Ero sivun ”Keskustelu:Pneumokokkirokotteen hankinta kansalliseen rokotusohjelmaan” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
Ei muokkausyhteenvetoa
Rivi 63: Rivi 63:
| Timo || Pneukokokkirokotemalli ([[Epidemiologinen malli]], osat Funktioiden alustus ja Data) pitäisi siirtää englanninkieliselle puolelle. Päämallin pitäisi olla englanniksi ja niitä ovariableja kutsutaan sitten myös suomenkielisellä puolella kohdassa ''Laskenta''. Pitäisi miettiä miten kieliversiot sujuvimmin toimisivat. ||
| Timo || Pneukokokkirokotemalli ([[Epidemiologinen malli]], osat Funktioiden alustus ja Data) pitäisi siirtää englanninkieliselle puolelle. Päämallin pitäisi olla englanniksi ja niitä ovariableja kutsutaan sitten myös suomenkielisellä puolella kohdassa ''Laskenta''. Pitäisi miettiä miten kieliversiot sujuvimmin toimisivat. ||
|----
|----
| Timo || Kohdan Laskenta koodissa on alkuosa vanhaa koodia, joka ei hyödynnä ovariableja. Tämä pitäisi kommentoida pois ja rakentaa ovariableja käyttäen koodi, joka tekee saman asian. Tarkoituksena on siis siirtyä kokonaan ovariablepohjaiseen koodaukseen pois noista alkuperäisen koodin matriiseista, joiden ulottuvuudet ja koot eivät ole säädettävissä ilman koodin uudelleenkirjoitusta.||
| Timo || Kohdan Laskenta koodissa on alkuosa vanhaa koodia, joka ei hyödynnä ovariableja. Tämä pitäisi kommentoida pois ja rakentaa ovariableja käyttäen koodi, joka tekee saman asian. Tarkoituksena on siis siirtyä kokonaan ovariablepohjaiseen koodaukseen pois noista alkuperäisen koodin matriiseista, joiden ulottuvuudet ja koot eivät ole säädettävissä ilman koodin uudelleenkirjoitusta. {{comment|# | Nykyversiosta tarvitaan vain ovariablet VacCar ja VacIPD. Muut funktiot voi poistaa, koska nyt ei lasketa optimikompositioita missään vaiheessa. Myös funktio Vaccination on nykyversiossa turha, koska vastaava koodi on nyt ovariableissa VacCar ja VacIPD. | }}||
|}
|}



Versio 26. kesäkuuta 2014 kello 10.00

Aikataulu

  • 23.6.2014 Kustannusvaikuttavuusmalli pitäisi kuvata sillä tarkkuudella, että siitä voidaan keskustella.
  • 25.6. Projektikokous ja tilannetarkastelu. Päätös keskustelun avaamisesta.
  • 26.6. Avoimen keskustelun markkinointi ja moderointi alkaa. Kohderyhmät:
    • Suomalaiset ja ulkomaiset pneumokokkiasiantuntijat (Heini tekee listan)
    • Vanha ja uusi kansallinen rokoteasiantuntijaryhmä KRAR.
    • Lehdistö (tehtävä lehtistötiedote)
    • THL:n omat nettisivut, blogit ym. Kuka kirjoittaa blogin? Blogin voisi ajoittaa heinäkuun puoliväliin, jolloin keskustelua on jo käytynä mutta on vielä aikaa osallistua.
    • Avoimen hallinnon yhteisö (VNK, VM, Avoin Ministeriö, OKF, Verkkodemokratiaseura ym. )
    • Potilas- ja rokotejärjestöt (kuka kerää listan?)
    • Pitäisikö keskustelua sopivasta €/QALY-rajasta käydä laajemminkin sosiaali- ja terveydenhuollon piirissä? Pitäisikö lähestyä terveystaloustieteilijöitä tai sairaanhoitopiirejä yleensä?


Lehdistötiedote 26.6.2014

Helsingissä 26.6.2014

Avoin keskustelu pneumokokkirokotteen hankintaperusteista alkaa

Terveyden ja hyvinvoinnin laitos järjestää avoimen verkkokeskustelun pikkulasten kansalliseen rokotusohjelmaan kuuluvan pneumokokkikonjugaattirokotteen hankintaperusteista. Keskustelu käydään kesän 2014 aikana Opasnet-verkkotyötilassa ja lopputulos esitellään suosituksena kansalliselle rokotusasiantuntijaryhmälle syyskuun alussa. Keskusteluun toivotaan liittyvän sekä alan asiantuntijoita että tavallisia kansalaisia.

Keskustelun avulla pyritään ratkaisemaan seuraava kysymys: "Millä perusteilla pitäisi hankkia kansallisen rokotusohjelman mukainen lasten pneumokokkirokote?" Mahdollisia valintakriteereitä ovat esimerkiksi hinta, teho ja turvallisuus. Opasnetissä esitellään markkinoilla olevat rokotteet ja niiden ominaisuudet. Sivustolla selitetään myös tärkeitä rokotevalintaan vaikuttavia tekijöitä, kuten serotyyppien korvautumista, niin että ne ovat helposti ymmärrettävissä. THL:n rokoteasiantuntijat ylläpitävät sivuja yhdessä avoimeen wikityöskentelyyn tottuneiden nuorten kanssa.

Näin avoin ja yksityiskohtainen keskustelu jo hankintaprosessin valmisteluvaiheessa on hyvin poikkeuksellista rokotehankinnassa tai muussakaan valtion hankintavalmistelussa. "Rokotehankinnat herättävät tunteita ja kiistoja. Haluamme kuulla ihmisiä mutta samalla varmistaa, että faktat ovat oikein. Uskomme, että avoin, kriittinen prosessi auttaa meitä tässä", sanoo ylijohtaja Terhi Kilpi THL:stä.

Kuka tahansa saa osallistua keskusteluun ja sisällön tuottamiseen. Keskusteluun odotetaan liittyvän alan asiantuntijoita esimerkiksi terveydenhoito- ja tutkimussektorilta sekä lääkeyrityksistä, mutta mielipiteitä kaivataan myös tavallisilta kansalaisilta. Jokainen kommentti sisällytetään keskusteluun, jota valvovat moderaattoreina toimivat nuoret. Moderaattorien tehtävä on saada jokaisen mielipide edustetuksi, oli se sitten puolesta tai vastaan. Kuitenkin jokainen kommentti myös joutuu kriittisen arvioinnin kohteeksi ja perusteettomat hylätään. Tavoitteena on jaettu ymmärrys siitä, mistä asioista ollaan yhtä mieltä, mistä eri mieltä ja miksi.

Opasnet on THL:n ylläpitämä wiki-pohjainen sivusto, jota kuka tahansa saa muokata. Opasnetin tarkoituksena on edistää tieteeseen perustuvaa yhteiskunnallista päätöksentekoa. Opasnet toimii kahdella kielellä, suomeksi ja englanniksi.

Yhteystiedot: ylilääkäri Hanna Nohynek, johtava tutkija Jouni Tuomisto, THL

puhelin: 029 524 8246 (Nohynek) 029 524 6305 (Tuomisto)

sähköposti etunimi.sukunimi@thl.fi

Keskustelusivusto: http://fi.opasnet.org/fi/Pneumokokkirokote

⇤--#: . Voiko sanoa, että "Opasnet on THL:n ylläpitämä wiki-pohjainen sivusto" ilman, että THL:stä ylempä joku tulee valittamaan siitä? Koska eihän THL oikeastaan ylläpidä sitä, vaan pieni porukka yhdessä yksikössä, josta ei ole kun muutama ihminen jäljellä. Lisäksi mietin että saako "nuoret" tämän kuulostamaan puuhastelulta? Tätä kuudetta kesää tekevänä tiedän kyllä että nuoret osaa tehä paljonkin, mutta kuten joskus monta vuotta sitten mietittiin, ihmiset ei osaa ajatella että nuoret voisi päästää vielä tekemään mitään tärkeää. Niinkuin valtakunnallista rokotearviointia. Saatan myös olla väärässä. --Heta (keskustelu) 25. kesäkuuta 2014 kello 12.39 (UTC) (type: truth; paradigms: science: attack)

Toimintaohje seuraaville päiville

----#: . Katso työtehtäviä myös sivulla Keskustelu:Liikenne ja viestintä digitaalisessa Suomessa 2020#Työnjako. --Jouni Tuomisto (keskustelu) 23. kesäkuuta 2014 kello 10.58 (UTC) (type: truth; paradigms: science: comment)

Tekijä Tehtävä Valmis?
Matleena Pneumokokkirokotteen turvallisuus-sivun rakentaminen. Mitä ovat viralliset ja epäviralliset huolenaiheet? DL 25.6.!
Pauli Perustiedot pneumokokkirokotteista (Synflorix ja Prevenor 13) ja nykyisestä rokotusohjelmasta) DL 26.6.!
Pauli Lehdistötiedote pneumokokkikeskustelusta DL 24.6.!
Linkkilista keskeisistä uskottavista rokotussivustoista arvioinnin pääsivulle. DL 26.6.!
Timo, Tuukka Tuntilaskurin rakentaminen Done
Teemu Kustannusvaikuttavuusmallin kääntäminen ovariableiksi.
Tämä data [1] pitäisi ladata sivulle Epidemiologinen malli. Erityisesti kiinnostavat insidenssit, ei niinkään tapausmäärät. Pitäisi saada yhteen taulukkoon, josta sitten voisi imaista R:ään ja piirtää erilaisia kuvaajia.
Timo Pneukokokkirokotemalli (Epidemiologinen malli, osat Funktioiden alustus ja Data) pitäisi siirtää englanninkieliselle puolelle. Päämallin pitäisi olla englanniksi ja niitä ovariableja kutsutaan sitten myös suomenkielisellä puolella kohdassa Laskenta. Pitäisi miettiä miten kieliversiot sujuvimmin toimisivat.
Timo Kohdan Laskenta koodissa on alkuosa vanhaa koodia, joka ei hyödynnä ovariableja. Tämä pitäisi kommentoida pois ja rakentaa ovariableja käyttäen koodi, joka tekee saman asian. Tarkoituksena on siis siirtyä kokonaan ovariablepohjaiseen koodaukseen pois noista alkuperäisen koodin matriiseista, joiden ulottuvuudet ja koot eivät ole säädettävissä ilman koodin uudelleenkirjoitusta. ----#: . Nykyversiosta tarvitaan vain ovariablet VacCar ja VacIPD. Muut funktiot voi poistaa, koska nyt ei lasketa optimikompositioita missään vaiheessa. Myös funktio Vaccination on nykyversiossa turha, koska vastaava koodi on nyt ovariableissa VacCar ja VacIPD. (type: truth; paradigms: science: comment)

Viikkopalaverit pidetään Skypessä maanantaisin kello 12-13(-13.30) (Suomen aikaa).

Työaikasuunnitelmat

Työaikasuunnitelmat kesäviikoille 2014

Nimi/Viikko 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35
Teemu Rintala 35 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40 20-40
Pauli Ordén 30 30 25 30 30 30 30 30 20 20 30 30 30
Timo Koski 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20
Matleena Tuomisto 30 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25
Tuukka Hämynen 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30
Jaakko Örmälä 30 30 25 30 30 30 30 30 0 30 30 0 0
Julia Rintala x x x x x x x x x x x x x
Vilma Sandström x x x x x x x x x x x x x
Jouni Tuomisto 20 20 5 25 5 5 25 5 5 5 25 25 25

Erikoistumissuunnitelma

Tähän listataan sellaisia erillisiä taitoja tai työkaluja, jotka pneumokokkirokotehankkeessa pitää olla ryhmällä hallussa. Tämä toteutetaan niin, että joku perehtyy aiheeseen ensin ja perusteellisemmin, ja kesän aikana kaikki muut voivat kysyä tältä henkilöltä apua ja neuvoja aiheen suhteen. Jos siis tulee vastaan ongelma, aiheeseen erikoistuva selvittää siihen vastauksen eikä se jolla ongelma tuli vastaan. Näin toimien päästään nopeimmin eteenpäin ja ryhmän osaaminen kasvaa tehokkaimmin. Aiheeseen erikoistumiseen kuuluu se, että erikoistuva päivittää aiheen ohjesivua vastaamaan uutta tietoa ja osaamista, jotta muiden on sitten helpompi opetella asia myös.

Lopullisena tavoitteena kuitenkin on, että kaikki laajentavat osaamistaan kaikista aiheista kesän aikana, mutta muiden ei tarvitse edetä yhtä pitkälle ja nopeasti kuin erikoistuvien.

Aiheet (merkkaa oma nimesi sen aiheen kohdalle, johon haluat erikoistua).

Aihe Erikoistuva henkilö Tilanne
Pneumokokkirokote: sivulla mainittuihin artikkeleihin Nurhonen & Auranen 2013 ja 2014 tutustuminen Jaakko ja Pauli Meillä on hyvä yleiskuva asiasta
Pneumokokkirokote#Laskenta: malliin tutustuminen Jaakko Minulla on hyvä yleiskuva asiasta
Tuotosten jäsentäminen Opasnetissä#Sisällön yhdenmukaistaminen: toimintamallin opettelu ja harjoittelu En ole vielä aloittanut
Tuotosten jäsentäminen Opasnetissä#Tunnistelinkkien lisääminen: toimintamallin opettelu ja harjoittelu Matleena, ehkä? Tiedän mistä puhutaan, mutta en osaa asiaa/Minulla on hyvä yleiskuva asiasta
Liikenne ja viestintä digitaalisessa Suomessa 2020: perehdy toimintamalleihin, joita LVM on käyttänyt sisällön jäsentämiseen En ole vielä aloittanut
Keskustelu:Liikenne ja viestintä digitaalisessa Suomessa 2020#Ohjeita: tuotetun sisällön jäsentäminen LVM:n ohjeistuksen mukaan. VALMISTUTTAVA ENNEN JUHANNUSTA. Kaikki tekemään, mutta yksi tarvitaan katsomaan kokonaisuutta. En ole vielä aloittanut
op_en:Modelling in Opasnet: erityisesti op_en:Ovariable En ole vielä aloittanut
op_en:Modelling in Opasnet: erityisesti op_en:R-tools-käyttäjärajapinta En ole vielä aloittanut
op_en:Modelling in Opasnet: erityisesti op_en:Opasnet base 2-tietokanta En ole vielä aloittanut
Avoin päätöksentekokäytäntö ja siihen liittyvä artikkeli (linkki löytyy sivulta): tutustuminen Pauli Minulla on hyvä yleiskuva asiasta
Matleena Minulla on hyvä yleiskuva asiasta

Tilanne: kuvaa se kehitysvaihe, jossa nyt ollaan menossa.

  • En ole vielä aloittanut
  • Tiedän mistä puhutaan mutten osaa asiaa
  • Minulla on hyvä yleiskuva asiasta
  • Olen jo harjoitellut asiaa ja osaan vähän neuvoa
  • Olen harjoitellut paljon ja osaan neuvoa hyvin
  • Olen tosi tekijä


Työn osat

Työssä on ainakin seuraavat osat

  • Keskustelutilan jatkuva seuraaminen ja häiriköinnin siivoaminen.
  • Kommentointityökalun seuraaminen ja kommenttien nosto varsinaiseen tekstiin. Tämä työkalu on niille jotka eivät halua kirjautua.
  • Tägikone on työkalu tekstin jäsentämiseen ja asiasanoittamiseen. Se on koekäytössä.
  • Varsinaisen keskustelun tueksi tuotettava taustamateriaali: wikistetään erilaisia rokotteeseen liittyviä yleisiä ja spesifisiä raportteja ja yhteenvetoja sen hyödyistä, haitoista ja tehosta. Tätä materiaalia voisi alkaa listata ja työstää jo nopeasti.
  • Kustannus-hyötymallin toteutus R:llä JAGSilla.
  • Mallin parametritietojen kerääminen ja syöttäminen malliin.
  • Päätösvaihtoehtojen kuvaaminen (suoraviivainen)
  • Eri vaikutusten kuvaaminen ovariableina osana kausaalimallia. (Nämä lienevät pääosin tiedossa yleistasolla)
  • Lopputuloksia koskevien arvojen kuvaaminen. Tämä on iso työ ja vaatii myös teoriapohdintaa siitä, käytetäänkö esim MCDAta tai kahdesta paremman valitsemista. Molemmat olisi kiinnostavin. Muitakin vaihtoehtoja voi harkita.
  • Osallistujien kouluttaminen keskeisiin menetelmiin tarpeen mukaan. Näitä ovat Keskustelu ja Opasnet-mallinnus.
  • Päivitettyjen ohjeiden kirjoittaminen näistä menetelmistä. Menetelmien edelleen kehittäminen tämän hankkeen oppien perusteella.


Kustannukset

  • Jouni Tuomisto: ohjaus ja avoimen päätöksentekokäytännön koordinointi: 3 htkk virkatyönä
  • Opasnet-moderaattorit: 4.5 hlö * 3 kk * 150 h/kk * 12 e/h * 1.35 sivukulut = 32805 e (oletetaan maksimityöllisyys kaikille, vaikka moderaattorit tuskin työskentelevät täyspäiväisesti)
  • R-mallinnus Opasnettiin: 1 hlö * 3 kk * 150 h/kk * 17 e/h * 1.35 sivukulut = 10328 e
  • Rokoteasiantuntijatyö: 3 hlö * 1.5 kk virkatyönä

Muistiinpanoja

  • Muuttujat:
    • rokotuskattavuus
    • rokotteen teho eri kantoihin
    • rokotteen haittavaikutukset
    • rokotteen hinta
    • pneumokokin terveyshaitat: invasiivinen pneumokokki-infektio, välikorvantulehdus, aivokalvontulehdus
    • rokotteen epäsuorat vaikutukset muiden kantojen ja bakteerien yleisyyteen
    • rokotteen epäsuorat vaikutukset antibioottien tarpeeseen ja hoitokustannuksiin
    • laumaimmuniteetti
  • Arvot
    • kustannustehokkuus
    • sairauksien laatupainokertoimet (op_en:Disability weights)
    • sairauksien, rokotteiden ja hoitojen nettikustannukset
    • rokotehaittojen kohdistuminen (ei saisi tulla haittaa niille jotka eivät rokotteesta hyödy)

Wikistettävää aineistoa

  • Tartuntataudit Suomessa 2012 [2] luku Invasiivinen pneumokokkitauti, ss. 30-32.

----#: . Tämä sama mutta vuoden 2013 materiaali (melkein sanasta samaan sama hieman eri arvoilla) on jo sivulla Pneumokokki#Pneumokokkitautien esiintyvyys. Tuossa oli tosin pari taulukkoa ja yksi graafi, jotka lisäsin samaan kohtaan. En tiedä, ovatko oikeassa paikassa, mutta siitä ne on helppo siirtää muualle, kun ovat wikimuodossa. --Heta (keskustelu) 5. kesäkuuta 2014 kello 12.38 (UTC) (type: truth; paradigms: science: comment)

  • Pneumokokki-konjugaattirokotteen vaikuttavuuden seuranta osana kansallista rokotusohjelmaa - Prosessikuvausasiakirja [3] Kokonaan

----#: . Tein tämän sivulle Pneumokokkikonjugaattirokotteen vaikuttavuuden seuranta --Heta (keskustelu) 5. kesäkuuta 2014 kello 13.33 (UTC) (type: truth; paradigms: science: comment)

Vertailun vuoksi: LVMn Liikenne ja viestintä digitaalisessa Suomessa 2020 on houkutellut viikossa toistakymmentä uutta käyttäjää ja n. 50000 merkkiä uutta tekstiä jäsennettäväksi.

Työsuunnitelmakeskustelua

Hei!

Jos tarkoitat resursseilla lisäkäsiä (etkä rahaa), niin minulla on kaksi varsin varmaa ja yksi innokas mutta epävarma moderaattori tiedossa. En ole vielä pistänyt kyselyä eteenpäin kovin laajalla jakelulla, mutta tarvittaessa luulen kyllä saavani kesäksi kasaan isommankin porukan. En itse pidä ongelmana näiden lisäkäsien löytämistä, ja sivut kyllä saadaan ylläpidettyä varsinkin, jos tätä työtä voi painottaa kesän ajalle. Eli aikataulu on semmoinen, että mitä pitemmälle ehditään kesällä, sen parempi.

Enemmän pohdintaa vaatii se, millaisen roolin rakennamme varsinaisille asiantuntijoille. Tässä suhteessa voisi miettiä ainakin i) käytettäviä malleja (ratkaisevaa on tarjolla olevien R-koodareiden määrä), ii) olemassaolevan tietoaineiston, raporttien ym. julkaisemista, jäsentämistä ja keskustelemista Opasnetissä (ratkaisevaa on lisäkäsien määrä ja heidän ohjaamisensa).

Puhuin Heinin kanssa puhelimessa, ja teidän mallinne ovat erittäin kiinnostavia. Vielä minulle ei kuitenkaan selvinnyt, kuinka suuri osa itse päätöksenteosta kannattaisi kuvata ja mallintaa Opasnetissä. Tässä muutamia ehdotuksia:

a) Minimiversio: Opasnetiin ei laiteta mitään laskentaa vaan ainoastaan kuvataan hankintakriteerit ja keskustellaan niistä. Osallistujat ovat täysin meidän antaman tiedon varassa.

b) Perusversio: Opasnetiin rakennetaan R-malli, joka ottaa sisäänsä kilpailutuskriteereinä olevat lähtötiedot ja tuottaa suosituksen parhaasta valmisteesta. Malliin rakennetaan joitakin herkkyystarkasteluja, jotta osallistujat voivat itse leikkiä päättäjää ja tarkastella eri tietojen merkitystä. Tämä ei vielä ole kovin työläs.

c) Ammattilaisversio (oma suosikkini): Opasnetiin rakennetaan R-malli, joka sisältää toiminnallisuudet, joita Heini nykyään pyörittää WinBUGSilla. Osallistujat saavat rikkaamman kuvan tilanteesta ja voivat tarkastella myös epävarmuuksia. En ole nähnyt Heinin malleja, mutta olen melko varma, että tämä ei vaadi mitään ylitsepääsemätöntä. Luultavasti se olisi isohko työ ja edellyttää R/BUGS-opettelua, mutta se on minulla ollut työlistalla joka tapauksessa.

d) Julkaistaan Opasnetissa R-malli, jossa on myös transmissiomallin toiminnallisuuksia, jotka nyt pyörivät Matlabissa. Luultavasti hyvin iso työ enkä usko, että tähän on resursseja ainakaan ensimmäisessä pilotissa.

Tietoaineiston julkaisemisessa kysymys kuuluu: kuinka laajalle keskustelua halutaan laajentaa, vai pysytäänkö tiukasti vain kysymyksessä rokote A vai B? Luultavasti ulkopuoliset osallistujat olisivat kiinnostuneita puhumaan monenlaisista asioista, kuten sivuvaikutusten huolesta, vanhempien roolista rokotepäätöksessä (jos HPV), pitäisikö pojat rokottaa jne. Jos tällaisiin keskusteluihin päätetään lähteä, taustamateriaalia olisi tärkeää tuotaa keskustelun pohjaksi. Lisäkäsien tarve lisääntyy siis sekä lisääntyneen keskustelun jäsentämisen että lisääntyneet taustamateriaalin tarpeen vuoksi. Taustamateriaalina ovat niin THL:n julkaisut kuin eri keskustelupalstoilla jo käydyt rokotekeskustelut. Samalla lisääntyy niiden tarve, joilla on kokonaisuus hallussa ja jotka osaavat ohjeistaa työtä oikeisiin kohteisiin. Myös teknisen ohjauksen tarve lisääntyy, mutta tässä suhteessa tiedossani olevat lisäkädet ovat varsin kokeneita.

Jouni


On 22.4.2014 15:09, Nohynek Hanna wrote:

Jouni moikka, toivottavasti olet pääsiäisestä selvinnyt. kysyn mitä kuuluu tälle tarpeellemme saada lisäresurssia avoimen päätökseteon prosessiin, josta oli kanssasi puhetta rokotehankintojen tiimoilta. jotta tiedämme aikatauluttaa itseämme. kiitos & terv hanna

Heini Salo 16.4.2014:

Tautitapausten ilmaantuvuus, terveyspalvelujen käyttö ja osa yksikkökustannuksista estimoitiin rekisteriaineistoista ja se työ tehtiin R:llä. Käytännössä tämä kattaa siis kustannusanalyysin kustannusmuuttujineen (tautitapausten odotetut kustannukset). Rekisteriaineiston analyysitaulukot on kerätty wiki-sivulle:

http://terho.thl.fi/wiki01/display/papilloma/Artikkelien+aineisto+ja+taulukot

HPV kva perustuu transmissio- ja progressiomalliin. Transmissiomalli kuvaa HPV-infektion leviämistä väestössä ja progressiomalli kuvaa kohdunkaulan syövän mahdollista kehittymistä HPV-infektoituneissa naisissa. Tautitapaukset (HPV-infektio, syövän esiasteet ja kohdunkaulan syöpä) ilman rokotusohjelmaa ja rokotusohjelmalla (eri oletuksilla) mallinnettiin tällä dynaamisella mallilla (transmissio- ja progressiomalli). Rokotusohjelman kustannus-vaikuttavuustutkimuksessa näihin mallin tuottamiin tautitapauksiin liitettiin kustannusanalyysin kustannusmuuttujat (odotetut kustannukset per tautitapaus). Transmissio- ja progressiomallit on rakennettu Matlab-ohjelmalla (Simopekka Vänskä). Tässä HPV-työssä myös kva-laskelmat tehtiin Matlabissa. Tuo transmissiomalli on julkaistu (Vänskä et al. PLoS One. 2013) ja tuosta julkaisusta näkee varmaan parhaiten sitä teksnistä toteutusta. Progressiomalli on käsikirjoitusvaiheessa samoin kuin kva. Mallinnustyön pääperiaatteet ja sen tulokset on lyhyesti ja kansantajuisemmin raportoitu työryhmän raportissa (luvut 11 ja 12):

http://www.thl.fi/thl-client/pdfs/94d6f45d-22e1-4b53-b615-2eea48d90e1c

Yleensä kustannus-vaikuttavuusmallit on tehty WinBUGS-ohjelmalla (esim. pneumokokki, rotavirus, vesirokko, puutiaisaivotulehdus). Tämä HPV on poikkeus ja se tehtiin näin, koska erillisen kva-mallin rakentamiseen (WinBUGSilla) ei ollut aikaa. Matlabilla tehty malli on Simopekalla ja se kokonaisuus on tällä hetkellä sellaisissa palasissa (Uuden kumppanin ottaminen, transmissiomalli, progressiomalli, kustannukset) , että niistä ei ota ulkopuolinen tolkkua ilman perusteellista perehdytystä.