Ero sivun ”Opasnet-kanta” versioiden välillä

Opasnet Suomista
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
pEi muokkausyhteenvetoa
(suomennos valmis)
 
Rivi 3: Rivi 3:
Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.  
Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.  


:'''Opasnet-kanta''' on osa [[:op_en:Opasnet|Opasnettiä]] ja se sisältää [[Muuttuja|muuttujien]] tuloksia sekä [[Tutkimus|tutkimusdataa]]. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi [[:op_en:Analytica|Analytica]]-malleissa. Opasnet-kantaan pääsee käsiksi [[Muuttuja|muuttuja]]- ja [[Tutkimus|tutkimussivuilla]] olevien linkkien ("metadata-laatikko") kautta, [http://base.opasnet.org oman Opasnet-nettiliittymänsä] kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla [[:op_en:image:Opasnet_base_connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]-tietokantaliittymällä.
:'''Opasnet-kanta''' on osa [[:op_en:Opasnet|Opasnetiä]] ja se sisältää [[Muuttuja|muuttujien]] tuloksia sekä [[Tutkimus|tutkimusdataa]]. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi [[:op_en:Analytica|Analytica]]-malleissa. Opasnet-kantaan pääsee käsiksi [[Muuttuja|muuttuja]]- ja [[Tutkimus|tutkimussivuilla]] olevien linkkien (''metatieto-laatikko'') kautta, [http://base.opasnet.org oman Opasnet-nettiliittymänsä] kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla [[:op_en:image:Opasnet_base_connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]-tietokantaliittymällä.


== Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita  ==
== Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita  ==
Rivi 9: Rivi 9:
=== Tulkittujen mallitulosten taltiointi  ===
=== Tulkittujen mallitulosten taltiointi  ===


Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin '''tulkittujen mallinnustulosten''' tallennuspaikaksi, ts. [[Muuttuja|muuttujien]] [[Tulos|tuloksille]]. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat [[Tutkimus|tutkimus]]-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn [[Tutkimus|tutkimuksen]] tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.  
Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin '''tulkittujen mallinnustulosten''' tallennuspaikaksi, ts. [[Muuttuja|muuttujien]] [[:op_en:Result|tuloksille]]. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat [[Tutkimus|tutkimus]]-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn [[Tutkimus|tutkimuksen]] tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.  


=== "Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi  ===
=== "Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi  ===
Rivi 15: Rivi 15:
Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus(julkaisu) tai esim. "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:  
Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus(julkaisu) tai esim. "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:  


*Kerätä havaintoaineistoa jotta sitä voidaan käyttää suoraan ja kätevästi [[Variable|muuttuja]] ja [[Object|objekti]] tulkintojen tekemiseen.  
*Kerätä havaintoaineistoa jotta sitä voidaan käyttää suoraan ja kätevästi [[Muuttuja|muuttuja]] ja muiden [[:op_en:Object|olioiden]] tulkintojen tekemiseen.  
*Kollektiivisesti kerätä tietoa erityisistä tapauksista yleisemmän tapauksen selvittämiseksi
*Kollektiivisesti kerätä tietoa erityisistä tapauksista yleisemmän tapauksen selvittämiseksi


On kuitenkin joitain asioita mitä muuttujista ja tutkimuksista tulee ymmärtää:  
On kuitenkin joitain asioita mitä muuttujista ja tutkimuksista tulee ymmärtää:  


*Objekti joka on kokoelma havainnoista, on nimeltään [[Study|tutkimus]], kun taas tämän tulkinnan objekti on nimeltään [[Variable|muuttuja]]. Esimerkiksi tutkimus voi kerätä tietoa ihmisryhmästä kyselylomakkeella ja verinäyttein. Tutkimuksen tunniste on Obj.id Opasnet kannassa.  
*Olio, joka on kokoelma havainnoista, on nimeltään [[tutkimus]], kun taas olio, jossa tätä oliota tulkitaan on nimeltään [[muuttuja]]. Esimerkiksi tutkimus voi kerätä tietoa ihmisryhmästä kyselylomakkeella ja verinäyttein. Tutkimuksen tunniste on Obj.id Opasnet-kannassa.  
*Objektin voi jakaa pienempiin osiin käyttämällä [[Index|indeksiä]]. Esimerkiksi kyselylomakkeessa saattaa olla kolmekymmentä kysymystä ja niinpä kyselylomake data voidaan jakaa kolmeenkymmeneen indeksin, jossa on kolmekymmentä saraketta (tai riviä, riippuen omasta ajattelutavastasi), yksi rivi jokaiselle kysymykselle. Jokainen tutkimuksen sarake sisältää yhden solun, eli yhden vastauksen kysymykseen. Tässä tutkimuksessa tutkitaan kymmenen veren biomarkkeria ja siispä objektin koko on neljäkymmentä solua ja indeksi sisältää neljäkymmentä saraketta (30 kyselylomakkeesta ja kymmenen verinäytteistä). Solun tunniste Opasnet kannassa on Cell.id.  
*Olion voi jakaa pienempiin osiin käyttämällä [[:op_en:Index|indeksiä]]. Esimerkiksi kyselylomakkeessa saattaa olla kolmekymmentä kysymystä ja niinpä kyselyllä saatu data voidaan jakaa kolmeenkymmeneen indeksin, jossa on kolmekymmentä saraketta (tai riviä, riippuen omasta ajattelutavastasi), yksi rivi jokaiselle kysymykselle. Jokainen tutkimuksen sarake sisältää yhden solun, eli yhden vastauksen kysymykseen. Esimmerkiksi, jos tutkimuksessa tutkitaan kymmentä veren biomarkkeria ja kyselyssä on 30 kysymystä, objektin koko on neljäkymmentä solua ja indeksi sisältää neljäkymmentä saraketta (30 kyselylomakkeesta ja kymmenen verinäytteistä). Solun tunniste Opasnet-kannassa on Cell.id.  
*Jokaiselle yksittäiselle potilaalle on yksi havaintorivi, jokainen kooltaan neljäkymmentä solua. Tämä havaintorivi Opasnet kannassa on nimeltään Res.Sample.  
*Jokaiselle yksittäiselle potilaalle on yksi havaintorivi (esimerkissä jokainen kooltaan neljäkymmentä solua). Tämä havaintorivi Opasnet-kannassa on nimeltään Res.Sample.  
*Yksittäisen potilaan tietyn solun tulos löytyy Opasnet kannasta paikasta Sam.Result (tai Res_info.Description jossa se ilmaistaan ei-numeerisessa muodossa teksinä)  
*Yksittäisen potilaan tietyn solun tulos löytyy Opasnet-kannasta paikasta Sam.Result (tai Res_info.Description jossa se ilmaistaan ei-numeerisessa muodossa teksinä)  
*Jokainen tutkimus voi olla moniulotteinen, aivan kuten muuttujakin ja voi sisältää indeksejä esim. paikan, ajan tai sukupuolen suhteen.  
*Jokainen tutkimus voi olla moniulotteinen, aivan kuten muuttujakin ja voi sisältää indeksejä esim. paikan, ajan tai sukupuolen suhteen.  
*Jos data on kerätty käyttäen Opasnet web forumia, aikakirjaus, käyttäjänimi ja EP talletetaan jokaiselle syötteelle Resinfo.:on (tämä on Opasnetin mukaan muuttumatonta dataa)  
*Jos data on kerätty Opasnetissä käyttäen verkkolomaketta, aikakirjaus ja käyttäjänimi tai IP-tunnus talletetaan jokaiselle syötteelle Resinfo.:on (tämä on Opasnetin mukaan muuttumatonta dataa)
*Joissain tapauksissa voi olla hyödyllistä rajoittaa käyttäjien antamien syötteiden määrän yhteen. Tämä tehdään kuitenkin vain tulkintavaiheessa missä vain viimeinen syöte lasketaan. Uuden datan syöttämisessä ei ole rajoituksia ja sikispä käyttäjä voi vaihtaa hänen aiempaa syötettä yksinkertaisesti tekemällä uuden.
*Joissain tapauksissa voi olla hyödyllistä rajoittaa käyttäjien antamien syötteiden määrän yhteen. Tämä tehdään kuitenkin vain tulkintavaiheessa missä vain viimeinen syöte lasketaan. Uuden datan syöttämisessä ei ole rajoituksia ja sikispä käyttäjä voi vaihtaa hänen aiempaa syötettä yksinkertaisesti tekemällä uuden.


<br>
=== Value-of-information analyysien tekeminen [[Opasnet-kanta|Opasnet-kannassa]]  ===


=== Making value-of-information analyses in [[Opasnet base|Opasnet base]] ===
[[:op_en:Value of information]] (VOI) on [[:en:decision_analysis|päätösanalyysissä]] käytettävä menetelmä, jolla arvioidaan epävarmuuden merkityksellisyysttä päätöksenteon kannalta. Opasnet-kannan avulla voidaan toteuttaa laajoja VOI analyysejä, koska  kaikki kannassa olevat muuttujat ovat valmiiksi oikeassa muodossa sitä varten, eli epävarmojen muuttujien satunnaisotoksina. Analyysi suoritetaan optimoimalla [[:op_en:Indicator|indikaattori]]-muuttujaa [[:op_en:Decision variable|päätösmuuttujan]] suhteen siten, että analysoitavaa muuttujaa ehdollistetaan eri arvoille. Kaikki tämä voidaan teoriassa tehdä Opasnet-kannassa listaamalla kannassa olevia indikaattoreita, päätösmuttujia ja muita kiinnostuksen kohteena olevia muuttujia. Käytännön työkaluja tätä varten pitää tosin vielä kehittää, jotta järjestelmällisiä VOI analyysejä voidaan alkaa suorittamaan erilaisiiin ympäristöterveyden aiheisiin liittyen.


[[Value of information|Value of information]] (VOI) is a [[:en:decision_analysis|decision analysis]] tool for estimating the importance of remaining uncertainty for decision-making. Result database can be used to perform a large number of VOI analyses, because all variables are in the right format for that: as random samples from uncertain variables. The analysis is done by optimising an [[Indicator|indicator]] variable by adjusting a [[Decision variable|decision variable]] so that the variable under analysis is conditionalised to different values. All this can in theory be done in the result database by just listing the indicator, the decision variable, and the variable of interest. Practical tools should be developed for this. After that, systematic VOI analyses can be made over a wide range of environmental health issues.
=== [[Opasnet-kanta|Opasnet-kannassa]] olevien muuttujien laadun kehityksen seuraaminen ===


=== Analysing the change in the quality of a variable result in [[Opasnet base|Opasnet base]]  ===
Kaikki muuttujat, jotka on joskus tallennettu Opasnet-kantaan, säilyvät siellä. Vanhat muuttujat voivat olla hyvin mielenkiintoisia muutamastakin eri syystä:


All results that have once been stored in the result database remain there. Old results can be very interesting for some purposes:  
* Ajassa tapahtuva muutos muuttujan [[:op_en:Informativeness|informatiivisuudessa]] ja [[:op_en:Calibration|kalibraatiossa]] voidaan määrittää ja verrata sitä uusimpaan muuttujaa koskevaan informaatioon
* Ratkaisevan tärkeät informaation palaset, joilla on ollut merkittävä vaikutus informatiivisuuden ja kalibraation kehitykseen voidaan tunnistaa jälkikäteen
* Suuri joukko muuttujia voidaan arvioida mm. seuraavien kysymysten suhteen:
** Kuinka paljon työtä vaaditaan muuttujan kehittämiseksi sille tasolle, että sen suorituskyky on riittävä käytännön sovellusten tarpeita varten?
** Mitkä ovat ratkaisevan tärkeät vaiheet, jonka jälkeen muuttujan suorituskyky kyllääntyy, eli ei enää mainittavasti parane lisäponnistuksista huolimatta?


*The time trend of [[Informativeness|informativeness]] and [[Calibration|calibration]] (see [[Performance|performance]]) can be evaluated for a single variable against the newest information.
== Katso myös  ==
*Critical pieces of information that had a major impact on the informativeness and calibration can be identified afterwards.
*Large number of variables can be assessed and e.g. following questions can be asked:
**How much work is needed to make a variable with reasonable performance for practical applications?
**What are the critical steps after which the variable performance is saturated, i.e., does not improve much despite additional effort?


<br>
*[[:op_en:Opasnet Base structure|Opasnet Base structure]]  
 
*[[:op_en:Opasnet|Opasnet]]  
== See also  ==
*[[:op_en:Open assessment|Open assessment]]  
 
*[[:op_en:Image:Opasnet base connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]  
*[[Opasnet Base structure|Opasnet Base structure]]  
*[[Opasnet|Opasnet]]  
*[[Open assessment|Open assessment]]  
*[[Image:Opasnet base connection.ANA|Opasnet base connection.ANA]]  
*[http://www.csc.fi/english/csc/news/news/e-infra-strategy CSC e-infrastructure strategy]
*[http://www.csc.fi/english/csc/news/news/e-infra-strategy CSC e-infrastructure strategy]
[[Category:Kaipaa_suomentamista]] [[op en:Opasnet base|op en:Opasnet base]]

Nykyinen versio 23. huhtikuuta 2009 kello 10.50




Tämä sivu on yleiskuvaus Opasnet-kannasta.

Opasnet-kanta on osa Opasnetiä ja se sisältää muuttujien tuloksia sekä tutkimusdataa. Tietokanta on pyritty suunnittelemaan joustavaksi, joten se soveltuu lähes kaikenlaisen datan tallettamiseen. Kanta soveltuu niin todennäköisyysjakaumille kuin piste-estimaateille, paikkatiedolle sekä moniulotteiselle datalle. Opasnet-kannassa olevaa dataa voidaan käyttää suoraan esimerkiksi Analytica-malleissa. Opasnet-kantaan pääsee käsiksi muuttuja- ja tutkimussivuilla olevien linkkien (metatieto-laatikko) kautta, oman Opasnet-nettiliittymänsä kautta sekä Analytica-ohjelmalla toteutetulla Opasnet base connection.ANA-tietokantaliittymällä.

Joitakin Opasnet-kannan käyttötapoja ja -kohteita

Tulkittujen mallitulosten taltiointi

Alunperin Opasnet-kanta suunniteltiin tulkittujen mallinnustulosten tallennuspaikaksi, ts. muuttujien tuloksille. Muuttujilla pyritään vastaamaan todellisuutta koskeviin kysymyksiin, ja niiden tulokset ovat tämänhetkinen paras arvio vastaukseksi. Muuttujat eroavat tutkimus-sivuista, jotka ilmaisevat vain havainnot jostakin tietystä tieteellisestä (osa)tutkimuksesta. Muuttujien tulosten odotetaan kehittyvän jatkuvasti, kun taas tietyn tutkimuksen tuottama data pysyy muuttumattomana tutkimuksen valmistuttua.

"Perinteisten" tutkimustulosten taltiointi

Opasnet-kantaan voidaan myös kerätä havaintodataa tietyistä tutkimuksista. "Tutkimus" voi olla perinteinen tieteellinen tutkimus(julkaisu) tai esim. "Opasnet-tutkimus", jonka data kerätään tietyllä Opasnet-sivulla olevalle lomakepohjalle. On useita mahdollisia syitä käyttää Opasnet-kantaa tietovarastona:

  • Kerätä havaintoaineistoa jotta sitä voidaan käyttää suoraan ja kätevästi muuttuja ja muiden olioiden tulkintojen tekemiseen.
  • Kollektiivisesti kerätä tietoa erityisistä tapauksista yleisemmän tapauksen selvittämiseksi

On kuitenkin joitain asioita mitä muuttujista ja tutkimuksista tulee ymmärtää:

  • Olio, joka on kokoelma havainnoista, on nimeltään tutkimus, kun taas olio, jossa tätä oliota tulkitaan on nimeltään muuttuja. Esimerkiksi tutkimus voi kerätä tietoa ihmisryhmästä kyselylomakkeella ja verinäyttein. Tutkimuksen tunniste on Obj.id Opasnet-kannassa.
  • Olion voi jakaa pienempiin osiin käyttämällä indeksiä. Esimerkiksi kyselylomakkeessa saattaa olla kolmekymmentä kysymystä ja niinpä kyselyllä saatu data voidaan jakaa kolmeenkymmeneen indeksin, jossa on kolmekymmentä saraketta (tai riviä, riippuen omasta ajattelutavastasi), yksi rivi jokaiselle kysymykselle. Jokainen tutkimuksen sarake sisältää yhden solun, eli yhden vastauksen kysymykseen. Esimmerkiksi, jos tutkimuksessa tutkitaan kymmentä veren biomarkkeria ja kyselyssä on 30 kysymystä, objektin koko on neljäkymmentä solua ja indeksi sisältää neljäkymmentä saraketta (30 kyselylomakkeesta ja kymmenen verinäytteistä). Solun tunniste Opasnet-kannassa on Cell.id.
  • Jokaiselle yksittäiselle potilaalle on yksi havaintorivi (esimerkissä jokainen kooltaan neljäkymmentä solua). Tämä havaintorivi Opasnet-kannassa on nimeltään Res.Sample.
  • Yksittäisen potilaan tietyn solun tulos löytyy Opasnet-kannasta paikasta Sam.Result (tai Res_info.Description jossa se ilmaistaan ei-numeerisessa muodossa teksinä)
  • Jokainen tutkimus voi olla moniulotteinen, aivan kuten muuttujakin ja voi sisältää indeksejä esim. paikan, ajan tai sukupuolen suhteen.
  • Jos data on kerätty Opasnetissä käyttäen verkkolomaketta, aikakirjaus ja käyttäjänimi tai IP-tunnus talletetaan jokaiselle syötteelle Resinfo.:on (tämä on Opasnetin mukaan muuttumatonta dataa)
  • Joissain tapauksissa voi olla hyödyllistä rajoittaa käyttäjien antamien syötteiden määrän yhteen. Tämä tehdään kuitenkin vain tulkintavaiheessa missä vain viimeinen syöte lasketaan. Uuden datan syöttämisessä ei ole rajoituksia ja sikispä käyttäjä voi vaihtaa hänen aiempaa syötettä yksinkertaisesti tekemällä uuden.

Value-of-information analyysien tekeminen Opasnet-kannassa

op_en:Value of information (VOI) on päätösanalyysissä käytettävä menetelmä, jolla arvioidaan epävarmuuden merkityksellisyysttä päätöksenteon kannalta. Opasnet-kannan avulla voidaan toteuttaa laajoja VOI analyysejä, koska kaikki kannassa olevat muuttujat ovat valmiiksi oikeassa muodossa sitä varten, eli epävarmojen muuttujien satunnaisotoksina. Analyysi suoritetaan optimoimalla indikaattori-muuttujaa päätösmuuttujan suhteen siten, että analysoitavaa muuttujaa ehdollistetaan eri arvoille. Kaikki tämä voidaan teoriassa tehdä Opasnet-kannassa listaamalla kannassa olevia indikaattoreita, päätösmuttujia ja muita kiinnostuksen kohteena olevia muuttujia. Käytännön työkaluja tätä varten pitää tosin vielä kehittää, jotta järjestelmällisiä VOI analyysejä voidaan alkaa suorittamaan erilaisiiin ympäristöterveyden aiheisiin liittyen.

Opasnet-kannassa olevien muuttujien laadun kehityksen seuraaminen

Kaikki muuttujat, jotka on joskus tallennettu Opasnet-kantaan, säilyvät siellä. Vanhat muuttujat voivat olla hyvin mielenkiintoisia muutamastakin eri syystä:

  • Ajassa tapahtuva muutos muuttujan informatiivisuudessa ja kalibraatiossa voidaan määrittää ja verrata sitä uusimpaan muuttujaa koskevaan informaatioon
  • Ratkaisevan tärkeät informaation palaset, joilla on ollut merkittävä vaikutus informatiivisuuden ja kalibraation kehitykseen voidaan tunnistaa jälkikäteen
  • Suuri joukko muuttujia voidaan arvioida mm. seuraavien kysymysten suhteen:
    • Kuinka paljon työtä vaaditaan muuttujan kehittämiseksi sille tasolle, että sen suorituskyky on riittävä käytännön sovellusten tarpeita varten?
    • Mitkä ovat ratkaisevan tärkeät vaiheet, jonka jälkeen muuttujan suorituskyky kyllääntyy, eli ei enää mainittavasti parane lisäponnistuksista huolimatta?

Katso myös

Noudettu kohteesta ”https://fi.opasnet.org/index.php?title=Opasnet-kanta&oldid=2513”