Ero sivun ”Opasnet-kanta” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
(vähän lisää)
(suomennos valmis)
 
(6 välissä olevaa versiota 3 käyttäjän tekeminä ei näytetä)
Rivi 1: Rivi 1:
{{ensyklopedia}}
{{ensyklopedia}}  


Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.
Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.  


:'''Opasnet-kanta''' on osa [[:op_en:Opasnet|Opasnet]]tiä ja se sisältää [[muuttuja|muuttujien]] tuloksia sekä [[tutkimus]]dataa. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi [[:op_en:Analytica|Analytica]]-malleissa.  
:'''Opasnet-kanta''' on osa [[:op_en:Opasnet|Opasnetiä]] ja se sisältää [[Muuttuja|muuttujien]] tuloksia sekä [[Tutkimus|tutkimusdataa]]. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi [[:op_en:Analytica|Analytica]]-malleissa. Opasnet-kantaan pääsee käsiksi [[Muuttuja|muuttuja]]- ja [[Tutkimus|tutkimussivuilla]] olevien linkkien (''metatieto-laatikko'') kautta, [http://base.opasnet.org oman Opasnet-nettiliittymänsä] kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla [[:op_en:image:Opasnet_base_connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]-tietokantaliittymällä.


Opasnet-kantaan pääsee käsiksi [[muuttuja]]- ja [[tutkimus]]sivuilla olevien linkkien ("metadata-laatikko") kautta, [http://base.opasnet.org oman Opasnet-nettiliittymänsä] kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla [[:image:Opasnet base connection.ANA |Opasnet base connection.ANA]]-tietokantaliittymällä.
== Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita  ==


[[Luokka:Kaipaa suomentamista]] [[op_en:Opasnet base]]
=== Tulkittujen mallitulosten taltiointi  ===


{{encyclopedia}}
Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin '''tulkittujen mallinnustulosten''' tallennuspaikaksi, ts. [[Muuttuja|muuttujien]] [[:op_en:Result|tuloksille]]. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat [[Tutkimus|tutkimus]]-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn [[Tutkimus|tutkimuksen]] tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.


=== "Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi  ===


==Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita==
Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus(julkaisu) tai esim. "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:


===Tulkittujen mallitulosten taltiointi===
*Kerätä havaintoaineistoa jotta sitä voidaan käyttää suoraan ja kätevästi [[Muuttuja|muuttuja]] ja muiden [[:op_en:Object|olioiden]] tulkintojen tekemiseen.
*Kollektiivisesti kerätä tietoa erityisistä tapauksista yleisemmän tapauksen selvittämiseksi


Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin '''tulkittujen mallinnustulosten''' tallennuspaikaksi, ts. [[muuttuja|muuttujien]] [[tulos|tuloksille]]. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat [[tutkimus]]-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn [[tutkimus||tutkimuksen]] tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.
On kuitenkin joitain asioita mitä muuttujista ja tutkimuksista tulee ymmärtää:


==="Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi===
*Olio, joka on kokoelma havainnoista, on nimeltään [[tutkimus]], kun taas olio, jossa tätä oliota tulkitaan on nimeltään [[muuttuja]]. Esimerkiksi tutkimus voi kerätä tietoa ihmisryhmästä kyselylomakkeella ja verinäyttein. Tutkimuksen tunniste on Obj.id Opasnet-kannassa.
*Olion voi jakaa pienempiin osiin käyttämällä [[:op_en:Index|indeksiä]]. Esimerkiksi kyselylomakkeessa saattaa olla kolmekymmentä kysymystä ja niinpä kyselyllä saatu data voidaan jakaa kolmeenkymmeneen indeksin, jossa on kolmekymmentä saraketta (tai riviä, riippuen omasta ajattelutavastasi), yksi rivi jokaiselle kysymykselle. Jokainen tutkimuksen sarake sisältää yhden solun, eli yhden vastauksen kysymykseen. Esimmerkiksi, jos tutkimuksessa tutkitaan kymmentä veren biomarkkeria ja kyselyssä on 30 kysymystä, objektin koko on neljäkymmentä solua ja indeksi sisältää neljäkymmentä saraketta (30 kyselylomakkeesta ja kymmenen verinäytteistä). Solun tunniste Opasnet-kannassa on Cell.id.
*Jokaiselle yksittäiselle potilaalle on yksi havaintorivi (esimerkissä jokainen kooltaan neljäkymmentä solua). Tämä havaintorivi Opasnet-kannassa on nimeltään Res.Sample.
*Yksittäisen potilaan tietyn solun tulos löytyy Opasnet-kannasta paikasta Sam.Result (tai Res_info.Description jossa se ilmaistaan ei-numeerisessa muodossa teksinä)
*Jokainen tutkimus voi olla moniulotteinen, aivan kuten muuttujakin ja voi sisältää indeksejä esim. paikan, ajan tai sukupuolen suhteen.
*Jos data on kerätty Opasnetissä käyttäen verkkolomaketta, aikakirjaus ja käyttäjänimi tai IP-tunnus talletetaan jokaiselle syötteelle Resinfo.:on (tämä on Opasnetin mukaan muuttumatonta dataa)
*Joissain tapauksissa voi olla hyödyllistä rajoittaa käyttäjien antamien syötteiden määrän yhteen. Tämä tehdään kuitenkin vain tulkintavaiheessa missä vain viimeinen syöte lasketaan. Uuden datan syöttämisessä ei ole rajoituksia ja sikispä käyttäjä voi vaihtaa hänen aiempaa syötettä yksinkertaisesti tekemällä uuden.


Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus (joka dokumentoidaan [[Opasnet Data]]) tai se voi olla "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle tai vastaavalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:
=== Value-of-information analyysien tekeminen [[Opasnet-kanta|Opasnet-kannassa]]  ===


* To collect observation data to be directly and conveniently usable in interpretations of [[variable]]s and other [[object]]s.
[[:op_en:Value of information]] (VOI) on [[:en:decision_analysis|päätösanalyysissä]] käytettävä menetelmä, jolla arvioidaan epävarmuuden merkityksellisyysttä päätöksenteon kannalta. Opasnet-kannan avulla voidaan toteuttaa laajoja VOI analyysejä, koska  kaikki kannassa olevat muuttujat ovat valmiiksi oikeassa muodossa sitä varten, eli epävarmojen muuttujien satunnaisotoksina. Analyysi suoritetaan optimoimalla [[:op_en:Indicator|indikaattori]]-muuttujaa [[:op_en:Decision variable|päätösmuuttujan]] suhteen siten, että analysoitavaa muuttujaa ehdollistetaan eri arvoille. Kaikki tämä voidaan teoriassa tehdä Opasnet-kannassa listaamalla kannassa olevia indikaattoreita, päätösmuttujia ja muita kiinnostuksen kohteena olevia muuttujia. Käytännön työkaluja tätä varten pitää tosin vielä kehittää, jotta järjestelmällisiä VOI analyysejä voidaan alkaa suorittamaan erilaisiiin ympäristöterveyden aiheisiin liittyen.
* To collectively collect information about specific cases for the purpose of conditionalizing generalised assessment models with data specific to particular cases.


However, there are some things about variables and studies that should be understood:
=== [[Opasnet-kanta|Opasnet-kannassa]] olevien muuttujien laadun kehityksen seuraaminen ===
* The object for a collection of observations is called a [[study]], while the object of interpretations is called a [[variable]]. As an example, a study can collect information about a population group by a questionnaire and by taking a blood sample. The study identifier is the Obj.id in the Opasnet Base.
* The object may be divided into smaller pieces along one or more [[index|indices]]. For example, the questionnaire may have 30 questions, and therefore the questionnaire data can be indexed by an index with 30 columns (or rows, depending on which way you think), one row for each question. Each column of the study object has one cell, i.e. an answer to one question. In this study, ten blood markers will be studied, and therefore the study object will have 40 cells, and the index has 40 columns (30 from the questionnaire, 10 from the blood sample). The cell identifier is the Cell.id in the Opasnet Base.
* For each individual patient, there is one row of observations, each 40 cells. The observation row identifier is Res.Sample in Opasnet Base.
* The actual result of a particular cell of a particular patient is located in Sam.Result in Opasnet Base (or in Res_info.Description in the case where the result is text, i.e. non-numeric).
* Each study may be multidimensional just like a variable and have indices along e.g. space, time, or sex.
* If the data is collected using an Opasnet web form, then the timestamp and username or IP will be recorded for each entry into Resinfo.When and Resinfo.Who fields, respectively. This is not needed, if the data comes from a previously performed study (which is static data in the eyes of Opasnet).
* In some cases, it  might be useful to restrict the number of entries per user to one. However, this is done only at the interpretation phase where only the last entry is counted. There are no restrictions to enter new data, and therefore a user may change his/her previous entry by simply making a new entry.


===Making value-of-information analyses in [[Opasnet base]]===
Kaikki muuttujat, jotka on joskus tallennettu Opasnet-kantaan, säilyvät siellä. Vanhat muuttujat voivat olla hyvin mielenkiintoisia muutamastakin eri syystä:


[[Value of information]] (VOI) is a [[:en:decision analysis|decision analysis]] tool for estimating the importance of remaining uncertainty for decision-making. Result database can be used to perform a large number of VOI analyses, because all variables are in the right format for that: as random samples from uncertain variables. The analysis is done by optimising an [[indicator]] variable by adjusting a [[decision variable]] so that the variable under analysis is conditionalised to different values. All this can in theory be done in the result database by just listing the indicator, the decision variable, and the variable of interest. Practical tools should be developed for this. After that, systematic VOI analyses can be made over a wide range of environmental health issues.
* Ajassa tapahtuva muutos muuttujan [[:op_en:Informativeness|informatiivisuudessa]] ja [[:op_en:Calibration|kalibraatiossa]] voidaan määrittää ja verrata sitä uusimpaan muuttujaa koskevaan informaatioon
* Ratkaisevan tärkeät informaation palaset, joilla on ollut merkittävä vaikutus informatiivisuuden ja kalibraation kehitykseen voidaan tunnistaa jälkikäteen
* Suuri joukko muuttujia voidaan arvioida mm. seuraavien kysymysten suhteen:
** Kuinka paljon työtä vaaditaan muuttujan kehittämiseksi sille tasolle, että sen suorituskyky on riittävä käytännön sovellusten tarpeita varten?
** Mitkä ovat ratkaisevan tärkeät vaiheet, jonka jälkeen muuttujan suorituskyky kyllääntyy, eli ei enää mainittavasti parane lisäponnistuksista huolimatta?


===Analysing the change in the quality of a variable result in [[Opasnet base]]===
== Katso myös  ==


All results that have once been stored in the result database remain there. Old results can be very interesting for some purposes:
*[[:op_en:Opasnet Base structure|Opasnet Base structure]]  
* The time trend of [[informativeness]] and [[calibration]] (see [[performance]]) can be evaluated for a single variable against the newest information.
*[[:op_en:Opasnet|Opasnet]]  
* Critical pieces of information that had a major impact on the informativeness and calibration can be identified afterwards.
*[[:op_en:Open assessment|Open assessment]]  
* Large number of variables can be assessed and e.g. following questions can be asked:
*[[:op_en:Image:Opasnet base connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]  
** How much work is needed to make a variable with reasonable performance for practical applications?
*[http://www.csc.fi/english/csc/news/news/e-infra-strategy CSC e-infrastructure strategy]
** What are the critical steps after which the variable performance is saturated, i.e., does not improve much despite additional effort?
 
 
==See also==
 
* [[Opasnet Base structure]]
* [[Opasnet]]
* [[Open assessment]]
* [[:image:Opasnet base connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]
* [http://www.csc.fi/english/csc/news/news/e-infra-strategy CSC e-infrastructure strategy]

Nykyinen versio 23. huhtikuuta 2009 kello 10.50




Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.

Opasnet-kanta on osa Opasnetiä ja se sisältää muuttujien tuloksia sekä tutkimusdataa. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi Analytica-malleissa. Opasnet-kantaan pääsee käsiksi muuttuja- ja tutkimussivuilla olevien linkkien (metatieto-laatikko) kautta, oman Opasnet-nettiliittymänsä kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla Opasnet base connection.ANA-tietokantaliittymällä.

Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita

Tulkittujen mallitulosten taltiointi

Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin tulkittujen mallinnustulosten tallennuspaikaksi, ts. muuttujien tuloksille. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat tutkimus-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn tutkimuksen tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.

"Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi

Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus(julkaisu) tai esim. "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:

  • Kerätä havaintoaineistoa jotta sitä voidaan käyttää suoraan ja kätevästi muuttuja ja muiden olioiden tulkintojen tekemiseen.
  • Kollektiivisesti kerätä tietoa erityisistä tapauksista yleisemmän tapauksen selvittämiseksi

On kuitenkin joitain asioita mitä muuttujista ja tutkimuksista tulee ymmärtää:

  • Olio, joka on kokoelma havainnoista, on nimeltään tutkimus, kun taas olio, jossa tätä oliota tulkitaan on nimeltään muuttuja. Esimerkiksi tutkimus voi kerätä tietoa ihmisryhmästä kyselylomakkeella ja verinäyttein. Tutkimuksen tunniste on Obj.id Opasnet-kannassa.
  • Olion voi jakaa pienempiin osiin käyttämällä indeksiä. Esimerkiksi kyselylomakkeessa saattaa olla kolmekymmentä kysymystä ja niinpä kyselyllä saatu data voidaan jakaa kolmeenkymmeneen indeksin, jossa on kolmekymmentä saraketta (tai riviä, riippuen omasta ajattelutavastasi), yksi rivi jokaiselle kysymykselle. Jokainen tutkimuksen sarake sisältää yhden solun, eli yhden vastauksen kysymykseen. Esimmerkiksi, jos tutkimuksessa tutkitaan kymmentä veren biomarkkeria ja kyselyssä on 30 kysymystä, objektin koko on neljäkymmentä solua ja indeksi sisältää neljäkymmentä saraketta (30 kyselylomakkeesta ja kymmenen verinäytteistä). Solun tunniste Opasnet-kannassa on Cell.id.
  • Jokaiselle yksittäiselle potilaalle on yksi havaintorivi (esimerkissä jokainen kooltaan neljäkymmentä solua). Tämä havaintorivi Opasnet-kannassa on nimeltään Res.Sample.
  • Yksittäisen potilaan tietyn solun tulos löytyy Opasnet-kannasta paikasta Sam.Result (tai Res_info.Description jossa se ilmaistaan ei-numeerisessa muodossa teksinä)
  • Jokainen tutkimus voi olla moniulotteinen, aivan kuten muuttujakin ja voi sisältää indeksejä esim. paikan, ajan tai sukupuolen suhteen.
  • Jos data on kerätty Opasnetissä käyttäen verkkolomaketta, aikakirjaus ja käyttäjänimi tai IP-tunnus talletetaan jokaiselle syötteelle Resinfo.:on (tämä on Opasnetin mukaan muuttumatonta dataa)
  • Joissain tapauksissa voi olla hyödyllistä rajoittaa käyttäjien antamien syötteiden määrän yhteen. Tämä tehdään kuitenkin vain tulkintavaiheessa missä vain viimeinen syöte lasketaan. Uuden datan syöttämisessä ei ole rajoituksia ja sikispä käyttäjä voi vaihtaa hänen aiempaa syötettä yksinkertaisesti tekemällä uuden.

Value-of-information analyysien tekeminen Opasnet-kannassa

op_en:Value of information (VOI) on päätösanalyysissä käytettävä menetelmä, jolla arvioidaan epävarmuuden merkityksellisyysttä päätöksenteon kannalta. Opasnet-kannan avulla voidaan toteuttaa laajoja VOI analyysejä, koska kaikki kannassa olevat muuttujat ovat valmiiksi oikeassa muodossa sitä varten, eli epävarmojen muuttujien satunnaisotoksina. Analyysi suoritetaan optimoimalla indikaattori-muuttujaa päätösmuuttujan suhteen siten, että analysoitavaa muuttujaa ehdollistetaan eri arvoille. Kaikki tämä voidaan teoriassa tehdä Opasnet-kannassa listaamalla kannassa olevia indikaattoreita, päätösmuttujia ja muita kiinnostuksen kohteena olevia muuttujia. Käytännön työkaluja tätä varten pitää tosin vielä kehittää, jotta järjestelmällisiä VOI analyysejä voidaan alkaa suorittamaan erilaisiiin ympäristöterveyden aiheisiin liittyen.

Opasnet-kannassa olevien muuttujien laadun kehityksen seuraaminen

Kaikki muuttujat, jotka on joskus tallennettu Opasnet-kantaan, säilyvät siellä. Vanhat muuttujat voivat olla hyvin mielenkiintoisia muutamastakin eri syystä:

  • Ajassa tapahtuva muutos muuttujan informatiivisuudessa ja kalibraatiossa voidaan määrittää ja verrata sitä uusimpaan muuttujaa koskevaan informaatioon
  • Ratkaisevan tärkeät informaation palaset, joilla on ollut merkittävä vaikutus informatiivisuuden ja kalibraation kehitykseen voidaan tunnistaa jälkikäteen
  • Suuri joukko muuttujia voidaan arvioida mm. seuraavien kysymysten suhteen:
    • Kuinka paljon työtä vaaditaan muuttujan kehittämiseksi sille tasolle, että sen suorituskyky on riittävä käytännön sovellusten tarpeita varten?
    • Mitkä ovat ratkaisevan tärkeät vaiheet, jonka jälkeen muuttujan suorituskyky kyllääntyy, eli ei enää mainittavasti parane lisäponnistuksista huolimatta?

Katso myös

Noudettu kohteesta ”https://fi.opasnet.org/index.php?title=Opasnet-kanta&oldid=2513”