OpasnetBaseUtils

This page is just a placeholder for code in op_en:OpasnetBaseUtils so that it can be used in Finnish Opasnet as well.

Rcode generic

• Functions: dropall, PTable, opasnet.data, tidy, summary.bring

+ Näytä koodi- Piilota koodi ###################################### ## dropall pudottaa data.framesta pois kaikki faktorien sellaiset levelit, joita ei käytetä. ## parametrit: x = data.frame dropall <- function(x){ isFac <- NULL for (i in 1:dim(x)[2]){isFac[i] = is.factor(x[ , i])} for (i in 1:length(isFac)){ x[, i] <- x[, i][ , drop = TRUE] } return(x) } ######################################## ######################################### ## PTable muuntaa arvioinnin todennäköisyystaulun sopivaan muotoon arviointia varten. ## Parametrit: P = todennäköisyystaulu Opasnet-kannasta kaivettuna. ## n = iteraatioiden lukumäärä Monte Carlossa ## Todennäköisyystaulun sarakkeiden on oltava: Muuttuja, Selite, Lokaatio, P ## Tuotteena on Monte Carloa varten tehty taulu, jonka sarakkeina ovat ## n (iteraatio) ja kaikki todennäköisyystaulussa olleet selitteet, joiden riveille on arvottu ## lokaatiot niiden todennäköisyyksien mukaisesti, jotka todennäköisyystaulussa oli annettu. PTable <- function(P, n) { Pt <- unique(P[,c("Muuttuja", "Selite")]) Pt <- data.frame(Muuttuja = rep(Pt$Muuttuja, n), Selite = rep(Pt$Selite, n), obs = rep(1:n, each = nrow(Pt)), P = runif(n*nrow(Pt), 0, 1)) for(i in 2:nrow(P)){P$Result[i] <- P$Result[i] + ifelse(P$Muuttuja[i] == P$Muuttuja[i-1] & P$Selite[i] == P$Selite[i-1], P$Result[i-1], 0)} P <- merge(P, Pt) P <- P[P$P <= P$Result, ] Pt <- as.data.frame(as.table(tapply(P$Result, as.list(P[, c("Muuttuja", "Selite", "obs")]), min))) colnames(Pt) <- c("Muuttuja", "Selite", "obs", "Result") Pt <- Pt[!is.na(P$Result), ] P <- merge(P, Pt) P <- P[, !colnames(P) %in% c("Result", "P", "Muuttuja")] P <- reshape(P, idvar = "obs", timevar = "Selite", v.names = "Lokaatio", direction = "wide") colnames(P) <- ifelse(substr(colnames(P), 1, 9) == "Lokaatio.", substr(colnames(P), 10,30), colnames(P)) return(P) } ############### Bring parts of summary table # data is the summary table. summary.bring <- function(data){ data <- data[, !colnames(data) %in% c("id", "obs")] pages <- levels(data$Page) ## temp contains the additional information that is not on the actual data table. temp <- data[data$Observation != "Description", !colnames(data) %in% c("Result", "Observation")] temp <- reshape(temp, idvar = "Page", timevar = "Index", direction = "wide") colnames(temp) <- ifelse(substr(colnames(temp), 1, 12) == "Result.Text.", substr(colnames(temp), 13, 50), colnames(temp)) ## Get all data tables one at a time and combine them. for(i in 1:length(pages)){ out <- op_baseGetData("opasnet_base", pages[i]) out <- tidy(out) cols <- colnames(out)[!colnames(out) %in% c("Observation", "Result")] out <- reshape(out, timevar = "Observation", idvar = cols, direction = "wide") colnames(out) <- ifelse(substr(colnames(out), 1, 7) == "Result.", substr(colnames(out), 8, 50), colnames(out)) nam <- colnames(temp)[colnames(temp) != "Page"][1] # nam is needed in the case that the next line drops the colname out <- merge(temp[temp$Page == pages[i], colnames(temp) != "Page"], out) colnames(out)[colnames(out) == "x"] <- nam ## Check that all data tables have all the same columns before you combine them with rbind. if(i == 1){out2 <- out} else { addcol <- colnames(out2)[!colnames(out2) %in% colnames(out)] if(length(addcol) > 0) { temp <- as.data.frame(array("*", dim = c(1,length(addcol)))) colnames(temp) <- addcol out <- merge(out, temp)} addcol <- colnames(out)[!colnames(out) %in% colnames(out2)] if(length(addcol) > 0) { temp <- as.data.frame(array("*", dim = c(1,length(addcol)))) colnames(temp) <- addcol out2 <- merge(out2, temp)} ## Combine data tables. out2 <- rbind(out2, out)} } return(out2) } ##########