytys-80
63Määritysbil. vara
Koe S228(-)
ObsKuvausTulos
1KirjaimistoASCII ISO-8859-1
2TiedostomuotoTXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
3Sarja numeroS228
4Kuvaileva nimi"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:hepta
5VastuuhenkilöMatti Viluksela
6Koesuunnitelman päiväys15.10.1997
7Koe-eläinluvan numero -
8AineHpCDD (µg/kg)
9Antotapamaissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
10Altistuspäivä(pvä0)30.12.1997 (LE:t), 11.2.1998 (WW:t)
11Annos0
12Annos0.01
13Annos0.3
14Annos1
15Annos3
16Annos10
17Annos30
18Annos100
19Annos300
20Annos1000
21Annos3000
22Koe alkaa35782
23Koe päättyy35846
24LajiRotta
25Kanta1HW (Han/Wistar (Kuopio))
26SukupuoliNaaras
27Lukumäärä60
28Ikä kokeen alussa (vko)16(30kpl), 15(10kpl), 15(20kpl)(täydennyskoe)
29Luovutusnumero9744, 9745, 9750(täydennyskoe)
30Ryhmät ja lkm -
31Kanta2LE (Long-Evans (Turku A/B))
32SukupuoliNaaras
33Lukumäärä57
34Ikä kokeen alussa (vko)18(6kpl), 16(29kpl), 17(22kpl)
35Luovutusnumero9735, 9737, 9743
36Ryhmät ja lkm -
37HäkkityyppiRyhmä-RST-häkki
38Eläimiä per häkkin. 5
39Totutusaika (vko)
40Altistuspäivän ikä
41Altistajan nimi
42Lopetus TCDDn annosta (pvä)
43Annosteluaika (klo)
44Eläinhuone
45ValorytmiValot päällä 7.00 - 19.00
46RehuR36-jauherehu
47VesiVapaasti hanavesi
48Lämpötila21 ± 1 °C
49Kosteus50 ± 10 %
50Kokeen idea lyhyestiRotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
51Toimenpiteet kokeen aikanaKoe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini punn. 0, 3, 6, 8
52Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät -
53NäytekuvausMitä
54Näyte1Maksa
55Säilytys-80
56MääritysEROD+loppumassa
57Näyte2Thymus
58Säilytys
59MääritysPaino
60Näyte3Alaleuka
61SäilytysFormaliini
62MääritysHistologia
63Näyte4Seerumi x2
64Säilytys-80
65Määritysbil. vara

Muuttujat

Muuttujat(-)
ObsJärjestys Tunniste Kuvaus Huomautuksia EsimerkkiarvojaPuuttuvat
11TunnisteKokeen tunnistekoodiS217, S217b, S226, S227 tai S228ei puuttuvia
22NroRotan koenumero1, 2, 3, ...ei puuttuvia
33KantaRotan kantaLE tai WWei puuttuvia
44SPRotan sukupuoliuros tai naaras, vain naaraitaU tai Nei puuttuvia
55AineRotalle annettu aineTCDD, PeCDD, HxCDD tai HpCDDei puuttuvia
66AnnosAnnetun aineen määräµg/kg, 13 eri annoskokoa: 0 - 30000.3ei puuttuvia
77RyhmäRuokintaryhmä1, 2, …, 9390 kpl, vain tunnisteelle S217b
88Paino-3Paino pvä-3g132 kpl, kaikki S217 + loput S217b
99Paino0Paino pvä0gei puuttuvia
1010Paino3Paino pvä3g51 kpl, tunnisteelta S217b
1111Paino6Paino pvä6g51 kpl, tunnisteelta S217b
1212Paino8Paino pvä8gei puuttuvia
1313PainoThyThymuksen(kateenkorvan) painogei puuttuvia
1414LivERODLiver EROD activity - Maksan EROD aktiivisuuspmol/mg*min12 kpl
1515S-T4Serum T4 Concentration - Seerumin T4(tyroksiini) pitoisuusnmol/l179 kpl, tunnisteelta S217 ja S226
1616TootErupTooth Eruption - Hampaan puhkeaminen0, 0.5 tai 181 kpl, tunnisteelta S217
1717S-FFASerum FFA Concentration - Hampaan FFA pitoisuusmmol/l81 kpl, tunnisteelta S217
1818S-bilSerum Tot. Bilirubin Concentration - Seerumin bilirubiinin kokonaispitoisuusµmol/l81 kpl, tunnisteelta S217
1919S-ASATSerum ASAT Activity - Seerumin ASAT aktiivisuusU/l81 kpl, tunnisteelta S217
2020MSOITDMean severity of incisor tooth defects0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3 tai T87 kpl = 6 + kaikki tunnisteelta S217

Muuttujien välisiä yhteyksiä ja muita huomioita:

  • Kokeissa S217 ja S217b annettu aine on TCDD, kokeessa S226 PeCDD, kokeessa S227 HxCDD ja kokeessa S228 HpCDD.
  • Aineella HpCDD erilaisia annoskokoja on 11, muilla 9 kpl.

Data

{{#opasnet_base_link:Op_fi5507}}


Taulukosta ilmenee kokeiden tulokset (ruumiinpaino eri aikoina sekä kateenkorvan paino, maksan EROD-arvo, S-T4, S-FFA, S-bil, S-ASAT ja MSOITD kokeen lopussa).

Voit halutessasi ladata kaiken datan itsellesi käyttäen ilmaista R-ohjelmointikieltä. Asenna tietokoneellesi R-ohjelmisto ja OpasnetUtils-paketti CRAN:ista, käynnistä R ja aja seuraava koodi:

library(OpasnetUtils)
dat <- opbase.data("Op_fi5507", subset = "data") # Page TCDD-koe S217 ym.


Katso myös

TCDD-kokeet
Hankkeen nimi Kuvaus Kokeet
Kokeiden luettelo Luettelo TCDD-projektin tekemistä kokeista (ns. S-sarjat) löytyy englanninkielisestä Opasnetistä. Kaikki
Motiliteetti Vaikuttaako TCDD eläinten motiliteettiin eli liikkumiskäyttäytymiseen? Miten? Asiaa tutkittiin häkin pohjalla olevalla kosketusherkällä levyllä useiden vuorokausien seurannassa.

S36 · S40 · S117

Aivoleesiot ja syöminen Miten aivojen syömiskeskusten manipulointi vaikuttaa TCDD:n aiheuttamaan syömisen vähenemiseen ja näivetysoireyhtymään? Asiaa tutkittiin tekemällä pieniä vaurioita hypotalamuksen tumakkeisiin.

S78 · S84 · S106 · S125 · S128 · S141 · S144 · S151 · S174 · S196 · Valjakka et al.

Tuumoripromootio Onko TCDD initiaattori vai promoottori syövän aiheuttajana? Asiaa tutkittiin antamalla rotille maksimi-initiaatio syöpää aiheuttavia tekijöitä maksaan ja sitten seurattiin TCDD:n vaikutusta maksasyövän ilmaantumiseen 6 kk:n aikana. S186
Dioksiinien annosvaste Millaisia annosvasteita dioksiineilla on erilaisille vasteille Han/Wistar- ja Long-Evans-rottakannoilla? Ovatko eri johdokset keskenään samanlaisia toksisuusekvivalentteina mitattuna? Asiaa tutkittiin tekemällä annosvastekokeita useilla eri johdoksilla.

S62 · S64 · S83 · S87 · S137 · S149 · S192 · S217, S217b, S226, S227, S228

Suklaakokeet Miten erilaiset ruoka-aineet muokkaavat TCDD:n aiheuttamia muutoksia syömiskäyttäytymisessä? Liittyykö TCDD-vaikutus erityisesti johonkin ravintoaineeseen kuten proteiiniin, rasvaan tai hiilihydraatteihin? Asiaa tutkittiin useissa kokeissa, joissa TCDD-altistetuille rotille annettiin syötäväksi muutakin kuin perusrehua. Usein se oli suklaata, koska se kelpasi rotille ja oli helppo mitata tarkasti.

S113 · S239 · S240 · S243 · S250 · S251‎ · S252‎ · S253‎ · S254 · S261, S262, S264 · S263‎ · S269‎ · S270‎ · S273 · S276 · S278‎ · S280‎

Letkuruokinta Estääkö letkuruokinta näivetysoireyhtymää? Näin voisi olla, jos näivetysoireyhtymä on ensisijaisesti syömiskäyttäytymisen muutos ja haitat johtuvat energianpuutteesta. Asiaa tutkittiin antamalla rotille ravintoa mahaletkun kautta korvaamaan vähentynyttä syöntiä.

S37 · S41 · S49 · S88 · S109 · S118 · S124 · S131 · S188 · S191

Altistusreitin vaikutus Jos TCDD vaikuttaa keskushermostoon ruokahalua säädellen, onko vaikutus voimakkaampi suoraan aivokammioon annettuna?

S132

Leptiini Miten TCDD vaikuttaa ruokahalun säätelyyn ob-hiirillä tai Zucker-rotilla, jotka ovat geneettisesti lihavia? Ob-hiiriltä puuttuu ruokahalua hillitsevä leptiinihormoni. Miten leptiini muokkaa TCDD-annosvastetta? Entä muuttaako TCDD-altistus leptiinisäätelyä L-E- tai H/W-rotilla?

S164 · S183 · S213 · ZUCKER

Risteytyskoe Han/Wistar-rotat kestävät erityisen paljon TCDD:tä johtuen kahdesta mutaatiosta, kun taas Long-Evans rotilla ei ole kumpaakaan ja ne ovat siksi herkkiä. Toinen on AH-reseptorissa ja toinen tuntemattomassa B-geenissä. Nämä muuttuneet alleelit risteytettiin kahteen uuteen A- ja B-rottakantaan. Lisäksi jalostettiin C-kanta, jossa ei ole muuttuneita alleeleja.

S187 · S201 · S206 · S209 · S212 · S215 · S216 · S223 · S229 · S230 · S236 · S238 · S242 · S248 · S260 · S275 · S284 · S392 · Risteytyskoe 1988

Biliverdiini Tutkimuksen alkusysäyksenä oli havainto, että B-kannan rotilla voi esiintyä vakavaa tumman pigmentin kertymistä maksaan. Tämä osoittautui biliverdiiniksi ja sen johdoksiksi. Miten TCDD vaikuttaa bilirubiini- ja biliverdiinimetaboliaan? Missä metaboliaketjun vaiheessa häiriö ilmenee, ja miten rottien genetiikka vaikuttaa ilmiön syntymiseen?

S256 · S266 · S271 · S279 · S311 · S324 · S325 · S326 · S349

Kestävyys ja sen kehitys Miten TCDD-kestävyys kehittyy rotanpennuilla? Entä miten se vaikuttaa sukupuolielimistöön?

S222 · S224 · S241 · S246 · S259 · S267 · S277 · S282 · S289 · S292

Insuliini ja glukoosi TCDD aiheuttaa rotilla lisääntynyttä herkkyyttä insuliinille ja hypoglykemiaa. Lisäksi glukoneogeneesi eli sokerin valmistaminen proteiineista on vähentynyt. Selittääkö tämän näivetysoireyhtymää? Insuliinin ja glukoosin roolia tutkittiin näillä kokeilla.

S72 · S172 · S178

Rasvahapot TCDD aiheuttaa rotilla näivetysoireyhtymän eli ruumiinpainon säätötaso laskee pysyvästi. Samalla rottien rasvakudos vähenee. Onko tällä ilmiöllä vaikutusta eri rasvahappojen suhteisiin eri elimissä ja onko sillä kokonaisuuden kannalta merkitystä? Näissä kokeissa mitattiin rasvahappopitoisuuksia maksasta, plasmasta ja rasvakudoksesta TCDD-herkillä ja -kestävillä rotilla.

S158 · S168