Keskustelu:Vesiopas

Vesioppaan kehityskohteet 2019

1. Annosvasteet pitäisi kuvata kunnolla. Mitä parametrit tarkoittavat ja missä yksiköissä ne ovat. Kunnon linkkaukset avoimiin lähteisiin tai tarkempi kuvaus Opasnettiin. Päivi katsoo
2. Sen suunnittelu, mitä käyttäjältä kysytään, OK ja mitä käyttäjälle tulee ajosta ulos
3. VYHI-järjestelmän sisältämät tiedot. (Veeti eli vesihuollon tietojärjestelmä).
   1. Ainakin seuraavia indikaattoreita kannattaisi kehittää Veeti-datasta:
      • Kehittää miten mihin?
      • Putkirikkojen määrä vuodessa kunnittain (per 100000 vedenkäyttäjää?) http://veetirajapinta.ymparisto.fi/v1/odata/VerkkoPutkirikko
      • Vesitornien ja verkostojen huoltoindeksi: katsotaan kauanko on kulunut viimeisestä huollosta ja saneerauksesta ja näitä painotetaan jotenkin. (Esim. annetaan miinusta jos huollosta on yli 3 a tai saneerauksesta yli 20 a?) http://veetirajapinta.ymparisto.fi/v1/odata/VerkkojenSaneerauksetVerkkoTyyppi http://veetirajapinta.ymparisto.fi/v1/odata/Vesisailio
      • Jäteveden lupaehtojen saavuttaminen esim. http://veetirajapinta.ymparisto.fi/v1/odata/JatevedenRajaArvo
4. Dalyt toteutetaan samalla tavalla kuin Ruorissa.
5. Mietittävä, pitäisikö ydinkoodi siirtää englanninkieliseen Opasnettiin. KYLLÄ OK
   • Tällä hetkellä suomenkielisessä vain vanha koodi. Se pitää päivittää jossain vaiheessa. OK
6. Toisaalta, mietittävä koodin toteutusta Githubissa Rmarkdownissa tai Jupyter notebookissa. ⇤--arg4865: . Eikö tästä luovuttu jo? --Heta (keskustelu) 5. elokuuta 2019 kello 09.40 (UTC) (type: ; paradigms: science: attack)
7. Selvitettävä mahdollisuus käyttää Hiilineutraalin Helsingin laskentamoottoreita ja käyttöliittymiä.
   • plotly + vetoskaalat htps://plot.ly/r/sliders
8. Lisätä raakavesi-aineistoa Suomen osalta
9. Lisätä puhdistusprosesseja, jotka yleisesti käytössä Suomessa
   • Veetissä listatut puhdistusprosessit: alkalointi (pH:n säätö), desinfiointi, raudan/mangaanin poisto, muu, selkeytys, hiekkasuodatus, aktiivihiilisuodatus, otsonointi, muu desinfiointi
     • Näistä alkalointi, raudan/mangaanin poisto ja selkeytys puuttuu kokonaan meidän mallista. Desinfiointi, muu ja muu desinfiointi on epäselviä, mitä ne tarkoittaa. Desinfiointimenetelmistä meillä on otsonointi, UV ja kloori mallissa. Onko UV tai kloori tuo "desinfiointi" tässä listassa, vai onko ne jotain ihan muuta?
     • Meiän mallissa on lisäksi traditional cleaning, well working cleaning, enhanced cleaning ja limestone filtration (joka ei kyllä tee noille mikrobeille yhtään mitään).
10. Linkittää muihin vastaaviin työkaluihin
    • Mitä on muut vastaavat työkalut?
11. Kansallisen talousveden turvallisuussuunnitelman (Water Safety Plan, WSP) huomioiminen
    • esimerkkisivu paikkakohtaisten tietojen käytöstä --> tulosten ajo valitsemalla kohteen nimi listasta
    • tietokantaan linkittämisen mahdollisuus -->paikkakohtainen tulossivu suojatulle puolelle
12. Tuloksissa vertailu kansalliseen raja-arvoon
13. Uimavesiopas:
    • Kysytään indikaattoripitoisuudesta johdettu patogeenipitoisuus (Päivi hoitaa), sen jälkeen lisätään tämä malliin
    • Jos annettu indikaattorimäärät, kerrotaan outputissa käyttäjälle, mihin laatuluokitukseen menee
    • Korjaa niellyn veden määrä OK (oli koko ajan oikein, luvut otettu artikkelista löytyvästä kuvasta)
    • Kuva, jossa ei näytetä tautitapaukset mikrobeittain vaan ikäryhmittäin OK
    • Englanninkielinen versio OK
14. Kloori/kloorausopas -> onko kloorin auheuttama puhdistuma oikeasti niin iso kuin miltä näyttää datassa?
15. Opettele ktstrat-käyttöliittymä

Asiantuntijakommenteja

1. Drinking water disinfection
   • otsonoinnin ja uv:n annokset pitää jossain sanoa:
     • rakenna malli uudestaan niin, että UV:lle ja otsonille tehdään sama kuin kloorille, eli käyttäjä antaa annoksen Tämä on periaatteessa tehty, paitsi tapauksissa joissa otsoniannos on yli 0, koodi ei toimi. Ei ole selvinnyt, mikti
     • käyttäjältä kuitenkin kysytään raakaveden sameus- tai TOC-luokka eikä (luultavasti) UV- tai otsonimäärää.
     • Katso läpi UV:n ja otsonin viiteet? OK
   • Polaris-projektissa katsottu puhdistumia, Tarja Pitkäseltä voisi kysyä.
2. Kloorauksen teho pitää myös tarkistaa
3. Asiantuntija-arvioita tarvitsee lisää, jotta kaikki sisään menevä data on luotettavaa. Varsinkin puhdistumiin.
4. Lisää vaihteluvälejä ja epävarmuuksia
5. Uimavesioppaan vesiluokittelua pitää muuttaa. Eikun pitikö?
6. Kuormitukset jätevesikuormitukset uimavesioppaaseen
   • Lisätään vesilintu/maatalouskuormitus
   • ----arg4893: . Tämä on supernopea tehdä, kunhan noiden kuormitusten patogeenipitoisuudet vaan on tiedossa. Ne pitoisuudet lisätään op_en:Pathogen concentrations in raw water -sivun taulukkoon uusina luokkina, ja lisätään valintavaihtoehtoihin uimavesioppaan koodiin. Muuta ei tarvitse tehdä. --Heta (keskustelu) 20. syyskuuta 2019 kello 07.48 (UTC) (type: ; paradigms: science: comment)
7. Lisätään sapovirus ja salmonella (joskus tulevaisuudessa)

Jo tehty

1. Mallin koodin yksinkertaistus
2. Kaikki sivut käytävä läpi ja tehtävä yhtenäinen rakenne. OK
   • Otsikoinnit päivitetään: kysymys, vastaus, perustelu, data, laskenta.
   • Tarkista viitteet.
   • Poista: aiheeseen liittyviä tiedostoja
3. Resp--> Illness. Aina jokin illness. Lisää muuttuja. Luokat: drinking water. HC=hemorrhagic colitis. Unit: DALY/case. Crytpo-->Crypto. Otiskot isolla, rivit pienellä. OK
4. Väestödata Ruorista. OK
5. age:age --> Age:age koska ensimmäisestä Agesta tehdään automaattisesti sarakkeen nimi. OK
6. Duration 10/365 --> 10 ja otsikkoon Duration (days) OK
7. Kaikki koodissa esiintyvät luvut on siirrettävä taulukoihin Opasnetin sivuille OK
8. Clmysteerifunktio on selvitettävä. Mikä on sen tehtävä mallissa? OK, korvattu yhdellä lisärivillä ChlorineEfficiencyF-funktiossa, jossa sitä käytettiin.
9. Mallin koodin yksinkertaistus
   • Pääsivun koodi OK
   • Klooraus OK
   • Suomen populaatio OK?
   • Health impacts of waterborne microbes OK
10. Mallin nykyrakenne google drawingilla. Joka muuttuja omaksi solmukseen, ja mukaan nimi, tiedot sisältävän sivun curid (ja ovariablen +uudet ja -poistuvat sarakkeet?). vanhan Vesiopas-mallin rakennekuva, tavoitteena on yleinen tautitaakkamalli; päivitetyn vesioppaan luonnos.
11. Käyttäjälle mahdollisuus määritellä vedenkäyttöömäärä, defaultiksi annetaan se, minkä malli hakee. OK
12. Uimavesiopasta varten uintiaika (ikä, niellyn veden määrä, aktiviteettityyppi) OK
13. Plotly summalla eikä eri patogeeneilla OK
    • mikä tauti? OK
    • mikä ikäryhmä? OK
    • mikä patogeeni? OK
    • kaiva Veetistä isojen vesilaitosten puhdistusmenetelmäkombot -> lisää puhdistusmenetelmäkombot nappuloiksi OK
14. Plotly-kuviin hyväksyttävän riskin raja taustaväri vihreä/punainen (tautitapauksilla, koska DALYlle ei määritelty. Pelkästään suolistotulehdukselle?) OK
    • Patogeenikohtainen ja pelkä gastro tautitapaukset plotlyyn OK
    • Plotly uimavesistä (tautitapaukset. Uimaveden kuormitus vaihtoehdoiksi. OK
    • Tee uimavesiplotly, jossa saa valittua sen, mitä näytetään (DALY/tautitapaukset/sairastumisen todennäköisyys) OK
15. Päivitä suomenkielinen OK
16. orgaanisen ja muun aineen määrä vedessä vaikuttaa puhdistumiin: pitäisikö ottaa huomioon. Ainakin pitää mainita jotenkin maininta OK
17. Lisää selkeämmät selitykset siitä, mistä mallin käyttämä lähtödata löytyy (muutakin kuin vain riippuvuudet sivun alareunassa) OK
    • Pääsivulla kuvattava tärkeimmät taustatiedot ja oletukset, jotta ei tarvitse mennä alisivuille. OK
18. Pitää mainita, että mallissa arvioidaan vesilaitoksen kloorausprosessia eikä jäännöskloorin vaikutusta verkostossa OK
19. Pitoisuus/konsentraatio -> taudinaiheuttajien määrä (sanastoa siis) OK
20. Valinnassa: Uimavesiluokka -> uimaveden taudinaiheuttajamäärä. Ei viitata uimavesian laatuluokitukseen koska sitä ei käytetä (enkä olisi syytä vartavasten sanoa, että ei käytetä) OK
21. Vesioppaaseen: sairastuneiden määrä myös taulukossa OK
    • Ja numerot näkyviin kuviin OK
    • Sairastuneiden osuus -kuva OK

Yleisiä Opasnetin kehittämistarpeita:

• Data updated successfully tapahtuu suomenkielisessä Opasnetissä turhaan, vaikkei data ole muuttunut.
• Ajon päättymistä ei seurata automaattisesti ja sivu pitää tuoreuttaa käsin.
• Ehdolliset käyttäjäsyötteet rcodessa näkyvät nyt aina vaikka pitäisi ilmaantua vasta jos niitä tarvitaan.
• LaTeX eli <math> ei toimi.
• Jos joku muu kuin admin lisää linkkejä sivulle, tulee captcha-kysely, josta ei pääse eteenpäin.

<rcode name="ova">

# This is code Op_en2345/ova on page [[Water guide]] 
library(OpasnetUtils)

ova <- Ovariable(
  "ova",
  ddata="Op_en2345/watertable"
)

objects.store(ova)
cat("Ovariable ova stored.\n")
</rcode>

<rcode>
  #This is code Op_en1234/ on page [[Kuopio water]]
  library(OpasnetUtils)

objects.latest("Op_en2345", code_name="ova") # [[Water guide]] ova

ova <- EvalOutput(ova)
summary(ova)
</rcode>

Skenaarioita:

• Raakaveden laadun muuttuminen
  • Jätevesivuodot (purku vesistöön)
  • Valumat (rankkasateet)
  • Vuodenaikaisvaihtelu? Kevätvalumat?
  • Indikaattorit? Kemiallisfysikaaliset ja mikrobiologiset (Sameus? E.coli?)

• Toimintahäiriöt puhdistusprosessissa

• Puhdistusprosessien optimointi

• Kloorausannos

Tulosten ilmoittaminen:

• Infektion/sairastumisen todennäköisyys
• Sairastuneiden lkm: taulukko + kuvaaja
  • Suhteutus tavoitearvoihin?
• DALY? onko tarpeen?
• Muita tarpeita?
• Kustannukset?

Virhe koodissa

Huomattu, ettei UV-puhdistus anna oikeanlaisia tuloksia, toistaiseksi UV:n käyttö puhdistusprosessiesta poistettu. Koodi korjataan keväällä 2012, jolloin UV palautetaan listaan.

Kehitysideoita malliin 25.11.2011

• Raakavesiluokituksiin lisää pohjavesi jätevesikontaminaatiolla
• Raakavesiluokitusten pitoisuuksien tarkastus - vastaako Suomen oloja?
• klooraus-moduuliin muutoksia: ensin kloorauksen valinta kyllä - ei, sitten tarkempia tietoja

Mallin testausta 18.8.2011

--#: Tulokset samaa luokkaa muiden mallien kanssa --Päivi Meriläinen 18. elokuuta 2011 kello 09.46 (EEST)

--#: Vedenpuhdistus: Puhdistusprosessi ja klooraus-laatikko pitäisi saada jaettua kahteen eri laatikkoon, eli Puhdistusprosessi ja Klooraus (klooraus-laatikkoon kloorauksen tiedot ja ensimmäiseksi pudotusvalikko Kaupungin oletusarvot) --Päivi Meriläinen 18. elokuuta 2011 kello 13.35 (EEST)

Mallin testausta 17.8.2011

• Kloorauksen poisto aiheuttaa ongelmia jos klooraus on 0 ja/tai kloorin pitoisuus on 0. Tämän voi toki ohittaa ottamalla kloorauksen laskentaan mukaan ja laittamalla olemattoman pienen pitoisuuden kloorille

Error in if (Cl.used == 1) { : argument is of length zero
Execution halted

Error in sample(Cl.conc.t.cum, 10000, TRUE, Probability) :
invalid first argument
Calls: mean -> sample
Execution halted

--#: Ongelma liittyi R-tools bugiin, joka jätti tyhjät (sisältäen 0 arvoiset) muuttujat määrittelemättä; se on nyt korjattu. Poistin myös koko kloorauksen käyttö inputin; klooriannoksen luulisi riittävän inputtina. --Teemu R 17. elokuuta 2011 kello 13.24 (EEST)

Analytica-mallin tarkistusta ja epäloogisuuksien korjausta

• Ikäjakauma tarkastettu, tehty omat sivut: http://fi.opasnet.org/fi/Suomen_ik%C3%A4jakauma

• Patogeenien annosvaste: http://fi.opasnet.org/fi/Patogeenien_annosvasteet

• Chlorine sensitivity poistettu, mutta "Chlorine sensitivity by pathogen"-muuttuja tarpeellinen

• Erikoistilanteet jätetään pois tästä versiosta

• ks. E.coli ja indikaattorilaskenta --> jää pois

• ks. mallinnetut patogeenipitoisuudet. Analytica-malli laskee väärin, aina nollatulos.

Tuloksiin kuvaajia

• Patogeenien pitoisuudet raakavedessä vs. puhdistetussa vedessä
• Patogeenien pitoisuudet raakavedessä vs. sairastuneiden lkm

Kehitystarpeita kesälle 2012 -- Päivi Meriläinen 28. toukokuuta 2012 kello 16.49 (EEST)

• Mihin kysymyksiin Vesioppaan pitäisi vastata
• Mitkä kysymykset ovat niitä oikeita?
• Mitä/ketä vesioppaan pitäisi palvella ja auttaa?
• Millaisista vastauksista olisi eniten hyötyä?
• Mitä lisädataa on saatavilla?