Lähdekoodi sivulle TCDD-koe S217 ym.

{{tutkimus|moderator=Pauli}}

== Kokeet ==

<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited) 
Sarja numero|S217
Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|19.8.1997
Koe-eläinluvan numero|
Aine|TCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|26.8.1997
Annos|0
Annos|0.03
Annos|0.1
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Koe alkaa|35662
Koe päättyy|35676
Laji|Rotta
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|41
Ikä kokeen alussa (vko)|14(37kpl), 13(4kpl
Luovutusnumero|9721, 9722
Ryhmät ja lkm|0(4kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(4kpl), 100(4kpl)
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|40
Ikä kokeen alussa (vko)|15(22kpl), 14(12kpl), 13(6kpl)
Luovutusnumero|9720, 9721, 9722
Ryhmät ja lkm|0(5kpl), 0.03(5kpl), 0.1(5kpl), 0.3(5kpl), 1(5kpl), 3(5kpl), 10(5kpl), 30(5kpl), 100(0kpl)
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkeissä. 8pv altistuksesta lopetus tutkitaan EROD-induktiota pienillä annoksilla
Toimenpiteet kokeen aikana|Lopetuksessa katsotaan hammasviirut ja thymuksen paino. Näytteeksi maksa ja alaleuka
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD
Näyte2|Thymus
Säilytys|-
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
</t2b>

<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S217b">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S217b
Kuvaileva nimi|EROD-annosvaste (täydennyskoe)
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys| - (tästä kokeesta ei erillistä koesuunnitelmaa)
Koe-eläinluvan numero| -
Aine|TCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|WW ryhmät 1-5 18.5.1998, WW ryhmät 6-9 19.5.1998, LE 2.6.1998
Annos|0
Annos|0.03
Annos|0.1
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Koe alkaa|35930
Koe päättyy|35956
Laji|Rotta
Kanta|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|51
Ikä kokeen alussa (vko)|14(22kpl), 13(29kpl)
Luovutusnumero|9807, 9808
Ryhmät ja lkm|5eläintä/annosteluryhmä
Kanta|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|41
Ikä kokeen alussa (vko)|14(27kpl), 13(14kpl)
Luovutusnumero|9809, 9810
Ryhmät ja lkm|4-5eläintä/annosteluryhmä
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti| -
Toimenpiteet kokeen aikana| -
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte|
</t2b>

<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S226">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S226
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:penta
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero| -
Aine|PeCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|4.11.1997 (WW:t), 25.11.1997 (LE:t)
Annos|0
Annos|0.01
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Annos|300
Koe alkaa|35733
Koe päättyy|35767
Laji|Rotta
Kanta|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|51
Ikä kokeen alussa (vko)|15(31kpl), 14(10kpl), 15(10kpl)(täydennyskoe)
Luovutusnumero|9730, 9731, 9750(täydennyskoe)
Ryhmät ja lkm| -
Kanta|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|47
Ikä kokeen alussa (vko)|15(11kpl), 14(36kpl)
Luovutusnumero|9733, 9734
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini     punn. 0, 3, 6, 8
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte2|Thymus
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>

<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S227">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S227
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:heksa
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero|
Aine|HxCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|9.12.1997 (LE:t), 31.12.1997 (WW:t)
Annos|0
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Annos|300
Annos|1000
Koe alkaa|35768
Koe päättyy|35803
Laji|Rotta
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|46
Ikä kokeen alussa (vko)|16(23kpl), 15(13kpl), 13(10kpl)
Luovutusnumero|9735, 9736, 9738
Ryhmät ja lkm| -
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|48
Ikä kokeen alussa (vko)|15(29kpl), 14(19kpl)
Luovutusnumero|9735, 9736
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini     punn. 0, 3, 6, 8
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte2|Thymus
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>

<t2b index="Kuvaus" unit="-" obs="Tulos" name="Koe S228">
Kirjaimisto|ASCII ISO-8859-1
Tiedostomuoto|TXT sarkainerotettu (Tab-delimited)
Sarja numero|S228
Kuvaileva nimi|"EROD-annosvaste" rakenneaktiivisuus:hepta
Vastuuhenkilö|Matti Viluksela
Koesuunnitelman päiväys|15.10.1997
Koe-eläinluvan numero| -
Aine|HpCDD (µg/kg)
Antotapa|maissiöljyssä 4 ml/kg sondilla suun kautta (i.g.)
Altistuspäivä(pvä0)|30.12.1997 (LE:t), 11.2.1998 (WW:t)
Annos|0
Annos|0.01
Annos|0.3
Annos|1
Annos|3
Annos|10
Annos|30
Annos|100
Annos|300
Annos|1000
Annos|3000
Koe alkaa|35782
Koe päättyy|35846
Laji|Rotta
Kanta1|HW (Han/Wistar (Kuopio))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|60
Ikä kokeen alussa (vko)|16(30kpl), 15(10kpl), 15(20kpl)(täydennyskoe)
Luovutusnumero|9744, 9745, 9750(täydennyskoe)
Ryhmät ja lkm| -
Kanta2|LE (Long-Evans (Turku A/B))
Sukupuoli|Naaras
Lukumäärä|57
Ikä kokeen alussa (vko)|18(6kpl), 16(29kpl), 17(22kpl)
Luovutusnumero|9735, 9737, 9743
Ryhmät ja lkm| -
Häkkityyppi|Ryhmä-RST-häkki
Eläimiä per häkki|n. 5
Totutusaika (vko)|
Altistuspäivän ikä|
Altistajan nimi|
Lopetus TCDDn annosta (pvä)|
Annosteluaika (klo)|
Eläinhuone|
Valorytmi|Valot päällä 7.00 - 19.00
Rehu|R36-jauherehu
Vesi|Vapaasti hanavesi
Lämpötila|21 ± 1 °C
Kosteus|50 ± 10 %
Kokeen idea lyhyesti|Rotat RST-ryhmähäkkeissä. 8pv altistuksesta lopetus. Tutkitaan eropin, thymusatrofian ja hammasviirujen annosvastetta.
Toimenpiteet kokeen aikana|Koe tehdään useassa erässä:6xn.40 eläintä lopetuksessa katsotaan hammaviirut ja thymuksen paino. Lopetus: giljotiini     punn. 0, 3, 6, 8
Tarvittavat reagenssit ja niiden määrät| -
Näytekuvaus|Mitä
Näyte1|Maksa
Säilytys|-80
Määritys|EROD+loppumassa
Näyte2|Thymus
Säilytys|
Määritys|Paino
Näyte3|Alaleuka
Säilytys|Formaliini
Määritys|Histologia
Näyte4|Seerumi x2
Säilytys|-80
Määritys|bil. vara
</t2b>

== Muuttujat ==

<t2b index="Järjestys, Tunniste, Kuvaus, Huomautuksia, Esimerkkiarvoja" unit="-" obs="Puuttuvat" name="Muuttujat">
1|Tunniste|Kokeen tunnistekoodi||S217, S217b, S226, S227 tai S228|ei puuttuvia
2|Nro|Rotan koenumero||1, 2, 3, ...|ei puuttuvia
3|Kanta|Rotan kanta||LE tai WW|ei puuttuvia
4|SP|Rotan sukupuoli|uros tai naaras, vain naaraita|U tai N|ei puuttuvia
5|Aine|Rotalle annettu aine||TCDD, PeCDD, HxCDD tai HpCDD|ei puuttuvia
6|Annos|Annetun aineen määrä|µg/kg, 13 eri annoskokoa: 0 - 3000|0.3|ei puuttuvia
7|Ryhmä|Ruokintaryhmä||1, 2, …, 9|390 kpl, vain tunnisteelle S217b
8|Paino-3|Paino pvä-3|g||132 kpl, kaikki S217 + loput S217b
9|Paino0|Paino pvä0|g||ei puuttuvia
10|Paino3|Paino pvä3|g||51 kpl, tunnisteelta S217b
11|Paino6|Paino pvä6|g||51 kpl, tunnisteelta S217b
12|Paino8|Paino pvä8|g||ei puuttuvia
13|PainoThy|Thymuksen(kateenkorvan) paino|g||ei puuttuvia
14|LivEROD|Liver EROD activity - Maksan EROD aktiivisuus|pmol/mg*min||12 kpl
15|S-T4|Serum T4 Concentration - Seerumin T4(tyroksiini) pitoisuus|nmol/l||179 kpl, tunnisteelta S217 ja S226
16|TootErup|Tooth Eruption - Hampaan puhkeaminen||0, 0.5 tai 1|81 kpl, tunnisteelta S217
17|S-FFA|Serum FFA Concentration - Hampaan FFA pitoisuus|mmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217
18|S-bil|Serum Tot. Bilirubin Concentration - Seerumin bilirubiinin kokonaispitoisuus|µmol/l||81 kpl, tunnisteelta S217
19|S-ASAT|Serum ASAT Activity - Seerumin ASAT aktiivisuus|U/l||81 kpl, tunnisteelta S217
20|MSOITD|Mean severity of incisor tooth defects||0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3 tai T|87 kpl = 6 + kaikki tunnisteelta S217
</t2b>

Muuttujien välisiä yhteyksiä ja muita huomioita:
*Kokeissa S217 ja S217b annettu aine on TCDD, kokeessa S226 PeCDD, kokeessa S227 HxCDD ja kokeessa S228 HpCDD.
*Aineella HpCDD erilaisia annoskokoja on 11, muilla 9 kpl.

== Data ==

{{tuloslinkki}}

Taulukosta ilmenee kokeiden tulokset (ruumiinpaino eri aikoina sekä kateenkorvan paino, maksan EROD-arvo, S-T4, S-FFA, S-bil, S-ASAT ja MSOITD kokeen lopussa).

Voit halutessasi ladata kaiken datan itsellesi käyttäen ilmaista R-ohjelmointikieltä. Asenna tietokoneellesi R-ohjelmisto ja OpasnetUtils-paketti [https://cran.r-project.org/ CRAN:ista], käynnistä R ja aja seuraava koodi:

 library(OpasnetUtils)
 dat <- opbase.data("Op_fi5507", subset = "data") # Page [[TCDD-koe S217 ym.]]

<!-- __OBI_TS:1467017328 -->

== Katso myös == 

{{TCDD-kokeet}}