10K 0 [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,100] 1 1 1 2 0 2,102,90,476,224 0 1 9 9 6 Päivi 22. marta 2009 15:18 Päivi 2. helta 2010 16:35 48,24 1,0,-23,1280,675,17 52427,60621,65535 Arial, 15 0,Model Pohjavesi_noro,2,2,0,1,C:\Documents and Settings\Päivi\Desktop\Pohjavesi_noro.ana Consumption of unboiled water mL Lognormal( , , 757.765 , 566.879 ) 256,400,1 64,36 2,466,258,855,539 19661,65535,65535 Contamination ['Clean','Medium','Contaminated'] 112,216,1 60,12 2,0,-23,1441,800 ['Clean','Medium','Contaminated'] Dose- response pmea 3. syyta 2008 15:02 48,24 256,512,1 48,24 1,0,0,535,265,17 (dose) Dose response Table(Microbe)( Norovirus_2( dose),Rotavirus_( dose),Norovirus_2( dose)) 80,56,1 48,24 2,0,-23,1280,675 dose (dose) Norovirus_2 Exact_beta_poisson_m( 0.040, 0.055, dose ) 1-(1+(Dose/0.422))^(-0.253) Exact_beta_poisson_m( 0.040, 0.055, dose ) 208,48,1 48,24 2,522,357,609,424 dose (alpha,beta,dose) Exact Beta Poisson model low dose approximation 1-exp(-(alpha/(alpha+beta))*dose) 320,80,1 48,58 2,606,76,476,224 alpha,beta,dose (dose) Rotavirus_ Teunis and Havelaar (2000) Risk Analysis 20:511-518 fitted the exact hypergeometric beta poisson model to the data from Ward et al. (1986) Journal of Infectious Diseases 154, 871-880 Exact_beta_poisson_m( 0.167, 0.191, dose ) Exact_beta_poisson_m( 0.167, 0.191, dose ) 208,112,1 48,24 2,585,441,613,302 dose (alpha, beta, dose) Beta_poisson_approxi 1-(1+dose/beta)^-alpha 432,48,1 48,24 alpha,beta,dose Propability for infection 0 88,176,1 48,24 19661,48336,65535 Op_fi1759 Poisson params Table(Microbe,Self)( 0.04,0.055, 0.167,0.191, 0.04,0.055 ) ['alpha','beta'] 208,176,1 48,24 65535,52427,65534 [Self,Microbe] (dose) Dose response HUOM! Kannattaa ehdottomasti välttää parametrien laittamista kaavoihin ja funktioihin. Aina jos mahdollista, niin tehdään vaaleanpunainen solmu syöteparametreille. Näin ne löytyvät ja ovat kritisoitavissa. var alpha:= poisson_params[poisson_params='alpha']; var beta:= poisson_params[poisson_params='beta']; 1-exp(-(alpha/(alpha+beta))*dose) 80,112,1 48,24 2,536,216,603,350 dose Fe filtration Käytetään arviota 1 log removal 1 408,136,1 56,22 2,0,-23,1280,675 2,852,328,416,303,0,MIDM [] [1,1,0,1] Generic QMRA Model Juomaveden mikrobiologinen riskinarviointi 296,64,-1 276,36 1,0,0,1,0,0,1,,0, 2,0,-23,1281,914 Arial Black, 24 Likelyhood of contamination Table(Contamination)( 1,1,1) 256,320,1 60,40 2,0,-23,800,489 2,340,102,416,303,0,MIDM Microbe ['Norovirus','Rotavirus','Murine norovirus'] 112,192,1 48,13 2,0,-23,1281,676 ['Norovirus','Rotavirus','Murine norovirus'] Pathogens in source water unit/l Table(Microbe,Contamination)( triangular(0,0,0),triangular(12.5,100,500),triangular(500,1000,5000), triangular(0,0,0),triangular(12.5,100,500),triangular(500,1000,5000), triangular(0,0,0),triangular(12.5,100,500),triangular(500,1000,5000) ) 112,152,1 48,31 2,0,-23,1280,675 2,705,119,416,303,0,MIDM 2,534,69,446,243,0,MIDM 65535,52427,57888 [Microbe,Contamination] [Contamination,Microbe,1] [0,0,0,0] [Contamination,3,Microbe,1,Sys_localindex('STEP'),1] Pathogen conentration in drinking water 10^(Logten(Op_fi1755*Likelyhood_of_contam)-Op_fi1758) 112,320,1 48,40 2,0,-23,1280,675 2,0,-23,1280,675,0,MEAN [Contamination,Treatment] [Microbe,3,Treatment,1,Contamination,1] Pathogen exposure Op_fi1757*Op_fi1753/1000 112,400,1 48,24 2,0,-23,1280,675 2,0,0,1281,676,0,MIDM [Contamination,Treatment] [Microbe,3,Treatment,1,Contamination,1] Probability of infection Dose_response1(Op_fi1756) 112,512,1 48,24 2,0,-23,1280,675 2,560,90,561,278,0,MEAN [Alias Propability_for_inf2, Formnode Pinf___annual1] 19661,48336,65535 {!40000|Att_graphvaluerange Clipboard_pinf:1,,,,1} {!40000|Att_catlinestyle Graph_primary_valdim:9} [Contamination,Treatment,2,0] 2,D,4,2,0,0,4,0,$,0,"ABBREV",0 100,1,1,1,1,9,2970,2100,15,0 [1,0,0,0] [Microbe,3,Treatment,1,Contamination,1] # infections in the area Tämä laskee seuraavaa: mikä on todennäköisten tautitapausten määrä, kun väestö juo tätä vettä yhden vuorokauden ajan? poisson(Op_fi1759*Population_size) 184,584,1 48,24 2,441,298,727,250 2,0,-23,1280,675,0,MEAN 19661,48336,65535 {!40000|Att_graphindexrange .Possible_values:1,0} {!40000|Att_contlinestyle Graph_cumprob_valdim:1} {!40000|Att_catlinestyle Graph_cumprob_valdim:1} [Contamination,Treatment] 2,D,4,2,0,0,4,0,$,0,"ABBREV",0 100,1,1,1,1,9,2970,2100,15,0 [1,1,0,1] [Microbe,3,Treatment,4,Contamination,3] # people having infection within a year Tarkkaan ottaen tämä laskee seuraavaa: Mikä on odotusarvo sille lukumäärälle ihmisiä, jotka saavat ripulin juomavedestä ainakin kerran yhden vuoden aikana? Tässä siis pidetään merkityksettömänä sitä, jos ripulin saisi uudestaan. (1-(1-Op_fi1759)^365)*15000 80,608,1 48,49 2,102,90,476,224 2,483,175,488,240,0,MEAN [Formnode Pinf_annual1] [Contamination,Treatment,2] 100,1,1,1,1,0,0,0,0,0 [1,0,0,0] [Microbe,3,Treatment,1,Contamination,1] Pinf annual 1 816,656,1 224,20 1,0,0,1,0,0,1,162,0,1 52425,39321,65535 Arial, 11 Op_fi1761 Pinf - annual 1 816,560,1 224,20 1,0,0,1,0,0,1,186,0,1 52425,39321,65535 Arial, 10 Op_fi1759 Te1 Tulokset: Infektion todennäköisyys alueella per henkilö Vuosittainen infektioiden lukumäärä alueella 832,576,-1 236,108 1,0,0,1,0,1,1,,0, 2,0,-23,1281,676 Arial, 19 Te1 Mikrobit: -Norovirus -Rotavirus -Murine norovirus Kontaminaatioskenaariot: -Clean: Puhdas tilanne, ei norovirusta raakavedessä -Medium: Nykytilanne, norovirusta havaittu raakavedessä -Contaminated: Vakava norovirus-kontaminaatio raakavedessä Vedenkäsittelyskenaariot: -UV ja raudanpoisto -UV max 100 % teho -UV normal 80 % teho -UV min 45% teho (lamppujen vaihtoraja) -Kaksi vierekkäistä UV-linjaa 832,232,-1 236,218 1,0,0,1,0,1,1,,0, 2,102,90,476,224 Arial, 19 Total microbial log reduction Table(Treatment)( Fe_filtration+Op_fi1754,Fe_filtration+Op_fi1754*0.8,Fe_filtration+Op_fi1754*0.45,Op_fi1754,Op_fi1754*0.8,Op_fi1754*0.45,Op_fi1754*2) 288,160,1 48,40 2,0,0,1280,675 2,232,242,416,303,0,MIDM 2,0,0,1281,676,0,MIDM [Microbe,Treatment] UV -Norovirus_uv_lr(Fluence) Table(Microbe)( -Norovirus_uv_lr(Fluence),-Rotavirus_uv_lr(Fluence),-Murine_norovirus_lr(Fluence)) 400,192,1 48,24 2,575,118,494,296 2,0,-23,1440,799,0,MIDM [Microbe,Treatment] Treatment ['UV max + Fe filtration','UV normal + Fe filtration','UV minimum + Fe filtration','UV max','UV normal','UV minimum','Double UV'] 288,216,1 48,12 2,0,-23,1441,800 ['UV max + Fe filtration','UV normal + Fe filtration','UV minimum + Fe filtration','UV max','UV normal','UV minimum','Double UV'] UV treatment Päivi 22. marta 2009 15:41 48,24 512,192,1 48,24 1,0,-23,1280,675,17 Fluence Dose mJ. cm 2 79.2 79.2 96,80,1 48,31 2,758,147,336,271 2,0,-23,1440,799,0,MIDM 39321,55707,65535 (fluence) Norovirus UV LR Uvlogred( 0.106, fluence, 0 ) 232,104,1 48,24 2,773,108,410,303 fluence (fluence) Rotavirus_uv_lr Uvlogred( 0.102, fluence, 0 ) 232,40,1 48,24 2,659,283,419,338 fluence (k,fluence,b) UVLogRed -k*fluence-b 224,248,1 48,24 2,558,321,409,277 k,fluence,b (fluence) Murine norovirus LR Uvlogred( 0.132, fluence, 0 ) 232,176,1 48,31 2,676,509,528,283 fluence Population size 15000 296,600,1 48,24 # infections in the area/a Tämä laskee seuraavaa: mikä on todennäköisten tautitapausten määrä, kun väestö juo tätä vettä yhden vuoden ajan? Suurimmat lukemat erittäin kontaminoituneella vedellä ovat tietenkin järjettömiä, koska jos tuollainen epidemia syntyisi, niin * sitä ei vuotta katseltaisi, * mallissa oletetaan, että ripulin voi saada joka päivä uudestaan riippumatta edellisestä päivästä. poisson(Op_fi1759*Population_size*365) 184,640,1 48,24 2,426,345,727,250 2,177,48,651,493,0,MEAN 19661,48336,65535 {!40000|Att_graphindexrange .Possible_values:1,0,0,,,,,0,5000} {!40000|Att_contlinestyle Graph_cumprob_valdim:1} {!40000|Att_catlinestyle Graph_cumprob_valdim:1} [Contamination,Treatment] 2,D,4,2,0,0,4,0,$,0,"ABBREV",0 100,1,1,1,1,9,2970,2100,15,0 [1,1,0,1] [Microbe,1,Contamination,3,Treatment,4,Sys_localindex('POSSIBLE_VALUES'),1] Raakavesi 120,176,-1 92,76 1,0,0,1,0,1,0,,0, 39321,52431,65535 Te3 Vedenpuhdistus 400,176,-1 172,76 1,0,0,1,0,1,0,,0, 39321,52431,65535 Te3 Altistuminen 184,352,-1 156,92 1,0,0,1,0,1,0,,0, 39321,52431,65535 Te3 Terveysvaikutukset 184,568,-1 160,112 1,0,0,1,0,1,0,,0, 39321,52431,65535