Ero sivun ”Koronavirus” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
(→‎Piirrä näkemysverkko Kialon koronakeskustelusta: teksti uudistettu, koodia ei vielä)
 
(13 välissä olevaa versiota samalta käyttäjältä ei näytetä)
Rivi 2: Rivi 2:
'''Koronavirus''' käsittelee SARS-COV-2-viruksen ja sen aiheuttaman COVID-19-taudin olennaisia piirteitä.
'''Koronavirus''' käsittelee SARS-COV-2-viruksen ja sen aiheuttaman COVID-19-taudin olennaisia piirteitä.


== Laskenta ==
== Perustelut ==


=== Piirrä näkemysverkko Kialon koronakeskustelusta ===
=== Linkkejä ===


[[File:Koronakideargumentaatio.png|600px|thumb|Argumentaatio koskien koronarokotusten pakollisuutta.]]Koronakide-hankkeeseen liittyen tehdään näkemysverkkoja koronarokotusten argumentaatiosta.
* [http://77.86.191.32/rtools_server/runs/covid_cases_cities.pdf Koviditapaukset kaupungeittain viikon keskiarvo]
* [http://77.86.191.32/rtools_server/runs/covid_cases_cities_daily.pdf Koviditapaukset kaupungeittain ja päivittäin]
* [http://77.86.191.32/rtools_server/runs/Sade-ennusteen_muutos.png Sade-ennusteen muutos (ei liity koronaan)]
 
=== Data ===
 
Keskusteluja koronaviruksesta ja kovidista Kialo-alustalla, esim. [https://www.kialo.com/will-the-covid-19-pandemic-have-a-lasting-impact-on-society-34267 Onko kovidipandemialla pysyviä vaikutuksia yhteiskuntaan?]. Alla olevassa tiedostossa on 15 keskustelua aihepiiristä. Toisessa tiedostossa on Kialon ilmastokeskusteluja.
 
* {{#l:Covid-19_discussions.zip}}
* {{#l:climate_discussions.zip}}
 
=== Näkemysverkko Kialon koronakeskustelusta ===
 
[[File:Koronakideargumentaatio.png|600px|thumb|Argumentaatio koskien koronarokotusten pakollisuutta.]]Koronakide-hankkeeseen liittyen tehdään näkemysverkkoja koronapolitiikan eri aiheiden argumentaatiosta.


Laskennan logiikka on seuraava. Alkuperäiseen väitteeseen A kohdistuu argumentti B ja tähän kohdistuu argumentti C eli C → B → A. Prioritodennäköisyys, että A on totta on P(A), kun meillä ei ole muuta tietoa. Kun lisätään argumentti B, saadaan Bayesin kaavalla
Laskennan logiikka on seuraava. Alkuperäiseen väitteeseen A kohdistuu argumentti B ja tähän kohdistuu argumentti C eli C → B → A. Prioritodennäköisyys, että A on totta on P(A), kun meillä ei ole muuta tietoa. Kun lisätään argumentti B, saadaan Bayesin kaavalla
Rivi 14: Rivi 27:
Sensitiivisyys (se) on testin (B) herkkyys eli todennäköisyys saada positiivinen tulos jos asia (A) on totta: se = P(B|A) = a/(a+c). Mitä parempi herkkyys, sitä vähemmän vääriä negatiivisia.
Sensitiivisyys (se) on testin (B) herkkyys eli todennäköisyys saada positiivinen tulos jos asia (A) on totta: se = P(B|A) = a/(a+c). Mitä parempi herkkyys, sitä vähemmän vääriä negatiivisia.


Spesifisyys (sp) on testin (B) tarkkuus eli todennäköisyys saada negatiivinen tulos jos asia (A) ei ole totta: sp = 1-P(B|¬A-) = 1 - b/(b+d). Mitä parempi tarkkuus, sitä vähemmän vääriä positiivisia. Herkkyys ja tarkkuus ovat tärkeitä mittareita, koska ne eivät riipu itse asian todennäköisyydestä.
Spesifisyys (sp) on testin (B) tarkkuus eli todennäköisyys saada negatiivinen tulos jos asia (A) ei ole totta: sp = 1-P(B|¬A-) = 1 - b/(b+d). Mitä parempi tarkkuus, sitä vähemmän vääriä positiivisia. Herkkyys ja tarkkuus ovat tärkeitä mittareita, koska ne eivät riipu itse asian A todennäköisyydestä.


Esimerkkinä laskennasta on oheinen taulukko.
Esimerkkinä laskennasta on oheinen taulukko.
Rivi 30: Rivi 43:
  se = a/(a+c) = 0.29/0.30 = 29/30
  se = a/(a+c) = 0.29/0.30 = 29/30
   
   
  sp = b/(b+d) = 0.10/0.70 = 1/7
  sp = 1 - b/(b+d) = 1 - 0.6/0.70 = 1/7
   
   
Mitä tietoja tarvitaan, jotta nelikenttä saadaan yksikäsitteisesti muodostettua? Jos tiedetään poikkisummat P(A) ja P(B), saadaan laskettua myös P(¬A) = 1-P(A) ja P(¬B) = 1-P(B). Yksiselitteisyyden saavuttamiseksi on tiedettävä vielä kolmas asia eli esimerkiksi P(B|A) eli herkkyys, joka kuvaa myös argumentin B relevanssia A:n suhteen eli kykyä muuttaa A:n posterioritodennäköisyyttä.
Bayesin kaavalla saadaan arvio P(A|B) päivitettyä, jos tiedetään priorit P(A) ja P(B) sekä ehdollinen todennäköisyys P(B|A) = se. Totuusarvot päivittyvät suoraan Bayes-verkon mukaisesti. Sen sijaan relevanssi vaatii erityiskäsittelyä.
P(A) = a+c
P(B) = a+b
se = P(B|A) = a/(a+c) <=> a = se P(A), joten b = P(B) -se P(A)
 
Koska P(A|B) saadaan laskettua a/(a+b), matemaattinen määrittelyjoukko on 0 < P(A), P(B), se, a, b < 1 eli erityisesti 0 < P(B)-se P(A) < 1 eli (P(B)-1)/P(A) < se < P(B)/P(A). Koska P(B)<=1, alarajaehto ei tule koskaan vastaan vaan riittää, että se>0. Sen sijaan ylärajaehto voi hyvinkin olla <1 eli tulee joskus rajoittavaksi tekijäksi.
 
Argumentti on epärelevantti, jos P(A) = P(A|B) = a/(a+b) = se P(A)/P(B) eli se = P(B).
 
Jotta käyttäjän antamat parametrit olisivat aina määriteltyjä ja helppo ymmärtää,  voitaisiin ottaa käyttöön seprime-parametri, joka saa arvoja välillä ]-1,1[, joka kattaa koko sensitiivisyyden määrittelyjoukon ja joka saa epärelevantin argumentin kohdalla arvon 0. Niinpä
 
se = P(B|A) = P(B) + seprime(min(1,P(B)/P(A)) - P(B)), jos 0 <= seprime < 1
se = P(B|A) = P(B) + seprimeP(B), jos -1 < seprime < 0.
 
Kuitenkin meitä kiinnostaa relevanssiargumentin C vaikutus A:han B:n kautta. Koska P(B|A) riippuu A:sta, relevanssivaikutusta ei voida suoraan laskea C:n ja B:n tietojen avulla. Sen sijaan voidaan laskea seprime(B), jos ajatellaan seprime(C):n voimistavan tai heikentävän vaikutusta tietyn osuuden verran. C-argumentin todennäköisyys vaikuttaa siihen voimakkuuteen, jolla C muuttaa seprime(B):tä.


seprime(B|C) = seprime(B) + seprime(C) P(C)(1-seprime(B)), jos seprime(C)>=0
Argumentti B on irrelevantti joss P(B|A+) = P(B|A-) = P(B|A) eli a/(a+c) = b/(b+d) eli se + sp = 1. Niinpä relevanssi r voidaan määritellä sensitiivisyyden poikkeamaksi irrelevantista tilanteesta, eli r = (1 - sp) - se. Relevanssihyökkäykset k<sub>i</sub> puolestaan voidaan ajatella tekijöiksi, joiden takia r lähestyy nollaa eli hyökkäysten jälkeinen relevanssi r' on
seprime(B|C) = seprime(B) + seprime(C) P(C) seprime(B), jos seprime(C)<0


Edellä sanottu pätee, jos seprime(B) >= 0, muussa tapauksessa pitää ensin laskea yhtälöt seprime(B):n itseisarvolla ja palauttaa negatiivinen etumerkki jälkikäteen. Tämä johtuu siitä, että argumenttiin B kohdistuvat argumentit voivat lisätä tai vähentää sen relevanssia, mutta ne eivät voi vaihtaa hyökkäävää argumenttia puolustavaksi eikä päinvastoin.
r' = r &Pi;(1 - k<sub>i</sub>)
    = (1 - sp - se) &Pi;(1 - k<sub>i</sub>),


Argumentin vaikutus keskusteluun lasketaan käyttäen esimerkiksi seuraavia oletusarvoja (näiden toimivuutta on testattava käytännössä):
jossa k<sub>i</sub> ∈ [0, 1] saa sitä suurempia arvoja, mitä voimakkaampi hyökkäys relevanssia vastaan tehdään. Tämän kuvauksen hyvä puoli on, että irrelevanssipiste ei riipu A:n ja B:n todennäköisyyksistä ja että lopputulos ei riipu siitä, missä järjestyksessä relevanssihyökkäykset k<sub>i</sub> esitetään.
* Argumentin herkkyys P(B|A) lasketaan relevanssitekijän (seprime) avulla: oletuksena 0.3 jos argumentti puolustaa ja -0.3 jos hyökkää
* Argumenttien totuuden prioritodennäköisyys P(A) = 0.7 jos on uskottava viite, 0.3 jos viite puuttuu


Näiden avulla lasketaan argumentin posterioritodennäköisyys:
Jos taas halutaan esittää puolustava relevanssiargumentti, ei ole selvää, millä tavalla sensitiivisyyden tulisi muuttua. Niinpä tällä hetkellä ajatellaan, että puolustavan relevanssiargumentin yhteydessä pitää erikseen ilmoittaa, mikä kohdeargumentin sensitiivisyys on puolustuksen jälkeen. Tätä on vaikea automatisoida, joten tätä pitää opetella todellisten käyttäjätapausten kautta: millaisia keskusteluja tarvitaan, jotta käyttäjät voivat päätyä perusteltuihin päätelmiin relevanssin suuruudesta?


P(A|B) = P(B|A)P(A)/P(B) = se P(A)/P(B)
=== Laskenta ===


Jos argumentti C on relevanssityyppiä, se vaikuttaa argumentin B relevanssiin muuttamalla tekijää se = P(B|A) epäsuorasti seprimen kautta
==== Piirrä näkemysverkko koronakeskustelusta ====


<rcode>
<rcode>
Rivi 67: Rivi 64:


library(OpasnetUtils)
library(OpasnetUtils)
library(gsheet)
library(tidyverse)
library(tidyverse)
# First version of data https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Wzj_VqubkV6uomQS-St5UxzS5k25dDBs15DQFEsroOg/edit#gid=0


objects.latest("Op_en3861", code_name="makeGraph2") # [[Insight network]] makeGraph
objects.latest("Op_en3861", code_name="makeGraph2") # [[Insight network]] makeGraph
objects.latest("Op_en2382", code_name="update") # [[Discussion]] update_truth, update_relevance, infer_tree
objects.latest("Op_en2382", code_name="update") # [[Discussion]] update_truth, update_relevance, infer_tree
preprocess_arguments <- function(
  file_path, # Name of zip file at Opasnet
  wiki = "opasnet_fi", # Wiki identifier
  file_name, # Name of file in the zip file
  relevants = NA, # vector of Items for relevance arguments
  addition = NA, # vector of arguments to be added to original list.
  truth_prior = 0.3, # prior truth value without other information
  truth_prior_with_reference = 0.7, # prior truth value with credible reference
  sensitivity_prime = 0.3, # sensitivity defend value without other information
  sensitivity_prime_attack = -0.5 # sensitivity attack value without other information
) {
  dfl <- opasnet.data(file_path, wiki, unzip=file_name)
  #  dfl <- read_lines("~/discussion/climate/what-is-the-best-measure-to-decrease-climate-change-31294.txt")
  dfl <- strsplit(dfl, "\n")[[1]]
  df_title <- gsub("Discussion Title: ", "", dfl[1])
  dfl <- dfl[-(1:2)]
  if(!any(is.na(addition))) dfl <- c(dfl, addition)
  df <- data.frame(level = regexpr("\\. ",dfl))
  df$Item = substr(dfl,1,df$level-1)
  df$class = substr(dfl,df$level+6,regexpr(":", dfl)-1)
  df$colour <- substr(dfl,df$level+2, df$level+4)
  df$colour <- ifelse(df$colour %in% c("Pro","Con"), df$colour, "Thesis")
  df$text = substr(dfl, ifelse(df$colour=="Thesis",regexpr("\\. ",dfl), regexpr(":",dfl))+2,999)
  df$level <- nchar(gsub("[0-9]","", df$Item))
  added_argument <- unlist(lapply(strsplit(df$Item,split="\\."), FUN=function(x) max(as.numeric(x))))
  df$level <- df$level * ifelse(added_argument < 99, 1, ifelse(added_argument>999, 10, 0.1))
  df$Object <- gsub("\\.[0-9]*$","", df$Item)
  df$relevance <- ifelse(df$colour=="Pro",sensitivity_prime, sensitivity_prime_attack)
  df$truth <- ifelse(grepl("http", df$text), truth_prior_with_reference, truth_prior)
  df$class <- ifelse(df$class=="", "truth", df$class)
  df$class <- ifelse(df$colour=="Thesis", "fact", df$class)
  if(!any(is.na(relevants))) df$class[df$Item %in% relevants] <- "relevance"
  df$alias <- ifelse(grepl("^-> See", df$text), gsub("\\.$", "", substr(df$text,8,999)), "")
  df$alias[grepl("discussion",df$alias)] <- ""
 
  return(list(df_title, df))
}


prepare_graph <- function(
prepare_graph <- function(
Rivi 77: Rivi 113:
   drop_gray = TRUE, # Drop gray branches?
   drop_gray = TRUE, # Drop gray branches?
   drop_higher_levels = 0, # Drop higher levels (0: drop nothing)?
   drop_higher_levels = 0, # Drop higher levels (0: drop nothing)?
   RELEVANCE_LIMIT = 0.2,
   RELEVANCE_LIMIT = 0.2, # value below which argument is considered irrelevant and dropped from graph
   TRUTH_LIMIT = 0.05,
   TRUTH_LIMIT = 0.05, # value below which argument is considered untrue and dropped from graph
   verbose=FALSE
   verbose=FALSE
) {
) {
   df$edge.penwidth <- abs(df$seprime*15)
  thesis <- df$colour=="Thesis"
   df$node.width <- df$truth
   df$edge.penwidth <- abs(df$relevance*15)
   df$node.fontsize <- df$truth*15
   df$node.width <- ifelse(thesis,1,df$truth)
   df$node.fontsize <- ifelse(thesis,15,df$truth*20)
   df$node.color <- ifelse(df$class=="truth","orange","blue")
   df$node.color <- ifelse(df$class=="truth","orange","blue")
   df$Context <- "Koronakide"
   df$Context <- "Koronakide"
   df$label <- substr(df$text, 1,30)
   df$label <- substr(df$text, 1,30)
  df$label <- paste(df$label, ifelse(thesis, signif(df$truth,2),""))
   df$rel <- ifelse(toupper(df$colour)=="PRO","relevant defense","relevant attack")
   df$rel <- ifelse(toupper(df$colour)=="PRO","relevant defense","relevant attack")
   df$rel <- paste0(ifelse(abs(df$seprime) < RELEVANCE_LIMIT, "ir", ""), df$rel)
   df$rel <- paste0(ifelse(abs(df$relevance) < RELEVANCE_LIMIT, "ir", ""), df$rel)
   df$type <- "argument"
   df$type <- "argument"
   df$type <- ifelse(df$class %in% c("value","fact"), paste(df$class,"opening statement"), df$type)
   df$type <- ifelse(df$class %in% c("value","fact"), paste(df$class,"opening statement"), df$type)
   df$Description <- df$text
   df$Description <- df$text
   drop <- df$Item[(df$truth<TRUTH_LIMIT | abs(df$seprime)<RELEVANCE_LIMIT) & df$level>0]
   drop <- df$Item[(df$truth<TRUTH_LIMIT | abs(df$relevance)<RELEVANCE_LIMIT) & df$level>0]
   if(verbose) print(drop)
   if(verbose) print(drop)
   out <- character()
   out <- character()
Rivi 111: Rivi 149:
   }
   }
   if(drop_gray) df <- df[df$node.fillcolor!="gray" | df$Item %in% drop ,]
   if(drop_gray) df <- df[df$node.fillcolor!="gray" | df$Item %in% drop ,]
   if(drop_higher_levels>0) df <- df[df$level<drop_higher_levels,]
   if(drop_higher_levels>0) df <- df[df$level<=drop_higher_levels | df$level>10,]
   return(df)
   return(df)
}
preprocess_arguments <- function(FILE_PATH, file_list, n) {
  dfl <- read_lines(paste0(FILE_PATH,file_list[n]))
  df_title <- gsub("Discussion Title: ", "", dfl[1])
  dfl <- dfl[-(1:2)]
  df <- data.frame(level = regexpr("\\. ",dfl))
  df$Item = substr(dfl,1,df$level-1)
  df$colour = toupper(substr(dfl,df$level+2,df$level+4))
  df$colour[1] <- "Value"
  df$text = substr(dfl,ifelse(df$level==2,4,df$level+7),999)
  df$level <- nchar(gsub("[0-9]","", df$Item))
  df$Object <- gsub("\\.[0-9]$","", df$Item)
  df$seprime <- SENSITIVITY_PRIME * ifelse(df$colour=="PRO",1,-1)
  df$truth <- ifelse(grepl("http", df$text), TRUTH_PRIOR_WITH_REFERENCE, TRUTH_PRIOR)
  if(!"class" %in% colnames(df)) df$class <- "truth"
  df$class[1] <- "fact"
 
  return(list(df_title, df))
}
}


Rivi 141: Rivi 160:
}
}


TRUTH_PRIOR <- 0.3
file_list_covid <- c(
TRUTH_PRIOR_WITH_REFERENCE <- 0.7
  "are-tracking-apps-a-legitimate-and-proportional-means-to-fight-covid-19-36145.txt"                ,
SENSITIVITY_PRIME <- 0.3
  "do-people-have-a-right-to-not-wear-a-mask-in-public-spaces-during-the-covid-19-pandemic-38770.txt",
TRUTH_LIMIT <- 0.05
  "do-we-need-a-vaccine-to-fight-the-covid-19-pandemic-38268.txt"                                    ,
RELEVANCE_LIMIT <- 0.2
  "do-we-need-a-vaccine-to-fight-the-covid-19-pandemic-38268(1).txt"                                ,
FILE_PATH <- "~/discussion/corona/"
  "education-will-never-be-the-same-as-it-was-before-covid-19-43590.txt"                            ,
  "is-covid-19-more-dangerous-than-regular-flu-viruses-34602.txt"                                    ,
  "is-herd-immunity-for-covid-19-achievable-39248.txt"                                              ,
  "is-it-wrong-to-have-a-lockdown-for-covid-19-36981.txt"                                            ,
  "should-a-global-curfew-be-introduced-to-stop-covid-19-34523.txt"                                  ,
  "should-countries-have-closed-their-borders-to-china-to-reduce-the-spread-of-covid-19-33660.txt"  ,
  "should-covid-19-vaccines-be-mandatory-39517.txt"                                                  ,
  "should-schools-close-during-the-covid-19-pandemic-44845.txt"                                      ,
  "should-vaccine-passports-be-mandatory-49452.txt"                                                  ,
  "will-covid19-bring-lasting-environmental-changes-34939.txt"                                       ,
  "will-the-covid-19-pandemic-have-a-lasting-impact-on-society-34267.txt"       
)


df <- gsheet2tbl("https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Wzj_VqubkV6uomQS-St5UxzS5k25dDBs15DQFEsroOg/edit#gid=0")
file_list_climate <- c(
df <- read.csv(text=gsheet2text("https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Wzj_VqubkV6uomQS-St5UxzS5k25dDBs15DQFEsroOg/edit#gid=2050636969",
  "a-carbon-tax-should-be-implemented-to-subsidize-the-reduction-of-consumers-carbon-footprint-25338.txt"                        ,
                                 format='csv'),skip=1)
  "all-humans-should-be-vegan-2762.txt"                                                                                          ,
  "are-battery-electric-vehicles-better-than-hydrogen-fuel-cell-vehicles-2710.txt"                                              ,
  "are-the-milankovitch-cycles-major-causes-of-climate-change-14194.txt"                                                        ,
  "are-the-rich-or-the-poor-more-responsible-for-environmental-damages-10248.txt"                                                ,
  "climate_discussions.zip"                                                                                                      ,
  "deep-sea-oil-and-gas-exploration-in-the-great-australian-bight-should-be-banned-15489.txt"                                    ,
  "do-we-need-nuclear-power-for-sustainable-energy-production-6182.txt"                                                          ,
  "do-wind-farms-have-more-advantages-than-disadvantages-9620.txt"                                                              ,
  "is-carpooling-the-way-of-the-future-18711.txt"                                                                                ,
  "is-climate-crisis-inevitable-31239.txt"                                                                                      ,
  "is-having-children-a-bad-idea-in-todays-times-13236.txt"                                                                      ,
  "is-it-appropriate-for-the-epa-to-declare-biomass-to-be-carbon-neutral-14080.txt"                                              ,
  "is-it-reasonable-to-create-a-directly-democratic-and-all-inclusive-internet-based-forum-to-address-global-issues-43718.txt"  ,
  "is-low-energy-nuclear-reaction-lenr-technology-the-solution-to-fossil-fuel-burning-30393.txt"                                ,
  "is-organic-farming-better-than-conventional-farming-9613.txt"                                                                ,
  "is-the-united-nations-the-best-forum-to-tackle-climate-change-27811.txt"                                                      ,
  "no-one-should-feel-obliged-to-change-their-lifestyle-to-combat-global-warming-30084.txt"                                      ,
  "periodic-lockdowns-should-be-planned-as-emergency-measures-to-fight-climate-change-36808.txt"                                ,
  "recycling-works-30534.txt"                                                                                                    ,
  "should-fracking-be-banned-7587.txt"                                                                                          ,
  "should-governments-push-to-implement-100%-renewable-energy-3871.txt"                                                         ,
  "should-governments-subsidize-ethanol-10385.txt"                                                                              ,
  "should-humans-act-to-fight-climate-change-4540.txt"                                                                          ,
  "should-nuclear-energy-replace-fossil-fuels-9326.txt"                                                                         ,
  "should-people-go-vegan-if-they-can-31640.txt"                                                                                ,
  "should-private-cars-be-forbidden-in-large-cities-9351.txt"                                                                    ,
  "should-public-transport-be-free-33112.txt"                                                                                    ,
  "should-renewable-energy-sources-replace-fossil-fuels-15900.txt"                                                               ,
  "should-the-ecological-crisis-we-are-facing-become-our-collective-and-singular-focus-3185.txt"                                 ,
  "should-the-eu-introduce-a-carbon-tax-29370.txt"                                                                              ,
  "should-the-us-government-commit-to-a-green-new-deal-30325.txt"                                                                ,
  "should-the-us-have-pulled-out-of-the-paris-climate-agreement-15487.txt"                                                      ,
  "should-there-be-one-singular-global-governmententity-31213.txt"                                                              ,
  "the-earth-will-not-be-irreparable-in-12-years-from-climate-change-32101.txt"                                                  ,
  "the-fight-of-western-countries-against-climate-change-is-hypocritical-31852.txt"                                              ,
  "the-us-should-adopt-a-carbon-fee-and-dividend-plan-to-address-the-primary-cause-of-climate-change-30792.txt"  ,
  "the-world-needs-an-international-environmental-government-that-has-political-power-to-mitigate-environmental-damage-45042.txt",
  "there-should-be-further-research-on-solar-geoengineering-16729.txt"                                                          ,
  "universities-should-divest-from-fossil-fuels-28142.txt"                                                                      ,
  "vertical-farming-is-the-future-of-agriculture-7487.txt"                                                                      ,
  "we-should-adapt-to-climate-change-rather-than-advert-it-31679.txt"                                                            ,
  "what-is-the-best-measure-to-decrease-climate-change-31294.txt"                                                                ,
  "what-is-the-worst-world-problem-of-the-utmost-concern-9143.txt"                                                              ,
  "will-man-made-climate-change-cause-human-extinction-31221.txt"
)


file_list <- c(
relevants <- opasnet.data("4/44/Covid-19_discussions.zip", wiki="op_fi", unzip="should-covid-19-vaccines-be-mandatory-39517_relevants.txt")
"are-tracking-apps-a-legitimate-and-proportional-means-to-fight-covid-19-36145.txt"               ,
relevants <- strsplit(relevants, split="\n")[[1]]
"do-people-have-a-right-to-not-wear-a-mask-in-public-spaces-during-the-covid-19-pandemic-38770.txt",
addition <- opasnet.data("4/44/Covid-19_discussions.zip", wiki="op_fi", unzip="should-covid-19-vaccines-be-mandatory-39517_addition.txt")
"do-we-need-a-vaccine-to-fight-the-covid-19-pandemic-38268.txt"                                   ,
addition <- strsplit(addition, split="\n")[[1]]
"do-we-need-a-vaccine-to-fight-the-covid-19-pandemic-38268(1).txt"                                 ,
 
"education-will-never-be-the-same-as-it-was-before-covid-19-43590.txt"                             ,
df <- preprocess_arguments(
"is-covid-19-more-dangerous-than-regular-flu-viruses-34602.txt"                                   ,
#  file_path = "7/74/Climate_discussions.zip",
  "is-herd-immunity-for-covid-19-achievable-39248.txt"                                               ,
# file_name = file_list_climate[43],
  "is-it-wrong-to-have-a-lockdown-for-covid-19-36981.txt"                                            ,
#  relevants = NA,#relevants, # NA for all others except discussion #11 Should COVID-19 vaccines be mandatory?
  "should-a-global-curfew-be-introduced-to-stop-covid-19-34523.txt"                                  ,
# addition = NA,#addition,
  "should-countries-have-closed-their-borders-to-china-to-reduce-the-spread-of-covid-19-33660.txt"   ,
    file_path = "4/44/Covid-19_discussions.zip",
"should-covid-19-vaccines-be-mandatory-39517.txt"                                                 ,
    file_name = "should-covid-19-vaccines-be-mandatory-39517.txt",
"should-schools-close-during-the-covid-19-pandemic-44845.txt"                                      ,
    relevants = relevants,
"should-vaccine-passports-be-mandatory-49452.txt"                                                  ,
    addition = addition,
"will-covid19-bring-lasting-environmental-changes-34939.txt"                                      ,
  truth_prior = 0.3,
"will-the-covid-19-pandemic-have-a-lasting-impact-on-society-34267.txt"       
  truth_prior_with_reference = 0.7,
  sensitivity_prime = 0.3,
  sensitivity_prime_attack = -0.5
)
)


df <- preprocess_arguments(FILE_PATH = FILE_PATH, file_list = file_list, n=8)
gr <- makeGraph(
gr <- makeGraph(
   ova=prepare_graph(
   ova=prepare_graph(
     df=infer_tree(df[[2]], SENSITIVITY_PRIME, TRUTH_PRIOR),
     df=infer_tree(df[[2]], verbose=FALSE),
     drop_gray = TRUE, drop_higher_levels = 3, TRUTH_LIMIT = 0.1, RELEVANCE_LIMIT = 0.2, verbose=FALSE),
     drop_gray = TRUE,
    drop_higher_levels = 2,
    TRUTH_LIMIT = 0.1,
    RELEVANCE_LIMIT = 0.2,
    verbose=FALSE),
   formatted=formatted)
   formatted=formatted)
render_graph(gr, title=df[[1]])
render_graph(gr, title=df[[1]])
#export_graph(gr, "~/home/jouni/Documents/Koronakide.svg")
#export_graph(gr, "~/home/jouni/Documents/Koronakide.svg")


out <- prepare_graph(
#out <- prepare_graph(
  df=infer_tree(df[[2]], SENSITIVITY_PRIME, TRUTH_PRIOR),
#  df=infer_tree(df[[2]]),
  drop_gray = TRUE, drop_higher_levels = 3, TRUTH_LIMIT = 0.1, RELEVANCE_LIMIT = 0.2, verbose=FALSE)
#  drop_gray = TRUE, drop_higher_levels = 3, TRUTH_LIMIT = 0.1, RELEVANCE_LIMIT = 0.2, verbose=FALSE)
 


df_default <- infer_tree(df, SENSITIVITY_PRIME, TRUTH_PRIOR)
#df_default <- infer_tree(df)
df_no_relevance <- infer_tree(df %>% mutate(class="truth"), SENSITIVITY_PRIME, TRUTH_PRIOR)
#df_no_relevance <- infer_tree(df %>% mutate(class="truth"), sensitivity_prime, truth_prior)
plot(df_default$truth, df_no_relevance$truth)
#plot(df_default$truth, df_no_relevance$truth)
# The correlation between inference with truth/relevance classification and that without is not great.
# The correlation between inference with truth/relevance classification and that without is not great.
# However, it is reasonable for very high and very low values.
# However, it is reasonable for very high and very low values.
Rivi 192: Rivi 271:
</rcode>
</rcode>


* [http://fi.opasnet.org/fi-opwiki/index.php?title=Koronavirus&oldid=36857#Piirr.C3.A4_n.C3.A4kemysverkko_Kialon_koronakeskustelusta Arkistoitu aiempi pohdinta] perustuen mm. vedonlyöntisuhteisiin sekä totuus- ja relevanssifaktoreihin. Lisäksi käytettiin termistä P(B|A) nimeä sensitiivisyys, mikä on sinänsä oikein mutta ei ehkä hyödyllistä.
==== Hae kirjanmerkit Firefoxista ====
 
=== Hae kirjanmerkit Firefoxista ===


<rcode>
<rcode>
Rivi 215: Rivi 292:
== Katso myös ==
== Katso myös ==


* Aiempi versio, jossa käytettiin relevanssitekijää ja oletettiin ettei spesifisyyttä tiedetä. [http://fi.opasnet.org/fi-opwiki/index.php?title=Koronavirus&oldid=36880#N.C3.A4kemysverkko_Kialon_koronakeskustelusta]
* A Global collection of open source projcts during COVID-19 [http://open-source-covid-19.weileizeng.com/]
* A Global collection of open source projcts during COVID-19 [http://open-source-covid-19.weileizeng.com/]
* Annu Haho, Marja Tiirola. Sammutammeko koronakriisiä oikeilla välineillä? Suojaa-testaa-jäljitä-eristä-hoida! Miten? [https://www.suolistoblogi.com/446264861]
* Annu Haho, Marja Tiirola. Sammutammeko koronakriisiä oikeilla välineillä? Suojaa-testaa-jäljitä-eristä-hoida! Miten? [https://www.suolistoblogi.com/446264861]
Rivi 502: Rivi 580:
* [https://www.hs.fi/mielipide/art-2000006525265.html Avoin tieteellinen keskustelu parantaisi hallinnon toimintaa - Mielipide | HS.fi]
* [https://www.hs.fi/mielipide/art-2000006525265.html Avoin tieteellinen keskustelu parantaisi hallinnon toimintaa - Mielipide | HS.fi]
* [https://masks4all.co/letter-over-100-prominent-health-experts-call-for-cloth-mask-requirements/ Over 100 prominent academics call for mask requirements - #Masks4All]
* [https://masks4all.co/letter-over-100-prominent-health-experts-call-for-cloth-mask-requirements/ Over 100 prominent academics call for mask requirements - #Masks4All]
=== Arkisto ===
* [http://fi.opasnet.org/fi-opwiki/index.php?title=Koronavirus&oldid=36857#Piirr.C3.A4_n.C3.A4kemysverkko_Kialon_koronakeskustelusta Arkistoitu aiempi pohdinta] perustuen mm. vedonlyöntisuhteisiin sekä totuus- ja relevanssifaktoreihin. Lisäksi käytettiin termistä P(B|A) nimeä sensitiivisyys, mikä on sinänsä oikein mutta ei ehkä hyödyllistä.

Nykyinen versio 1. elokuuta 2022 kello 09.33




Koronavirus käsittelee SARS-COV-2-viruksen ja sen aiheuttaman COVID-19-taudin olennaisia piirteitä.

Perustelut

Linkkejä

Data

Keskusteluja koronaviruksesta ja kovidista Kialo-alustalla, esim. Onko kovidipandemialla pysyviä vaikutuksia yhteiskuntaan?. Alla olevassa tiedostossa on 15 keskustelua aihepiiristä. Toisessa tiedostossa on Kialon ilmastokeskusteluja.

Näkemysverkko Kialon koronakeskustelusta

Argumentaatio koskien koronarokotusten pakollisuutta.

Koronakide-hankkeeseen liittyen tehdään näkemysverkkoja koronapolitiikan eri aiheiden argumentaatiosta.

Laskennan logiikka on seuraava. Alkuperäiseen väitteeseen A kohdistuu argumentti B ja tähän kohdistuu argumentti C eli C → B → A. Prioritodennäköisyys, että A on totta on P(A), kun meillä ei ole muuta tietoa. Kun lisätään argumentti B, saadaan Bayesin kaavalla 

P(A|B) = P(B|A)P(A)/P(B).

Sensitiivisyys (se) on testin (B) herkkyys eli todennäköisyys saada positiivinen tulos jos asia (A) on totta: se = P(B|A) = a/(a+c). Mitä parempi herkkyys, sitä vähemmän vääriä negatiivisia.

Spesifisyys (sp) on testin (B) tarkkuus eli todennäköisyys saada negatiivinen tulos jos asia (A) ei ole totta: sp = 1-P(B|¬A-) = 1 - b/(b+d). Mitä parempi tarkkuus, sitä vähemmän vääriä positiivisia. Herkkyys ja tarkkuus ovat tärkeitä mittareita, koska ne eivät riipu itse asian A todennäköisyydestä.

Esimerkkinä laskennasta on oheinen taulukko.

A+ A- Sum
B+ 0.29 (a) 0.60 (b) 0.89
B- 0.01 (c) 0.10 (d) 0.11
Sum 0.30 0.70 1.00 
se = a/(a+c) = 0.29/0.30 = 29/30

sp = 1 - b/(b+d) = 1 - 0.6/0.70 = 1/7

Bayesin kaavalla saadaan arvio P(A|B) päivitettyä, jos tiedetään priorit P(A) ja P(B) sekä ehdollinen todennäköisyys P(B|A) = se. Totuusarvot päivittyvät suoraan Bayes-verkon mukaisesti. Sen sijaan relevanssi vaatii erityiskäsittelyä.

Argumentti B on irrelevantti joss P(B|A+) = P(B|A-) = P(B|A) eli a/(a+c) = b/(b+d) eli se + sp = 1. Niinpä relevanssi r voidaan määritellä sensitiivisyyden poikkeamaksi irrelevantista tilanteesta, eli r = (1 - sp) - se. Relevanssihyökkäykset ki puolestaan voidaan ajatella tekijöiksi, joiden takia r lähestyy nollaa eli hyökkäysten jälkeinen relevanssi r' on 

r' = r Π(1 - ki)
   = (1 - sp - se) Π(1 - ki),

jossa ki ∈ [0, 1] saa sitä suurempia arvoja, mitä voimakkaampi hyökkäys relevanssia vastaan tehdään. Tämän kuvauksen hyvä puoli on, että irrelevanssipiste ei riipu A:n ja B:n todennäköisyyksistä ja että lopputulos ei riipu siitä, missä järjestyksessä relevanssihyökkäykset ki esitetään.

Jos taas halutaan esittää puolustava relevanssiargumentti, ei ole selvää, millä tavalla sensitiivisyyden tulisi muuttua. Niinpä tällä hetkellä ajatellaan, että puolustavan relevanssiargumentin yhteydessä pitää erikseen ilmoittaa, mikä kohdeargumentin sensitiivisyys on puolustuksen jälkeen. Tätä on vaikea automatisoida, joten tätä pitää opetella todellisten käyttäjätapausten kautta: millaisia keskusteluja tarvitaan, jotta käyttäjät voivat päätyä perusteltuihin päätelmiin relevanssin suuruudesta?

Laskenta

Piirrä näkemysverkko koronakeskustelusta

+ Näytä koodi

Hae kirjanmerkit Firefoxista

+ Näytä koodi

Katso myös

Arkisto

  • Arkistoitu aiempi pohdinta perustuen mm. vedonlyöntisuhteisiin sekä totuus- ja relevanssifaktoreihin. Lisäksi käytettiin termistä P(B|A) nimeä sensitiivisyys, mikä on sinänsä oikein mutta ei ehkä hyödyllistä.
Noudettu kohteesta ”https://fi.opasnet.org/index.php?title=Koronavirus&oldid=36886”